Гистондеацетилаза 9

Поделись знанием:
Перейти к: навигация, поиск
Гистондеацетилаза 9
Идентификаторы
Символ[www.genenames.org/cgi-bin/gene_symbol_report?hgnc_id=14065 HDAC9] ; HD7; HD7b; HD9; HDAC; HDAC7; HDAC7B; HDAC9B; HDAC9FL; HDRP; MITR
Внешние IDOMIM: [omim.org/entry/606543 606543 ] MGI: [www.informatics.jax.org/searches/accession_report.cgi?id=MGI:1931221 1931221 ] HomoloGene: [www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?cmd=Retrieve&db=homologene&dopt=HomoloGene&list_uids=128578 128578 ] IUPHAR: ChEMBL: [www.ebi.ac.uk/chembldb/index.php/target/inspect/CHEMBL4145 4145] GeneCards: [www.genecards.org/cgi-bin/carddisp.pl?id_type=entrezgene&id=9734 HDAC9 Gene]
номер EC[www.genome.jp/dbget-bin/www_bget?enzyme+3.5.1.98 3.5.1.98]
Ортологи
ВидЧеловекМышь
Entrez[www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=gene&cmd=retrieve&dopt=default&list_uids=9734&rn=1 9734][www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=gene&cmd=retrieve&dopt=default&list_uids=79221&rn=1 79221]
Ensembl[www.ensembl.org/Homo_sapiens/geneview?gene=ENSG00000048052;db=core ENSG00000048052][www.ensembl.org/Mus_musculus/geneview?gene=ENSMUSG00000004698;db=core ENSMUSG00000004698]
UniProt[www.expasy.org/uniprot/Q9UKV0 Q9UKV0][www.expasy.org/uniprot/Q99N13 Q99N13]
RefSeq (мРНК)[www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/viewer.fcgi?val=NM_001204144 NM_001204144][www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/viewer.fcgi?val=NM_001271386 NM_001271386]
RefSeq (белок)[www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/viewer.fcgi?val=NP_001191073 NP_001191073][www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/viewer.fcgi?val=NP_001258315 NP_001258315]
Локус (UCSC)[genome.ucsc.edu/cgi-bin/hgTracks?org=Human&db=hg19&position=chr7:18126572-19042039 Chr 7:
18.13 – 19.04 Mb]
[genome.ucsc.edu/cgi-bin/hgTracks?org=Mouse&db=mm10&position=chr12:34371503-34528889 Chr 12:
34.37 – 34.53 Mb]
Поиск в PubMed[www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/entrez?db=gene&cmd=Link&LinkName=gene_pubmed&from_uid=9734][www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/entrez?db=gene&cmd=Link&LinkName=gene_pubmed&from_uid=79221]

Гистондеацетилаза 9 (англ. Histone deacetylase 9) — фермент, кодируемый у человека геном HDAC9[1][2][3].





Функция

Гистоны играют важнейшую роль в регуляции транскрипции, клеточного цикла и процессов развития. Ацетилирование/деацетилирование гистонов изменяет структуру хромосом и влияет на доступ факторов транскрипции к ДНК. Белок, кодируемый этим геном имеет гомологию последовательности с членами семейства гистондезацетилазы. Этот ген ортологичен генам Xenopus и MITR мыши. Белку MITR недостаёт каталитического домена гистондезацетилазы. Он подавляет активность MEF2 посредством рекрутирования многокомпонентных корепрессорных комплексов, которые включают CtBP и HDAC(ы). Это кодируемый белок может играть роль в кроветворении. Несколько альтернативных вариантов сплайсинга были описаны для этого гена, но в полный мере характер некоторых из них не был определен[3].

Взаимодействия

HDAC9, как было выявлено, взаимодействует с:

См также

Напишите отзыв о статье "Гистондеацетилаза 9"

Примечания

  1. Wang AH, Bertos NR, Vezmar M, Pelletier N, Crosato M, Heng HH, Th'ng J, Han J, Yang XJ (November 1999). «HDAC4, a human histone deacetylase related to yeast HDA1, is a transcriptional corepressor». Mol Cell Biol 19 (11): 7816–27. PMID 10523670.
  2. Sparrow DB, Miska EA, Langley E, Reynaud-Deonauth S, Kotecha S, Towers N, Spohr G, Kouzarides T, Mohun TJ (November 1999). «MEF-2 function is modified by a novel co-repressor, MITR». EMBO J 18 (18): 5085–98. DOI:10.1093/emboj/18.18.5085. PMID 10487760.
  3. 1 2 [www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/entrez?Db=gene&Cmd=ShowDetailView&TermToSearch=9734 Entrez Gene: HDAC9 histone deacetylase 9].
  4. 1 2 Zhang CL, McKinsey TA, Olson EN (October 2002). «Association of class II histone deacetylases with heterochromatin protein 1: potential role for histone methylation in control of muscle differentiation». Mol. Cell. Biol. 22 (20): 7302-12. DOI:10.1128/mcb.22.20.7302-7312.2002. PMID 12242305.
  5. 1 2 3 Petrie K, Guidez F, Howell L, Healy L, Waxman S, Greaves M, Zelent A (May 2003). «The histone deacetylase 9 gene encodes multiple protein isoforms». J. Biol. Chem. 278 (18): 16059-72. DOI:10.1074/jbc.M212935200. PMID 12590135.
  6. Zhou X, Richon VM, Rifkind RA, Marks PA (February 2000). «Identification of a transcriptional repressor related to the noncatalytic domain of histone deacetylases 4 and 5». Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 97 (3): 1056-61. DOI:10.1073/pnas.97.3.1056. PMID 10655483.
  7. Miska EA, Karlsson C, Langley E, Nielsen SJ, Pines J, Kouzarides T (September 1999). «HDAC4 deacetylase associates with and represses the MEF2 transcription factor». EMBO J. 18 (18): 5099-107. DOI:10.1093/emboj/18.18.5099. PMID 10487761.
  8. Lemercier C, Verdel A, Galloo B, Curtet S, Brocard MP, Khochbin S (May 2000). «mHDA1/HDAC5 histone deacetylase interacts with and represses MEF2A transcriptional activity». J. Biol. Chem. 275 (20): 15594-9. DOI:10.1074/jbc.M908437199. PMID 10748098.
  9. Koipally J, Georgopoulos K (June 2002). «Ikaros-CtIP interactions do not require C-terminal binding protein and participate in a deacetylase-independent mode of repression». J. Biol. Chem. 277 (26): 23143-9. DOI:10.1074/jbc.M202079200. PMID 11959865.

Литература

  • Marks PA, Richon VM, Rifkind RA (2000). «Histone deacetylase inhibitors: inducers of differentiation or apoptosis of transformed cells.». J. Natl. Cancer Inst. 92 (15): 1210–6. DOI:10.1093/jnci/92.15.1210. PMID 10922406.
  • Verdin E, Dequiedt F, Kasler HG (2003). «Class II histone deacetylases: versatile regulators.». Trends Genet. 19 (5): 286–93. DOI:10.1016/S0168-9525(03)00073-8. PMID 12711221.
  • (1999) «Toward a complete human genome sequence.». Genome Res. 8 (11): 1097–108. DOI:10.1101/gr.8.11.1097. PMID 9847074.
  • Nagase T, Ishikawa K, Suyama M, Kikuno R, Miyajima N, Tanaka A, Kotani H, Nomura N, Ohara O (1999). «Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. XI. The complete sequences of 100 new cDNA clones from brain which code for large proteins in vitro.». DNA Res. 5 (5): 277–86. DOI:10.1093/dnares/5.5.277. PMID 9872452.
  • Miska EA, Karlsson C, Langley E, Nielsen SJ, Pines J, Kouzarides T (1999). «HDAC4 deacetylase associates with and represses the MEF2 transcription factor.». EMBO J. 18 (18): 5099–107. DOI:10.1093/emboj/18.18.5099. PMID 10487761.
  • Zhou X, Richon VM, Rifkind RA, Marks PA (2000). «Identification of a transcriptional repressor related to the noncatalytic domain of histone deacetylases 4 and 5.». Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 97 (3): 1056–61. DOI:10.1073/pnas.97.3.1056. PMID 10655483.
  • Youn HD, Grozinger CM, Liu JO (2000). «Calcium regulates transcriptional repression of myocyte enhancer factor 2 by histone deacetylase 4.». J. Biol. Chem. 275 (29): 22563–7. DOI:10.1074/jbc.C000304200. PMID 10825153.
  • Zhang CL, McKinsey TA, Lu JR, Olson EN (2001). «Association of COOH-terminal-binding protein (CtBP) and MEF2-interacting transcription repressor (MITR) contributes to transcriptional repression of the MEF2 transcription factor.». J. Biol. Chem. 276 (1): 35–9. DOI:10.1074/jbc.M007364200. PMID 11022042.
  • Fischle W, Dequiedt F, Fillion M, Hendzel MJ, Voelter W, Verdin E (2001). «Human HDAC7 histone deacetylase activity is associated with HDAC3 in vivo.». J. Biol. Chem. 276 (38): 35826–35. DOI:10.1074/jbc.M104935200. PMID 11466315.
  • Zhou X, Marks PA, Rifkind RA, Richon VM (2001). «Cloning and characterization of a histone deacetylase, HDAC9.». Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 98 (19): 10572–7. DOI:10.1073/pnas.191375098. PMID 11535832.
  • Koipally J, Georgopoulos K (2002). «Ikaros-CtIP interactions do not require C-terminal binding protein and participate in a deacetylase-independent mode of repression.». J. Biol. Chem. 277 (26): 23143–9. DOI:10.1074/jbc.M202079200. PMID 11959865.
  • Kirsh O, Seeler JS, Pichler A, Gast A, Müller S, Miska E, Mathieu M, Harel-Bellan A, Kouzarides T, Melchior F, Dejean A (2002). «The SUMO E3 ligase RanBP2 promotes modification of the HDAC4 deacetylase.». EMBO J. 21 (11): 2682–91. DOI:10.1093/emboj/21.11.2682. PMID 12032081.
  • Mahlknecht U, Schnittger S, Will J, Cicek N, Hoelzer D (2002). «Chromosomal organization and localization of the human histone deacetylase 9 gene (HDAC9).». Biochem. Biophys. Res. Commun. 293 (1): 182–91. DOI:10.1016/S0006-291X(02)00193-6. PMID 12054582.
  • Zhang CL, McKinsey TA, Olson EN (2002). «Association of class II histone deacetylases with heterochromatin protein 1: potential role for histone methylation in control of muscle differentiation.». Mol. Cell. Biol. 22 (20): 7302–12. DOI:10.1128/MCB.22.20.7302-7312.2002. PMID 12242305.
  • Hoogeveen AT, Rossetti S, Stoyanova V, Schonkeren J, Fenaroli A, Schiaffonati L, van Unen L, Sacchi N (2002). «The transcriptional corepressor MTG16a contains a novel nucleolar targeting sequence deranged in t (16; 21)-positive myeloid malignancies.». Oncogene 21 (43): 6703–12. DOI:10.1038/sj.onc.1205882. PMID 12242670.
  • Petrie K, Guidez F, Howell L, Healy L, Waxman S, Greaves M, Zelent A (2003). «The histone deacetylase 9 gene encodes multiple protein isoforms.». J. Biol. Chem. 278 (18): 16059–72. DOI:10.1074/jbc.M212935200. PMID 12590135.

Ссылки

Отрывок, характеризующий Гистондеацетилаза 9

– Я имею удовольствие быть знакомым, ежели графиня помнит меня, – сказал князь Андрей с учтивым и низким поклоном, совершенно противоречащим замечаниям Перонской о его грубости, подходя к Наташе, и занося руку, чтобы обнять ее талию еще прежде, чем он договорил приглашение на танец. Он предложил тур вальса. То замирающее выражение лица Наташи, готовое на отчаяние и на восторг, вдруг осветилось счастливой, благодарной, детской улыбкой.
«Давно я ждала тебя», как будто сказала эта испуганная и счастливая девочка, своей проявившейся из за готовых слез улыбкой, поднимая свою руку на плечо князя Андрея. Они были вторая пара, вошедшая в круг. Князь Андрей был одним из лучших танцоров своего времени. Наташа танцовала превосходно. Ножки ее в бальных атласных башмачках быстро, легко и независимо от нее делали свое дело, а лицо ее сияло восторгом счастия. Ее оголенные шея и руки были худы и некрасивы. В сравнении с плечами Элен, ее плечи были худы, грудь неопределенна, руки тонки; но на Элен был уже как будто лак от всех тысяч взглядов, скользивших по ее телу, а Наташа казалась девочкой, которую в первый раз оголили, и которой бы очень стыдно это было, ежели бы ее не уверили, что это так необходимо надо.
Князь Андрей любил танцовать, и желая поскорее отделаться от политических и умных разговоров, с которыми все обращались к нему, и желая поскорее разорвать этот досадный ему круг смущения, образовавшегося от присутствия государя, пошел танцовать и выбрал Наташу, потому что на нее указал ему Пьер и потому, что она первая из хорошеньких женщин попала ему на глаза; но едва он обнял этот тонкий, подвижной стан, и она зашевелилась так близко от него и улыбнулась так близко ему, вино ее прелести ударило ему в голову: он почувствовал себя ожившим и помолодевшим, когда, переводя дыханье и оставив ее, остановился и стал глядеть на танцующих.


После князя Андрея к Наташе подошел Борис, приглашая ее на танцы, подошел и тот танцор адъютант, начавший бал, и еще молодые люди, и Наташа, передавая своих излишних кавалеров Соне, счастливая и раскрасневшаяся, не переставала танцовать целый вечер. Она ничего не заметила и не видала из того, что занимало всех на этом бале. Она не только не заметила, как государь долго говорил с французским посланником, как он особенно милостиво говорил с такой то дамой, как принц такой то и такой то сделали и сказали то то, как Элен имела большой успех и удостоилась особенного внимания такого то; она не видала даже государя и заметила, что он уехал только потому, что после его отъезда бал более оживился. Один из веселых котильонов, перед ужином, князь Андрей опять танцовал с Наташей. Он напомнил ей о их первом свиданьи в отрадненской аллее и о том, как она не могла заснуть в лунную ночь, и как он невольно слышал ее. Наташа покраснела при этом напоминании и старалась оправдаться, как будто было что то стыдное в том чувстве, в котором невольно подслушал ее князь Андрей.
Князь Андрей, как все люди, выросшие в свете, любил встречать в свете то, что не имело на себе общего светского отпечатка. И такова была Наташа, с ее удивлением, радостью и робостью и даже ошибками во французском языке. Он особенно нежно и бережно обращался и говорил с нею. Сидя подле нее, разговаривая с ней о самых простых и ничтожных предметах, князь Андрей любовался на радостный блеск ее глаз и улыбки, относившейся не к говоренным речам, а к ее внутреннему счастию. В то время, как Наташу выбирали и она с улыбкой вставала и танцовала по зале, князь Андрей любовался в особенности на ее робкую грацию. В середине котильона Наташа, окончив фигуру, еще тяжело дыша, подходила к своему месту. Новый кавалер опять пригласил ее. Она устала и запыхалась, и видимо подумала отказаться, но тотчас опять весело подняла руку на плечо кавалера и улыбнулась князю Андрею.
«Я бы рада была отдохнуть и посидеть с вами, я устала; но вы видите, как меня выбирают, и я этому рада, и я счастлива, и я всех люблю, и мы с вами всё это понимаем», и еще многое и многое сказала эта улыбка. Когда кавалер оставил ее, Наташа побежала через залу, чтобы взять двух дам для фигур.
«Ежели она подойдет прежде к своей кузине, а потом к другой даме, то она будет моей женой», сказал совершенно неожиданно сам себе князь Андрей, глядя на нее. Она подошла прежде к кузине.
«Какой вздор иногда приходит в голову! подумал князь Андрей; но верно только то, что эта девушка так мила, так особенна, что она не протанцует здесь месяца и выйдет замуж… Это здесь редкость», думал он, когда Наташа, поправляя откинувшуюся у корсажа розу, усаживалась подле него.
В конце котильона старый граф подошел в своем синем фраке к танцующим. Он пригласил к себе князя Андрея и спросил у дочери, весело ли ей? Наташа не ответила и только улыбнулась такой улыбкой, которая с упреком говорила: «как можно было спрашивать об этом?»
– Так весело, как никогда в жизни! – сказала она, и князь Андрей заметил, как быстро поднялись было ее худые руки, чтобы обнять отца и тотчас же опустились. Наташа была так счастлива, как никогда еще в жизни. Она была на той высшей ступени счастия, когда человек делается вполне доверчив и не верит в возможность зла, несчастия и горя.

Пьер на этом бале в первый раз почувствовал себя оскорбленным тем положением, которое занимала его жена в высших сферах. Он был угрюм и рассеян. Поперек лба его была широкая складка, и он, стоя у окна, смотрел через очки, никого не видя.
Наташа, направляясь к ужину, прошла мимо его.
Мрачное, несчастное лицо Пьера поразило ее. Она остановилась против него. Ей хотелось помочь ему, передать ему излишек своего счастия.
– Как весело, граф, – сказала она, – не правда ли?
Пьер рассеянно улыбнулся, очевидно не понимая того, что ему говорили.
– Да, я очень рад, – сказал он.
«Как могут они быть недовольны чем то, думала Наташа. Особенно такой хороший, как этот Безухов?» На глаза Наташи все бывшие на бале были одинаково добрые, милые, прекрасные люди, любящие друг друга: никто не мог обидеть друг друга, и потому все должны были быть счастливы.


На другой день князь Андрей вспомнил вчерашний бал, но не на долго остановился на нем мыслями. «Да, очень блестящий был бал. И еще… да, Ростова очень мила. Что то в ней есть свежее, особенное, не петербургское, отличающее ее». Вот всё, что он думал о вчерашнем бале, и напившись чаю, сел за работу.
Но от усталости или бессонницы (день был нехороший для занятий, и князь Андрей ничего не мог делать) он всё критиковал сам свою работу, как это часто с ним бывало, и рад был, когда услыхал, что кто то приехал.
Приехавший был Бицкий, служивший в различных комиссиях, бывавший во всех обществах Петербурга, страстный поклонник новых идей и Сперанского и озабоченный вестовщик Петербурга, один из тех людей, которые выбирают направление как платье – по моде, но которые по этому то кажутся самыми горячими партизанами направлений. Он озабоченно, едва успев снять шляпу, вбежал к князю Андрею и тотчас же начал говорить. Он только что узнал подробности заседания государственного совета нынешнего утра, открытого государем, и с восторгом рассказывал о том. Речь государя была необычайна. Это была одна из тех речей, которые произносятся только конституционными монархами. «Государь прямо сказал, что совет и сенат суть государственные сословия ; он сказал, что правление должно иметь основанием не произвол, а твердые начала . Государь сказал, что финансы должны быть преобразованы и отчеты быть публичны», рассказывал Бицкий, ударяя на известные слова и значительно раскрывая глаза.