Нуклеотидная последовательность

Поделись знанием:
Перейти к: навигация, поиск

Нуклеотидная последовательность, генетическая последовательность  — порядок следования нуклеотидных остатков в нуклеиновых кислотах. Определяется при помощи секвенирования.

Для записи нуклеотидных последовательностей ДНК по рекомендации IUPAC используются символы латинского алфавита.[1]

  • A = аденин[2]
  • C = цитозин
  • G = гуанин
  • T = тимин
  • R = G A гуанин или аденин — пуриновые (purine) основания
  • Y = T C пиримидиновые (pyrimidine) основания
  • K = G T содержащие кето-группу
  • M = A C содержащие аминогруппу
  • S = G C «сильные» (strong), образующие 3 водородные связи
  • W = A T «слабые» (weak), образующие 2 водородные связи
  • B = G T C (любой, кроме A)
  • D = G A T (любой, кроме C)
  • H = A C T (любой, кроме G)
  • V = G C A (любой, кроме T)
  • N = A G C T (любой)

Символы, обозначающие неопределённость последовательности, необходимы, когда точная последовательность неизвестна, несущественна, или известны разные её варианты.

Для записи последовательностей РНК обычно достаточно символов A, С, G, U (уридин).

Все последовательности записываются без пробелов, слева направо, от 5'-конца к 3'-концу.

Напишите отзыв о статье "Нуклеотидная последовательность"



Примечания

  1. [www.chem.qmul.ac.uk/iubmb/misc/naseq.html Nomenclature for Incompletely Specified Bases in Nucleic Acid Sequences], NC-IUB, 1984.
  2. для удобства используются названия оснований, а не нуклеозидов

См. также


Отрывок, характеризующий Нуклеотидная последовательность

– Ну, ладно, – сказал Денисов. И, обратившись к своим подчиненным, он сделал распоряжения о том, чтоб партия шла к назначенному у караулки в лесу месту отдыха и чтобы офицер на киргизской лошади (офицер этот исполнял должность адъютанта) ехал отыскивать Долохова, узнать, где он и придет ли он вечером. Сам же Денисов с эсаулом и Петей намеревался подъехать к опушке леса, выходившей к Шамшеву, с тем, чтобы взглянуть на то место расположения французов, на которое должно было быть направлено завтрашнее нападение.
– Ну, бог'ода, – обратился он к мужику проводнику, – веди к Шамшеву.
Денисов, Петя и эсаул, сопутствуемые несколькими казаками и гусаром, который вез пленного, поехали влево через овраг, к опушке леса.


Дождик прошел, только падал туман и капли воды с веток деревьев. Денисов, эсаул и Петя молча ехали за мужиком в колпаке, который, легко и беззвучно ступая своими вывернутыми в лаптях ногами по кореньям и мокрым листьям, вел их к опушке леса.
Выйдя на изволок, мужик приостановился, огляделся и направился к редевшей стене деревьев. У большого дуба, еще не скинувшего листа, он остановился и таинственно поманил к себе рукою.
Денисов и Петя подъехали к нему. С того места, на котором остановился мужик, были видны французы. Сейчас за лесом шло вниз полубугром яровое поле. Вправо, через крутой овраг, виднелась небольшая деревушка и барский домик с разваленными крышами. В этой деревушке и в барском доме, и по всему бугру, в саду, у колодцев и пруда, и по всей дороге в гору от моста к деревне, не более как в двухстах саженях расстояния, виднелись в колеблющемся тумане толпы народа. Слышны были явственно их нерусские крики на выдиравшихся в гору лошадей в повозках и призывы друг другу.