Окклюдин

Поделись знанием:
Перейти к: навигация, поиск
Окклюдин

PDB
Доступные структуры
PDB Поиск ортологов: [www.ebi.ac.uk/pdbe/searchResults.html?display=both&term=Q28269%20or%20A2VE81%20or%20B2RS24%20or%20Q61146%20or%20Q6P6T5%20or%20F1R799%20or%20Q5PRA1 PDBe], [www.rcsb.org/pdb/search/smartSubquery.do?smartSearchSubtype=UpAccessionIdQuery&accessionIdList=Q28269,A2VE81,B2RS24,Q61146,Q6P6T5,F1R799,Q5PRA1 RCSB]
Идентификаторы
Символ[www.genenames.org/cgi-bin/gene_symbol_report?hgnc_id=8104 OCLN] ; BLCPMG; PPP1R115
Внешние IDOMIM: [omim.org/entry/602876 602876 ] MGI: [www.informatics.jax.org/searches/accession_report.cgi?id=MGI:106183 106183 ] HomoloGene: [www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?cmd=Retrieve&db=homologene&dopt=HomoloGene&list_uids=1905 1905 ] GeneCards: [www.genecards.org/cgi-bin/carddisp.pl?id_type=entrezgene&id=100506658 OCLN Gene]
номер EC[www.genome.jp/dbget-bin/www_bget?enzyme+2.1.1.67 2.1.1.67]
Ортологи
ВидЧеловекМышь
Entrez[www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=gene&cmd=retrieve&dopt=default&list_uids=100506658&rn=1 100506658][www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=gene&cmd=retrieve&dopt=default&list_uids=18260&rn=1 18260]
Ensembl[www.ensembl.org/Homo_sapiens/geneview?gene=ENSG00000197822;db=core ENSG00000197822][www.ensembl.org/Mus_musculus/geneview?gene=ENSMUSG00000021638;db=core ENSMUSG00000021638]
UniProt[www.expasy.org/uniprot/Q16625 Q16625][www.expasy.org/uniprot/Q61146 Q61146]
RefSeq (мРНК)[www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/viewer.fcgi?val=NM_001205254 NM_001205254][www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/viewer.fcgi?val=NM_008756 NM_008756]
RefSeq (белок)[www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/viewer.fcgi?val=NP_001192183 NP_001192183][www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/viewer.fcgi?val=NP_032782 NP_032782]
Локус (UCSC)[genome.ucsc.edu/cgi-bin/hgTracks?org=Human&db=hg38&position=chr5:69492292-69558104 Chr 5:
69.49 – 69.56 Mb]
[genome.ucsc.edu/cgi-bin/hgTracks?org=Mouse&db=mm10&position=chr13:100496507-100552718 Chr 13:
100.5 – 100.55 Mb]
Поиск в PubMed[www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/entrez?db=gene&cmd=Link&LinkName=gene_pubmed&from_uid=100506658][www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/entrez?db=gene&cmd=Link&LinkName=gene_pubmed&from_uid=18260]

Окклюдин — интегральный белок с молекулярной массой 65 кДа, который расположен в плотных контактах и является их главным компонентом наряду с клаудинами[1]. У человека оклюдин кодируется геном OCLN и представляет собой 522-аминокислотный полипептид[2][3].

Впервые этот белок был описан в 1993 году Шоичиро Тсукитой[1].





Локализация гена OCLN

Ген OCLN расположен на длинном (q) плече хромосомы 5 в позиции q13.1. Он начинается с 69492292 пары оснований и простирается до 69558104 пары оснований, имея в длину 65813 пар оснований. В результате альтернативного сплайсинга экспрессируются две изоформы[4].

Структура белка

В структуре человека выделяют 9 доменов, разделенных на две группы. Первая группа объединяет 5 доменов, расположенных внутриклеточно и внеклеточно, а вторая группа объединяет 4 трансмембранных домены. Эти 9 доменов следующие:

  • N-концевой домен (66 аминокислот)
  • трансмембранный домен 1 (23 аминокислот)
  • внеклеточная петля 1 (46 аминокислот)
  • трансмембранный домен 2 (25 аминокислот)
  • внутриклеточная петля (10 аминокислот)
  • трансмембранный домен 3 (25 аминокислот)
  • внеклеточный домен 2 (48 аминокислот)
  • трансмембранный домен 4 (22 аминокислот)
  • C-концевой домен (257 аминокислот).

C-концевой домен необходим для правильного создания плотных контактов. Он также взаимодействует с несколькими цитоплазматическими белками в соединительном диске и сигнальными молекулами, ответственными за выживание клеток, а его N-концевой домен участвует в уплотненные плотных контактов. Внеклеточная петля оклюдину участвует в регуляции парацелюлярнои проницаемости, а внеклеточный домен 2 участвует в локализации по плотного контакта.

Функции

Окклюдин является важным для функционирования плотных контактов. Он определяет плотность плотных контактов и играет важную роль в обеспечении барьерной функции.

Напишите отзыв о статье "Окклюдин"

Примечания

  1. 1 2 Furuse M, Hirase T, Itoh M, Nagafuchi A, Yonemura S, Tsukita S, Tsukita S (1993). «Occludin: a novel integral membrane protein localizing at tight junctions». J. Cell Biol. 123 (6 Pt 2): 1777–1788. DOI:10.1083/jcb.123.6.1777. PMID 8276896.
  2. Ando-Akatsuka Y, Saitou M, Hirase T, Kishi M, Sakakibara A, Itoh M, Yonemura S, Furuse M, Tsukita S (May 1996). «Interspecies diversity of the occludin sequence: cDNA cloning of human, mouse, dog, and rat-kangaroo homologues». J Cell Biol 133 (1): 43–47. DOI:10.1083/jcb.133.1.43. PMID 8601611.
  3. [www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/entrez?Db=gene&Cmd=ShowDetailView&TermToSearch=4950 Entrez Gene: OCLN occludin].
  4. [www.ncbi.nlm.nih.gov/gene/100506658 OCLN occludin [Homo sapiens (human)] - Gene - NCBI]


Отрывок, характеризующий Окклюдин

– Ишь ты, и курские прошли, – говорили в рядах.
– Страсть, братец ты мой, что войски нашей собралось! Вечор посмотрел, как огни разложили, конца краю не видать. Москва, – одно слово!
Хотя никто из колонных начальников не подъезжал к рядам и не говорил с солдатами (колонные начальники, как мы видели на военном совете, были не в духе и недовольны предпринимаемым делом и потому только исполняли приказания и не заботились о том, чтобы повеселить солдат), несмотря на то, солдаты шли весело, как и всегда, идя в дело, в особенности в наступательное. Но, пройдя около часу всё в густом тумане, большая часть войска должна была остановиться, и по рядам пронеслось неприятное сознание совершающегося беспорядка и бестолковщины. Каким образом передается это сознание, – весьма трудно определить; но несомненно то, что оно передается необыкновенно верно и быстро разливается, незаметно и неудержимо, как вода по лощине. Ежели бы русское войско было одно, без союзников, то, может быть, еще прошло бы много времени, пока это сознание беспорядка сделалось бы общею уверенностью; но теперь, с особенным удовольствием и естественностью относя причину беспорядков к бестолковым немцам, все убедились в том, что происходит вредная путаница, которую наделали колбасники.
– Что стали то? Аль загородили? Или уж на француза наткнулись?
– Нет не слыхать. А то палить бы стал.
– То то торопили выступать, а выступили – стали без толку посереди поля, – всё немцы проклятые путают. Эки черти бестолковые!
– То то я бы их и пустил наперед. А то, небось, позади жмутся. Вот и стой теперь не емши.
– Да что, скоро ли там? Кавалерия, говорят, дорогу загородила, – говорил офицер.
– Эх, немцы проклятые, своей земли не знают, – говорил другой.
– Вы какой дивизии? – кричал, подъезжая, адъютант.
– Осьмнадцатой.
– Так зачем же вы здесь? вам давно бы впереди должно быть, теперь до вечера не пройдете.
– Вот распоряжения то дурацкие; сами не знают, что делают, – говорил офицер и отъезжал.
Потом проезжал генерал и сердито не по русски кричал что то.
– Тафа лафа, а что бормочет, ничего не разберешь, – говорил солдат, передразнивая отъехавшего генерала. – Расстрелял бы я их, подлецов!
– В девятом часу велено на месте быть, а мы и половины не прошли. Вот так распоряжения! – повторялось с разных сторон.
И чувство энергии, с которым выступали в дело войска, начало обращаться в досаду и злобу на бестолковые распоряжения и на немцев.
Причина путаницы заключалась в том, что во время движения австрийской кавалерии, шедшей на левом фланге, высшее начальство нашло, что наш центр слишком отдален от правого фланга, и всей кавалерии велено было перейти на правую сторону. Несколько тысяч кавалерии продвигалось перед пехотой, и пехота должна была ждать.
Впереди произошло столкновение между австрийским колонновожатым и русским генералом. Русский генерал кричал, требуя, чтобы остановлена была конница; австриец доказывал, что виноват был не он, а высшее начальство. Войска между тем стояли, скучая и падая духом. После часовой задержки войска двинулись, наконец, дальше и стали спускаться под гору. Туман, расходившийся на горе, только гуще расстилался в низах, куда спустились войска. Впереди, в тумане, раздался один, другой выстрел, сначала нескладно в разных промежутках: тратта… тат, и потом всё складнее и чаще, и завязалось дело над речкою Гольдбахом.
Не рассчитывая встретить внизу над речкою неприятеля и нечаянно в тумане наткнувшись на него, не слыша слова одушевления от высших начальников, с распространившимся по войскам сознанием, что было опоздано, и, главное, в густом тумане не видя ничего впереди и кругом себя, русские лениво и медленно перестреливались с неприятелем, подвигались вперед и опять останавливались, не получая во время приказаний от начальников и адъютантов, которые блудили по туману в незнакомой местности, не находя своих частей войск. Так началось дело для первой, второй и третьей колонны, которые спустились вниз. Четвертая колонна, при которой находился сам Кутузов, стояла на Праценских высотах.