Интегрин альфа-9

Поделись знанием:
Перейти к: навигация, поиск
Интегрин альфа-9
Идентификаторы
Символ[www.genenames.org/cgi-bin/gene_symbol_report?hgnc_id=6145 ITGA9] ; ALPHA-RLC; ITGA4L; RLC
Внешние IDOMIM: [omim.org/entry/603963 603963 ] MGI: [www.informatics.jax.org/searches/accession_report.cgi?id=MGI:104756 104756 ] HomoloGene: [www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?cmd=Retrieve&db=homologene&dopt=HomoloGene&list_uids=1664 1664 ] ChEMBL: [www.ebi.ac.uk/chembldb/index.php/target/inspect/CHEMBL3170 3170] GeneCards: [www.genecards.org/cgi-bin/carddisp.pl?id_type=entrezgene&id=3680 ITGA9 Gene]
Профиль экспрессии РНК
[biogps.org/gene/3680/ Больше информации]
Ортологи
ВидЧеловекМышь
Entrez[www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=gene&cmd=retrieve&dopt=default&list_uids=3680&rn=1 3680][www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=gene&cmd=retrieve&dopt=default&list_uids=104099&rn=1 104099]
Ensembl[www.ensembl.org/Homo_sapiens/geneview?gene=ENSG00000144668;db=core ENSG00000144668][www.ensembl.org/Mus_musculus/geneview?gene=ENSMUSG00000039115;db=core ENSMUSG00000039115]
UniProt[www.expasy.org/uniprot/Q13797 Q13797][www.expasy.org/uniprot/B8JK39 B8JK39]
RefSeq (мРНК)[www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/viewer.fcgi?val=NM_002207 NM_002207][www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/viewer.fcgi?val=NM_001113514 NM_001113514]
RefSeq (белок)[www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/viewer.fcgi?val=NP_002198 NP_002198][www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/viewer.fcgi?val=NP_001106986 NP_001106986]
Локус (UCSC)[genome.ucsc.edu/cgi-bin/hgTracks?org=Human&db=hg19&position=chr3:37493606-37865005 Chr 3:
37.49 – 37.87 Mb]
[genome.ucsc.edu/cgi-bin/hgTracks?org=Mouse&db=mm10&position=chr9:118606690-118901003 Chr 9:
118.61 – 118.9 Mb]
Поиск в PubMed[www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/entrez?db=gene&cmd=Link&LinkName=gene_pubmed&from_uid=3680][www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/entrez?db=gene&cmd=Link&LinkName=gene_pubmed&from_uid=104099]
Интегрин альфа-9 (α9) — мембранный белок, гликопротеин из надсемейства интегринов, продукт гена ITGA9, альфа-субъединица интегрина α9β1.



Функции

Интегрин альфа-9/бета-1 (α9β1) является рецептором для VCAM1, цитотактина и остеопонтина. Распознаёт аминокислотную последовательность A-E-I-D-G-I-E-L в цитотактине.[1] Вместе с интегринами αvβ3, αvβ6, α8β1 and α2β1 является рецептором нейтрофилов, обеспечивающим их миграцию, опосредованную VCAM-1 и тенасцином-C эндотелиальных клеток во время воспалительной реакции. [2]

Структура

Интегрин альфа-9 — крупный белок, состоит из 1006 аминокислот, молекулярная масса белковой части — 114,5 кДа. N-концевой участок (952 аминокислоты) является внеклеточным, далее расположен единственный трансмембранный фрагмент и внутриклеточный фрагмент (33 аминокислоты). Внеклеточный фрагмент включает 7 FG-GAP-повторов и от 1 до 11 участков N-гликозилирования. Цитозольный участок включает GFFKR-мотив.

В процессе ограниченного протеолиза внутримолекулярная связь гидролизуется и образуются тяжёлая и лёгкая цепи, связанные дисульфидной связью.

Тканевая специфичность

Интегрин α9β1 экспрессирован в эпителии воздушных путей, в базальном слое сквамозного эпителия, на гладкомышечных клетках, клетках скелетных мышц и гепатоцитах. Высокий уровень экспрессии в эмбриональных лёгких и в опухолевых клетках лёгких.

См. также

Напишите отзыв о статье "Интегрин альфа-9"

Примечания

  1. [www.uniprot.org/uniprot/Q13797 Uniprot database entry for ITGA9 (accession number Q13797)]
  2. Taooka Y, Chen J, Yednock T, Sheppard D (April 1999). «The integrin alpha9beta1 mediates adhesion to activated endothelial cells and transendothelial neutrophil migration through interaction with vascular cell adhesion molecule-1». J. Cell Biol. 145 (2): 413–20. PMID 10209034.

Библиография

  • Yokasaki Y, Sheppard D (May 2000). «Mapping of the cryptic integrin-binding site in osteopontin suggests a new mechanism by which thrombin can regulate inflammation and tissue repair». Trends Cardiovasc. Med. 10 (4): 155–9. PMID 11239795.
  • Evans JP (2001). «Fertilin beta and other ADAMs as integrin ligands: insights into cell adhesion and fertilization.». Bioessays 23 (7): 628–39. DOI:10.1002/bies.1088. PMID 11462216.
  • Yamakawa K, Takahashi T, Horio Y, et al. (1993). «Frequent homozygous deletions in lung cancer cell lines detected by a DNA marker located at 3p21.3-p22.». Oncogene 8 (2): 327–30. PMID 8381220.
  • Yokosaki Y, Monis H, Chen J, Sheppard D (1996). «Differential effects of the integrins alpha9beta1, alphavbeta3, and alphavbeta6 on cell proliferative responses to tenascin. Roles of the beta subunit extracellular and cytoplasmic domains.». J. Biol. Chem. 271 (39): 24144–50. DOI:10.1074/jbc.271.39.24144. PMID 8798654.
  • Yokosaki Y, Matsuura N, Sasaki T, et al. (2000). «The integrin alpha(9)beta(1) binds to a novel recognition sequence (SVVYGLR) in the thrombin-cleaved amino-terminal fragment of osteopontin.». J. Biol. Chem. 274 (51): 36328–34. DOI:10.1074/jbc.274.51.36328. PMID 10593924.
  • Young BA, Taooka Y, Liu S, et al. (2002). «The cytoplasmic domain of the integrin alpha9 subunit requires the adaptor protein paxillin to inhibit cell spreading but promotes cell migration in a paxillin-independent manner.». Mol. Biol. Cell 12 (10): 3214–25. PMID 11598204.
  • Eto K, Huet C, Tarui T, et al. (2002). «Functional classification of ADAMs based on a conserved motif for binding to integrin alpha 9beta 1: implications for sperm-egg binding and other cell interactions.». J. Biol. Chem. 277 (20): 17804–10. DOI:10.1074/jbc.M200086200. PMID 11882657.
  • Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Generation and initial analysis of more than 15,000 full-length human and mouse cDNA sequences.». Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 99 (26): 16899–903. DOI:10.1073/pnas.242603899. PMID 12477932.
  • Majumdar M, Tarui T, Shi B, et al. (2004). «Plasmin-induced migration requires signaling through protease-activated receptor 1 and integrin alpha(9)beta(1).». J. Biol. Chem. 279 (36): 37528–34. DOI:10.1074/jbc.M401372200. PMID 15247268.
  • Chen C, Young BA, Coleman CS, et al. (2004). «Spermidine/spermine N1-acetyltransferase specifically binds to the integrin alpha9 subunit cytoplasmic domain and enhances cell migration.». J. Cell Biol. 167 (1): 161–70. DOI:10.1083/jcb.200312166. PMID 15479742.
  • Vlahakis NE, Young BA, Atakilit A, Sheppard D (2005). «The lymphangiogenic vascular endothelial growth factors VEGF-C and -D are ligands for the integrin alpha9beta1.». J. Biol. Chem. 280 (6): 4544–52. DOI:10.1074/jbc.M412816200. PMID 15590642.
  • Yokosaki Y, Tanaka K, Higashikawa F, et al. (2005). «Distinct structural requirements for binding of the integrins alphavbeta6, alphavbeta3, alphavbeta5, alpha5beta1 and alpha9beta1 to osteopontin.». Matrix Biol. 24 (6): 418–27. DOI:10.1016/j.matbio.2005.05.005. PMID 16005200.
  • Gulubova M, Vlaykova T (2006). «Immunohistochemical assessment of fibronectin and tenascin and their integrin receptors alpha5beta1 and alpha9beta1 in gastric and colorectal cancers with lymph node and liver metastases.». Acta Histochem. 108 (1): 25–35. DOI:10.1016/j.acthis.2005.12.001. PMID 16430945.

Ссылки

  • [humbio.ru/Humbio/genexp/x00692a9.htm Интегрины: введение]

Отрывок, характеризующий Интегрин альфа-9

– Борис! – сказала она сыну и улыбнулась, – я пройду к графу, к дяде, а ты поди к Пьеру, mon ami, покаместь, да не забудь передать ему приглашение от Ростовых. Они зовут его обедать. Я думаю, он не поедет? – обратилась она к князю.
– Напротив, – сказал князь, видимо сделавшийся не в духе. – Je serais tres content si vous me debarrassez de ce jeune homme… [Я был бы очень рад, если бы вы меня избавили от этого молодого человека…] Сидит тут. Граф ни разу не спросил про него.
Он пожал плечами. Официант повел молодого человека вниз и вверх по другой лестнице к Петру Кирилловичу.


Пьер так и не успел выбрать себе карьеры в Петербурге и, действительно, был выслан в Москву за буйство. История, которую рассказывали у графа Ростова, была справедлива. Пьер участвовал в связываньи квартального с медведем. Он приехал несколько дней тому назад и остановился, как всегда, в доме своего отца. Хотя он и предполагал, что история его уже известна в Москве, и что дамы, окружающие его отца, всегда недоброжелательные к нему, воспользуются этим случаем, чтобы раздражить графа, он всё таки в день приезда пошел на половину отца. Войдя в гостиную, обычное местопребывание княжен, он поздоровался с дамами, сидевшими за пяльцами и за книгой, которую вслух читала одна из них. Их было три. Старшая, чистоплотная, с длинною талией, строгая девица, та самая, которая выходила к Анне Михайловне, читала; младшие, обе румяные и хорошенькие, отличавшиеся друг от друга только тем, что у одной была родинка над губой, очень красившая ее, шили в пяльцах. Пьер был встречен как мертвец или зачумленный. Старшая княжна прервала чтение и молча посмотрела на него испуганными глазами; младшая, без родинки, приняла точно такое же выражение; самая меньшая, с родинкой, веселого и смешливого характера, нагнулась к пяльцам, чтобы скрыть улыбку, вызванную, вероятно, предстоящею сценой, забавность которой она предвидела. Она притянула вниз шерстинку и нагнулась, будто разбирая узоры и едва удерживаясь от смеха.
– Bonjour, ma cousine, – сказал Пьер. – Vous ne me гесоnnaissez pas? [Здравствуйте, кузина. Вы меня не узнаете?]
– Я слишком хорошо вас узнаю, слишком хорошо.
– Как здоровье графа? Могу я видеть его? – спросил Пьер неловко, как всегда, но не смущаясь.
– Граф страдает и физически и нравственно, и, кажется, вы позаботились о том, чтобы причинить ему побольше нравственных страданий.
– Могу я видеть графа? – повторил Пьер.
– Гм!.. Ежели вы хотите убить его, совсем убить, то можете видеть. Ольга, поди посмотри, готов ли бульон для дяденьки, скоро время, – прибавила она, показывая этим Пьеру, что они заняты и заняты успокоиваньем его отца, тогда как он, очевидно, занят только расстроиванием.
Ольга вышла. Пьер постоял, посмотрел на сестер и, поклонившись, сказал:
– Так я пойду к себе. Когда можно будет, вы мне скажите.
Он вышел, и звонкий, но негромкий смех сестры с родинкой послышался за ним.
На другой день приехал князь Василий и поместился в доме графа. Он призвал к себе Пьера и сказал ему:
– Mon cher, si vous vous conduisez ici, comme a Petersbourg, vous finirez tres mal; c'est tout ce que je vous dis. [Мой милый, если вы будете вести себя здесь, как в Петербурге, вы кончите очень дурно; больше мне нечего вам сказать.] Граф очень, очень болен: тебе совсем не надо его видеть.
С тех пор Пьера не тревожили, и он целый день проводил один наверху, в своей комнате.
В то время как Борис вошел к нему, Пьер ходил по своей комнате, изредка останавливаясь в углах, делая угрожающие жесты к стене, как будто пронзая невидимого врага шпагой, и строго взглядывая сверх очков и затем вновь начиная свою прогулку, проговаривая неясные слова, пожимая плечами и разводя руками.
– L'Angleterre a vecu, [Англии конец,] – проговорил он, нахмуриваясь и указывая на кого то пальцем. – M. Pitt comme traitre a la nation et au droit des gens est condamiene a… [Питт, как изменник нации и народному праву, приговаривается к…] – Он не успел договорить приговора Питту, воображая себя в эту минуту самим Наполеоном и вместе с своим героем уже совершив опасный переезд через Па де Кале и завоевав Лондон, – как увидал входившего к нему молодого, стройного и красивого офицера. Он остановился. Пьер оставил Бориса четырнадцатилетним мальчиком и решительно не помнил его; но, несмотря на то, с свойственною ему быстрою и радушною манерой взял его за руку и дружелюбно улыбнулся.
– Вы меня помните? – спокойно, с приятной улыбкой сказал Борис. – Я с матушкой приехал к графу, но он, кажется, не совсем здоров.
– Да, кажется, нездоров. Его всё тревожат, – отвечал Пьер, стараясь вспомнить, кто этот молодой человек.
Борис чувствовал, что Пьер не узнает его, но не считал нужным называть себя и, не испытывая ни малейшего смущения, смотрел ему прямо в глаза.
– Граф Ростов просил вас нынче приехать к нему обедать, – сказал он после довольно долгого и неловкого для Пьера молчания.