ДНК-фотолиаза
 | |
| Идентификаторы | |
|---|---|
| Шифр КФ |
[www.chem.qmul.ac.uk/iubmb/enzyme/EC4/1/99/3.html 4.1.99.3] |
| Номер CAS |
[www.chemnet.com/cas/supplier.cgi?exact=dict&terms=37290-70-3 37290-70-3] |
| Базы ферментов | |
| IntEnz |
[www.ebi.ac.uk/intenz/query?cmd=SearchEC&ec=4.1.99.3 IntEnz view] |
| BRENDA |
[www.brenda-enzymes.org/php/result_flat.php4?ecno=4.1.99.3 BRENDA entry] |
| ExPASy |
[www.expasy.org/enzyme/4.1.99.3 NiceZyme view] |
| MetaCyc |
[biocyc.org/META/substring-search?type=NIL&object=4.1.99.3 metabolic pathway] |
| KEGG |
[www.genome.ad.jp/dbget-bin/www_bget?enzyme+4.1.99.3 KEGG entry] |
| PRIAM |
[priam.prabi.fr/cgi-bin/PRIAM_profiles_CurrentRelease.pl?EC=4.1.99.3 profile] |
| PDB structures |
[www.rcsb.org/pdb/search/smartSubquery.do?smartSearchSubtype=EnzymeClassificationQuery&Enzyme_Classification=4.1.99.3 RCSB PDB] [www.ebi.ac.uk/pdbe-srv/PDBeXplore/enzyme/?ec=4.1.99.3 PDBe] [www.ebi.ac.uk/thornton-srv/databases/cgi-bin/enzymes/GetPage.pl?ec_number=4.1.99.3 PDBsum] |
| Gene Ontology |
[amigo.geneontology.org/cgi-bin/amigo/go.cgi?query=GO:0003904&view=details AmiGO] • [www.ebi.ac.uk/ego/DisplayGoTerm?id=GO:0003904&format=normal EGO] |
| Поиск | |
| PMC |
[www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=pubmed&term=4.1.99.3%5BEC/RN%20Number%5D%20AND%20pubmed%20pmc%20local%5Bsb%5D статьи] |
| PubMed |
[www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=pubmed&term=4.1.99.3%5BEC/RN%20Number%5D статьи] |
| NCBI |
[www.ncbi.nlm.nih.gov/protein?term=4.1.99.3%5BEC/RN%20Number%5D NCBI proteins] |
| CAS |
[tools.wmflabs.org/magnustools/cas.php?language=en&cas=37290-70-3 37290-70-3] |
ДНК-фотолиáза (от греч. φωτος — свет и греч. λύνω — ослаблять, развязывать, шифр КФ [enzyme.expasy.org/EC/4.1.99.3 4.1.99.3]) — один из ферментов репарации ДНК, активация которого происходит под действием видимого света[1]. ДНК-фотолиаза удаляет фотопродукты и пиримидин-пиримидиновые димеры, образующиеся в молекуле ДНК под действием коротковолнового УФ-излучения. Процесс, в котором участвует фермент, называется фотореактивацией. Такие фотореактивирующие ферменты имеются у бактерий и низших эукариотических организмов, но в клетках млекопитающих они не обнаружены.
Строение
ДНК-фотолиаза кишечной палочки (Escherichia Coli) имеет молекулярную массу 54 кДа. В качестве кофактора, как и у всех фотолиаз выступает ФАД и дополнительный хромофор в качестве светособирающей антенны. Фермент действует путём переноса электронов, в которой восстановленный ФАДН- активируется световой энергией и действует в качестве донора электронов, необходимого для того, чтобы разорвать пиримидиновый димер[2].
Механизм действия
При облучении ДНК ультрафиолетовым светом в ней образуются либо циклобутановые димеры между соседними пиримидиновыми основаниями, либо пиримидиновые фотопродукты, такие как 6,4-PP. Такие соединения блокируют репликацию ДНК, и для сохранения жизнеспособности клетки их необходимо удалить. Один из способов удаления пиримидиновых димеров состоит в ферментативном превращении их в мономеры при освещении видимым светом в диапазоне длин волн 300—600 нм. ДНК-фотолиаза образует стабильный комплекс с пиримидиновым димером и, используя энергию поглощённого им света, разрушает димер без разрыва цепей ДНК.
Нахождение в природе
Фотолиазы были найдены у прокариот, эукариот (простейшие, грибки (дрожжи) и некоторые виды насекомых и высших животных) и архей. У человека как и у многих высших животных они отсутствуют.
Напишите отзыв о статье "ДНК-фотолиаза"
Примечания
- ↑ Thiagarajan V., Byrdin M., Eker A. P. M., Muller P., Brettel K. Kinetics of cyclobutane thymine dimer splitting by DNA photolyase directly monitored in the UV // Proceedings of the National Academy of Sciences. — 2011. — Vol. 108. — P. 9402-9407. — ISSN [www.sigla.ru/table.jsp?f=8&t=3&v0=0027-8424&f=1003&t=1&v1=&f=4&t=2&v2=&f=21&t=3&v3=&f=1016&t=3&v4=&f=1016&t=3&v5=&bf=4&b=&d=0&ys=&ye=&lng=&ft=&mt=&dt=&vol=&pt=&iss=&ps=&pe=&tr=&tro=&cc=UNION&i=1&v=tagged&s=0&ss=0&st=0&i18n=ru&rlf=&psz=20&bs=20&ce=hJfuypee8JzzufeGmImYYIpZKRJeeOeeWGJIZRrRRrdmtdeee88NJJJJpeeefTJ3peKJJ3UWWPtzzzzzzzzzzzzzzzzzbzzvzzpy5zzjzzzzzzzzzzzzzzzzzzzzzzzzzzzzzzzztzzzzzzzbzzzzzzzzzzzzzzzzzzzzzzzzzzzvzzzzzzyeyTjkDnyHzTuueKZePz9decyzzLzzzL*.c8.NzrGJJvufeeeeeJheeyzjeeeeJh*peeeeKJJJJJJJJJJmjHvOJJJJJJJJJfeeeieeeeSJJJJJSJJJ3TeIJJJJ3..E.UEAcyhxD.eeeeeuzzzLJJJJ5.e8JJJheeeeeeeeeeeeyeeK3JJJJJJJJ*s7defeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeSJJJJJJJJZIJJzzz1..6LJJJJJJtJJZ4....EK*&debug=false 0027-8424]. — DOI:10.1073/pnas.1101026108.
- ↑ Sancar A. [www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/12797829 Structure and function of DNA photolyase and cryptochrome blue-light photoreceptors.] (англ.) // Chemical reviews. — 2003. — Vol. 103, no. 6. — P. 2203—2237. — DOI:10.1021/cr0204348. — PMID 12797829.
Отрывок, характеризующий ДНК-фотолиаза
– Dieul mon Dieu! [Боже! мой Боже!] – страшным шопотом проговорила Анна Павловна.– Comment, M. Pierre, vous trouvez que l'assassinat est grandeur d'ame, [Как, мсье Пьер, вы видите в убийстве величие души,] – сказала маленькая княгиня, улыбаясь и придвигая к себе работу.
– Ah! Oh! – сказали разные голоса.
– Capital! [Превосходно!] – по английски сказал князь Ипполит и принялся бить себя ладонью по коленке.
Виконт только пожал плечами. Пьер торжественно посмотрел поверх очков на слушателей.
– Я потому так говорю, – продолжал он с отчаянностью, – что Бурбоны бежали от революции, предоставив народ анархии; а один Наполеон умел понять революцию, победить ее, и потому для общего блага он не мог остановиться перед жизнью одного человека.
– Не хотите ли перейти к тому столу? – сказала Анна Павловна.
Но Пьер, не отвечая, продолжал свою речь.
– Нет, – говорил он, все более и более одушевляясь, – Наполеон велик, потому что он стал выше революции, подавил ее злоупотребления, удержав всё хорошее – и равенство граждан, и свободу слова и печати – и только потому приобрел власть.
– Да, ежели бы он, взяв власть, не пользуясь ею для убийства, отдал бы ее законному королю, – сказал виконт, – тогда бы я назвал его великим человеком.
– Он бы не мог этого сделать. Народ отдал ему власть только затем, чтоб он избавил его от Бурбонов, и потому, что народ видел в нем великого человека. Революция была великое дело, – продолжал мсье Пьер, выказывая этим отчаянным и вызывающим вводным предложением свою великую молодость и желание всё полнее высказать.
– Революция и цареубийство великое дело?…После этого… да не хотите ли перейти к тому столу? – повторила Анна Павловна.
– Contrat social, [Общественный договор,] – с кроткой улыбкой сказал виконт.
– Я не говорю про цареубийство. Я говорю про идеи.
– Да, идеи грабежа, убийства и цареубийства, – опять перебил иронический голос.
– Это были крайности, разумеется, но не в них всё значение, а значение в правах человека, в эманципации от предрассудков, в равенстве граждан; и все эти идеи Наполеон удержал во всей их силе.
– Свобода и равенство, – презрительно сказал виконт, как будто решившийся, наконец, серьезно доказать этому юноше всю глупость его речей, – всё громкие слова, которые уже давно компрометировались. Кто же не любит свободы и равенства? Еще Спаситель наш проповедывал свободу и равенство. Разве после революции люди стали счастливее? Напротив. Mы хотели свободы, а Бонапарте уничтожил ее.
