Бромодоменсодержащий белок 4

Поделись знанием:
Перейти к: навигация, поиск

An Error has occurred retrieving Wikidata item for infobox Бромодоменсодержащий белок 4 (англ. Bromodomain-containing protein 4, BRD4) — хроматинсвязывающий белок, который у человека кодируется геном BRD4. Он узнаёт и связывается с остатками ацетилированного лизина в составе гистонов и других белков. BRD4 принимает участие в регуляции транскрипции и передаче эпигенетической информации при делении клетки[1]. В 2016 году было установлено, что BRD4 обладает собственной гистонацетилтрансферазной активностью[2].

BRD4 принадлежит к семейству белков BET, содержащих два тандемных бромодомена и экстратерминальный домен. Кроме BRD4, к этому семейству относятся ещё три белка человека: BRD2, BRD3 и BRDT[3].





Распространение и внутриклеточная локализация

РНК BRD4 и белок присутствуют в подавляющем большинстве типов клеток и тканей[4][3].

BRD4 локализован главным образом в ядре клетки, но может присутствовать в и цитоплазме в небольшом количестве[1].

Структура гена и белка

В результате альтернативного сплайсинга формируются две изоформы белка. Более длинная и более распространённая изоформа состоит из 1362 аминокислотных остатков и имеет молекулярную массу около 152 кДа. Биологическую активность BRD4 связывают именно с этой изоформой. Вторая изоформа укорочена с C-конца, состоит из 723 аминокислотных остатков и имеет молекулярную массу 88 кДа. Короткую изоформу удаётся обнаружить гораздо реже, чем длинную, и её функции не известны[3][1].

BRD4 содержит два консервативных бромодомена на N-конце молекулы. Бромодомены состоят из четырёх α-спиралей, соединённых подвижными петлями. Вместе спирали и петли формируют гидрофобный карман, который распознаёт остатки ацетиллизина в белках[5].

C-концевой экстратерминальный домен BRD4 принимает участие в связывании фактора транскрипции P-TEFb[5].

Функции

BRD4 выступает в качестве глобального регулятора транскрипции. Транскрипция существенной доли генов многоклеточных организмов останавливается на стадии ранней элонгации, когда длина синтезированной пре-мРНК составляет около 60 нуклеотидов[6]. Одной из причин такой остановки является последовательное присоединение к транскрипционному комплексу негативных регуляторных факторов DSIF (англ. DRB sensitivity inducing factor) и NELF (англ. negative elongation factor), которые блокируют дальнейшее продвижение РНК-полимеразы II. Повторный запуск транскрипции осуществляется при участии фактора P-TEFb. P-TEFb представляет собой гетеродимер, состоящий из циклинзависимой киназы 9 и её регуляторной субъединицы — циклина T1, T2 или K. P-TEFb фосфорилирует DSIF и NELF и тем самым подавляет их активность. Кроме того, P-TEFb фосфорилирует гептадные повторы в С-концевом домене РНК-полимеразы II по положению Ser-2, что также способствует активной элонгации[5]. За привлечение P-TEFb в транскрипционный комплекс отвечает BRD4, который связывается с околопромоторными областями генов за счёт взаимодействия с остатками ацетиллизина в гистонах[7][8].

В 2016 году было установлено, что BRD4 является гистоацетилтрансферазой[2]. Он ацетилирует остатки лизина в N-концевых фрагментах гистонов 3 и 4, а также остаток Lys-122 в гистоне 3. Ацетилирование последнего остатка оказывает более существенное влияние на дестабилизацию нуклеосомы, потому что он находится в глобулярном C-концевом домене гистона и в непосредственном контакте с ДНК. Известны ещё только две гистоацетилтрансферазы, способные ацетилировать Lys-122 в гистоне 3: p300 и CBP. Гистонацетилтрансферазная активность BRD4 вызывает декомпактизацию хроматина (а следовательно, стимулирует транскрипцию) во многих участках генома, в том числе в районе генов MYC, FOS и AURKB.

Роль в заболеваниях человека

Впервые особая роль BRD4 в заболеваниях человека была описана при анализе редкого типа карциномы, характеризующегося хромосомной транслокацией t(15;19)[9]. При данной транслокации происходит слияние первой половины гена BRD4 и практический всей кодирующей области гена NUT[10]. В результате формируется химерный онкобелок BRD4-NUT, который отвечает за необычно агрессивный характер данной карциномы[11].

Напишите отзыв о статье "Бромодоменсодержащий белок 4"

Примечания

  1. 1 2 3 [www.uniprot.org/uniprot/O60885 BRD4 в базе данных UniProt]. Проверено 11 сентября 2014.
  2. 1 2 Devaiah B. N., Case-Borden C., Gegonne A., Hsu C. H., Chen Q., Meerzaman D., Dey A., Ozato K., Singer D. S. [www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/27159561 BRD4 is a histone acetyltransferase that evicts nucleosomes from chromatin.] (англ.) // Nature structural & molecular biology. — 2016. — DOI:10.1038/nsmb.3228. — PMID 27159561. исправить
  3. 1 2 3 Wu S. Y., Chiang C. M. [www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/17329240 The double bromodomain-containing chromatin adaptor Brd4 and transcriptional regulation.] (англ.) // The Journal of biological chemistry. — 2007. — Vol. 282, no. 18. — P. 13141—13145. — DOI:10.1074/jbc.R700001200. — PMID 17329240. исправить
  4. [www.proteinatlas.org/ENSG00000141867/tissue BRD4 на сайте Human Protein Atlas]. Проверено 11 сентября 2014.
  5. 1 2 3 Shi J., Vakoc C. R. [www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/24905006 The mechanisms behind the therapeutic activity of BET bromodomain inhibition.] (англ.) // Molecular cell. — 2014. — Vol. 54, no. 5. — P. 728—736. — DOI:10.1016/j.molcel.2014.05.016. — PMID 24905006. исправить
  6. Kwak H., Lis J. T. [www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/24050178 Control of transcriptional elongation.] (англ.) // Annual review of genetics. — 2013. — Vol. 47. — P. 483—508. — DOI:10.1146/annurev-genet-110711-155440. — PMID 24050178. исправить
  7. Jang M. K., Mochizuki K., Zhou M., Jeong H. S., Brady J. N., Ozato K. [www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/16109376 The bromodomain protein Brd4 is a positive regulatory component of P-TEFb and stimulates RNA polymerase II-dependent transcription.] (англ.) // Molecular cell. — 2005. — Vol. 19, no. 4. — P. 523—534. — DOI:10.1016/j.molcel.2005.06.027. — PMID 16109376. исправить
  8. Yang Z., Yik J. H., Chen R., He N., Jang M. K., Ozato K., Zhou Q. [www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/16109377 Recruitment of P-TEFb for stimulation of transcriptional elongation by the bromodomain protein Brd4.] (англ.) // Molecular cell. — 2005. — Vol. 19, no. 4. — P. 535—545. — DOI:10.1016/j.molcel.2005.06.029. — PMID 16109377. исправить
  9. French C. A., Miyoshi I., Aster J. C., Kubonishi I., Kroll T. G., Dal Cin P., Vargas S. O., Perez-Atayde A. R., Fletcher J. A. [www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/11733348 BRD4 bromodomain gene rearrangement in aggressive carcinoma with translocation t(15;19).] (англ.) // The American journal of pathology. — 2001. — Vol. 159, no. 6. — P. 1987—1992. — DOI:10.1016/S0002-9440(10)63049-0. — PMID 11733348. исправить
  10. French C. A., Miyoshi I., Kubonishi I., Grier H. E., Perez-Atayde A. R., Fletcher J. A. [www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/12543779 BRD4-NUT fusion oncogene: a novel mechanism in aggressive carcinoma.] (англ.) // Cancer research. — 2003. — Vol. 63, no. 2. — P. 304—307. — PMID 12543779. исправить
  11. French C. A. [www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/22017582 Pathogenesis of NUT midline carcinoma.] (англ.) // Annual review of pathology. — 2012. — Vol. 7. — P. 247—265. — DOI:10.1146/annurev-pathol-011811-132438. — PMID 22017582. исправить

Отрывок, характеризующий Бромодоменсодержащий белок 4

– И жизнь и имущество возьми, ваше величество!
Пьер не чувствовал в эту минуту уже ничего, кроме желания показать, что все ему нипочем и что он всем готов жертвовать. Как упрек ему представлялась его речь с конституционным направлением; он искал случая загладить это. Узнав, что граф Мамонов жертвует полк, Безухов тут же объявил графу Растопчину, что он отдает тысячу человек и их содержание.
Старик Ростов без слез не мог рассказать жене того, что было, и тут же согласился на просьбу Пети и сам поехал записывать его.
На другой день государь уехал. Все собранные дворяне сняли мундиры, опять разместились по домам и клубам и, покряхтывая, отдавали приказания управляющим об ополчении, и удивлялись тому, что они наделали.



Наполеон начал войну с Россией потому, что он не мог не приехать в Дрезден, не мог не отуманиться почестями, не мог не надеть польского мундира, не поддаться предприимчивому впечатлению июньского утра, не мог воздержаться от вспышки гнева в присутствии Куракина и потом Балашева.
Александр отказывался от всех переговоров потому, что он лично чувствовал себя оскорбленным. Барклай де Толли старался наилучшим образом управлять армией для того, чтобы исполнить свой долг и заслужить славу великого полководца. Ростов поскакал в атаку на французов потому, что он не мог удержаться от желания проскакаться по ровному полю. И так точно, вследствие своих личных свойств, привычек, условий и целей, действовали все те неперечислимые лица, участники этой войны. Они боялись, тщеславились, радовались, негодовали, рассуждали, полагая, что они знают то, что они делают, и что делают для себя, а все были непроизвольными орудиями истории и производили скрытую от них, но понятную для нас работу. Такова неизменная судьба всех практических деятелей, и тем не свободнее, чем выше они стоят в людской иерархии.
Теперь деятели 1812 го года давно сошли с своих мест, их личные интересы исчезли бесследно, и одни исторические результаты того времени перед нами.
Но допустим, что должны были люди Европы, под предводительством Наполеона, зайти в глубь России и там погибнуть, и вся противуречащая сама себе, бессмысленная, жестокая деятельность людей – участников этой войны, становится для нас понятною.
Провидение заставляло всех этих людей, стремясь к достижению своих личных целей, содействовать исполнению одного огромного результата, о котором ни один человек (ни Наполеон, ни Александр, ни еще менее кто либо из участников войны) не имел ни малейшего чаяния.
Теперь нам ясно, что было в 1812 м году причиной погибели французской армии. Никто не станет спорить, что причиной погибели французских войск Наполеона было, с одной стороны, вступление их в позднее время без приготовления к зимнему походу в глубь России, а с другой стороны, характер, который приняла война от сожжения русских городов и возбуждения ненависти к врагу в русском народе. Но тогда не только никто не предвидел того (что теперь кажется очевидным), что только этим путем могла погибнуть восьмисоттысячная, лучшая в мире и предводимая лучшим полководцем армия в столкновении с вдвое слабейшей, неопытной и предводимой неопытными полководцами – русской армией; не только никто не предвидел этого, но все усилия со стороны русских были постоянно устремляемы на то, чтобы помешать тому, что одно могло спасти Россию, и со стороны французов, несмотря на опытность и так называемый военный гений Наполеона, были устремлены все усилия к тому, чтобы растянуться в конце лета до Москвы, то есть сделать то самое, что должно было погубить их.
В исторических сочинениях о 1812 м годе авторы французы очень любят говорить о том, как Наполеон чувствовал опасность растяжения своей линии, как он искал сражения, как маршалы его советовали ему остановиться в Смоленске, и приводить другие подобные доводы, доказывающие, что тогда уже будто понята была опасность кампании; а авторы русские еще более любят говорить о том, как с начала кампании существовал план скифской войны заманивания Наполеона в глубь России, и приписывают этот план кто Пфулю, кто какому то французу, кто Толю, кто самому императору Александру, указывая на записки, проекты и письма, в которых действительно находятся намеки на этот образ действий. Но все эти намеки на предвидение того, что случилось, как со стороны французов так и со стороны русских выставляются теперь только потому, что событие оправдало их. Ежели бы событие не совершилось, то намеки эти были бы забыты, как забыты теперь тысячи и миллионы противоположных намеков и предположений, бывших в ходу тогда, но оказавшихся несправедливыми и потому забытых. Об исходе каждого совершающегося события всегда бывает так много предположений, что, чем бы оно ни кончилось, всегда найдутся люди, которые скажут: «Я тогда еще сказал, что это так будет», забывая совсем, что в числе бесчисленных предположений были делаемы и совершенно противоположные.