Подопланин

Поделись знанием:
Перейти к: навигация, поиск
Podoplanin
Доступные структуры
PDB Поиск ортологов: [www.ebi.ac.uk/pdbe/searchResults.html?display=both&term=Q86YL7%20or%20Q95152%20or%20Q62011%20or%20Q64294 PDBe], [www.rcsb.org/pdb/search/smartSubquery.do?smartSearchSubtype=UpAccessionIdQuery&accessionIdList=Q86YL7,Q95152,Q62011,Q64294 RCSB]
Идентификаторы
Символ[www.genenames.org/cgi-bin/gene_symbol_report?hgnc_id=29602 PDPN] ; AGGRUS; GP36; GP40; Gp38; HT1A-1; OTS8; PA2.26; T1A; T1A-2; T1A2; TI1A
Внешние IDOMIM: [omim.org/entry/608863 608863 ] MGI: [www.informatics.jax.org/searches/accession_report.cgi?id=MGI:103098 103098 ] HomoloGene: [www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?cmd=Retrieve&db=homologene&dopt=HomoloGene&list_uids=4729 4729 ] GeneCards: [www.genecards.org/cgi-bin/carddisp.pl?id_type=entrezgene&id=10630 PDPN Gene]
Профиль экспрессии РНК
[biogps.org/gene/10630/ Больше информации]
Ортологи
ВидЧеловекМышь
Entrez[www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=gene&cmd=retrieve&dopt=default&list_uids=10630&rn=1 10630][www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=gene&cmd=retrieve&dopt=default&list_uids=14726&rn=1 14726]
Ensembl[www.ensembl.org/Homo_sapiens/geneview?gene=ENSG00000162493;db=core ENSG00000162493][www.ensembl.org/Mus_musculus/geneview?gene=ENSMUSG00000028583;db=core ENSMUSG00000028583]
UniProt[www.expasy.org/uniprot/Q86YL7 Q86YL7][www.expasy.org/uniprot/Q62011 Q62011]
RefSeq (мРНК)[www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/viewer.fcgi?val=NM_001006624 NM_001006624][www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/viewer.fcgi?val=NM_001290822 NM_001290822]
RefSeq (белок)[www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/viewer.fcgi?val=NP_001006625 NP_001006625][www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/viewer.fcgi?val=NP_001277751 NP_001277751]
Локус (UCSC)[genome.ucsc.edu/cgi-bin/hgTracks?org=Human&db=hg38&position=chr1:13583465-13617957 Chr 1:
13.58 – 13.62 Mb]
[genome.ucsc.edu/cgi-bin/hgTracks?org=Mouse&db=mm10&position=chr4:143267431-143299564 Chr 4:
143.27 – 143.3 Mb]
Поиск в PubMed[www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/entrez?db=gene&cmd=Link&LinkName=gene_pubmed&from_uid=10630][www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/entrez?db=gene&cmd=Link&LinkName=gene_pubmed&from_uid=14726]

Подопланин (англ. Podoplanin, PDPN) — белок, кодируемый геном PDPN[1][2][3].



Структура и функция

Подопланин — интегральный мембранный белок типа I, сильно O-гликозилированный гликопротеин типа муцинов, с молекулярной массой 36—43 кДа. В царстве животных это достаточно консервативный белок: его гомологи есть у человека, мышей, крыс, собак и хомяков[4].

Подопланин широко распространён в тканях человека. Гомологи данного белка у других видов выполняют функцию антигенов дифференцировки и рецепторов вируса гриппа. Конкретная функция белка у человека не идентифицирована, но предполагается, что он может быть маркером повреждения лёгких. Были получены альтернативно сплайсированные варианты, кодирующие разные изоформы[3].

Было обнаружено, что подопланин функционирует в альвеолярных клетках лёгких, подоцитах почек и клетках эндотелия лимфатической системы. Также этот белок был обнаружен в образцах нервной ткани мышей и человека[5]. Кроме того, было продемонстрировано, что подопланин играет роль в разделении лимфатической и кровеносной системе во время эмбрионального развития, а его дефицит приводит к стеатозу печени у мышей[5].

Хотя конкретная функция подопланина неизвестна, была отмечена его колокализация с белком промежуточных филаментов нестином[en], который экспрессируется практически исключительно в нервной ткани[6]. По состоянию на 2013 год, единственный белок, с которым как известно взаимодействует подопланин — это лектин-подобный рецептор CLEC-2 (англ. C-type lectin-like receptor 2)[7]. Оба этих белка играют роль в правильном формировании связей лимфатической и кровеносной систем во время эмбрионального развития.

Клиническое значение

Подопланин активно изучается онкологами. Он является специфичным маркером лимфатических сосудов. Поскольку лимфангиогенез (формирование новых лимфатических сосудов) коррелирует с плохим прогнозом у раковых больных, подопланин может быть полезным диагностическим маркером[4]. Отмечена положительная регуляция подопланина в различных видах опухолей, например в нескольких видах карциномы плоского эпителия, злокачественной мезотелиоме и опухолях мозга[4]. Кроме того, он положительно регулируется ассоциированными с опухолью фибробластами (англ. cancer-associated fibroblasts (CAFs)) в опухолевой строме[4][8], что ассоциируется с неблагоприятным прогнозом течения болезни[9].

В карциномах плоского эпителия подопланин играет ключевую роль в инвазивности раковых клеток, контролируя инвадоподии[en], что обеспечивает эффективную деградацию внеклеточного матрикса[10].

Напишите отзыв о статье "Подопланин"

Примечания

  1. Zimmer G., Oeffner F., Von Messling V., Tschernig T., Gröness H. J., Klenk H. D., Herrler G. [www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/10393083 Cloning and characterization of gp36, a human mucin-type glycoprotein preferentially expressed in vascular endothelium.] (англ.) // The Biochemical journal. — 1999. — Vol. 341 ( Pt 2). — P. 277—284. — PMID 10393083. исправить
  2. Ma T., Yang B., Matthay M. A., Verkman A. S. [www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/9651190 Evidence against a role of mouse, rat, and two cloned human t1alpha isoforms as a water channel or a regulator of aquaporin-type water channels.] (англ.) // American journal of respiratory cell and molecular biology. — 1998. — Vol. 19, no. 1. — P. 143—149. — DOI:10.1165/ajrcmb.19.1.2953. — PMID 9651190. исправить
  3. 1 2 [www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/entrez?Db=gene&Cmd=ShowDetailView&TermToSearch=10630 Entrez Gene: PDPN podoplanin].
  4. 1 2 3 4 Astarita J. L., Acton S. E., Turley S. J. [www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/22988448 Podoplanin: emerging functions in development, the immune system, and cancer.] (англ.) // Frontiers in immunology. — 2012. — Vol. 3. — P. 283. — DOI:10.3389/fimmu.2012.00283. — PMID 22988448. исправить
  5. 1 2 Fu J., Gerhardt H., McDaniel J. M., Xia B., Liu X., Ivanciu L., Ny A., Hermans K., Silasi-Mansat R., McGee S., Nye E., Ju T., Ramirez M. I., Carmeliet P., Cummings R. D., Lupu F., Xia L. [www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/18924607 Endothelial cell O-glycan deficiency causes blood/lymphatic misconnections and consequent fatty liver disease in mice.] (англ.) // The Journal of clinical investigation. — 2008. — Vol. 118, no. 11. — P. 3725—3737. — DOI:10.1172/JCI36077. — PMID 18924607. исправить
  6. Imaizumi Y., Amano I., Tsuruga E., Kojima H., Sawa Y. [www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/21060740 Immunohistochemical examination for the distribution of podoplanin-expressing cells in developing mouse molar tooth germs.] (англ.) // Acta histochemica et cytochemica. — 2010. — Vol. 43, no. 5. — P. 115—121. — DOI:10.1267/ahc.10023. — PMID 21060740. исправить
  7. Herzog B. H., Fu J., Wilson S. J., Hess P. R., Sen A., McDaniel J. M., Pan Y., Sheng M., Yago T., Silasi-Mansat R., McGee S., May F., Nieswandt B., Morris A. J., Lupu F., Coughlin S. R., McEver R. P., Chen H., Kahn M. L., Xia L. [www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/23995678 Podoplanin maintains high endothelial venule integrity by interacting with platelet CLEC-2.] (англ.) // Nature. — 2013. — Vol. 502, no. 7469. — P. 105—109. — DOI:10.1038/nature12501. — PMID 23995678. исправить
  8. Kitano H., Kageyama S., Hewitt S. M., Hayashi R., Doki Y., Ozaki Y., Fujino S., Takikita M., Kubo H., Fukuoka J. [www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/20923309 Podoplanin expression in cancerous stroma induces lymphangiogenesis and predicts lymphatic spread and patient survival.] (англ.) // Archives of pathology & laboratory medicine. — 2010. — Vol. 134, no. 10. — P. 1520—1527. — DOI:10.1043/2009-0114-OA.1. — PMID 20923309. исправить
  9. Chuang W. Y., Yeh C. J., Chao Y. K., Liu Y. H., Chang Y. S., Tseng C. K., Chang H. K., Wan Y. L., Hsueh C. [www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/25197355 Concordant podoplanin expression in cancer-associated fibroblasts and tumor cells is an adverse prognostic factor in esophageal squamous cell carcinoma.] (англ.) // International journal of clinical and experimental pathology. — 2014. — Vol. 7, no. 8. — P. 4847—4856. — PMID 25197355. исправить
  10. Martín-Villar E., Borda-d'Agua B., Carrasco-Ramirez P., Renart J., Parsons M., Quintanilla M., Jones G. E. [www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/25486435 Podoplanin mediates ECM degradation by squamous carcinoma cells through control of invadopodia stability.] (англ.) // Oncogene. — 2015. — Vol. 34, no. 34. — P. 4531—4544. — DOI:10.1038/onc.2014.388. — PMID 25486435. исправить

Отрывок, характеризующий Подопланин

– Что толкаешься то, – про тебя одного огонь, что ли? Вишь… развалился.
Из за устанавливающегося молчания послышался храп некоторых заснувших; остальные поворачивались и грелись, изредка переговариваясь. От дальнего, шагов за сто, костра послышался дружный, веселый хохот.
– Вишь, грохочат в пятой роте, – сказал один солдат. – И народу что – страсть!
Один солдат поднялся и пошел к пятой роте.
– То то смеху, – сказал он, возвращаясь. – Два хранцуза пристали. Один мерзлый вовсе, а другой такой куражный, бяда! Песни играет.
– О о? пойти посмотреть… – Несколько солдат направились к пятой роте.


Пятая рота стояла подле самого леса. Огромный костер ярко горел посреди снега, освещая отягченные инеем ветви деревьев.
В середине ночи солдаты пятой роты услыхали в лесу шаги по снегу и хряск сучьев.
– Ребята, ведмедь, – сказал один солдат. Все подняли головы, прислушались, и из леса, в яркий свет костра, выступили две, держащиеся друг за друга, человеческие, странно одетые фигуры.
Это были два прятавшиеся в лесу француза. Хрипло говоря что то на непонятном солдатам языке, они подошли к костру. Один был повыше ростом, в офицерской шляпе, и казался совсем ослабевшим. Подойдя к костру, он хотел сесть, но упал на землю. Другой, маленький, коренастый, обвязанный платком по щекам солдат, был сильнее. Он поднял своего товарища и, указывая на свой рот, говорил что то. Солдаты окружили французов, подстелили больному шинель и обоим принесли каши и водки.
Ослабевший французский офицер был Рамбаль; повязанный платком был его денщик Морель.
Когда Морель выпил водки и доел котелок каши, он вдруг болезненно развеселился и начал не переставая говорить что то не понимавшим его солдатам. Рамбаль отказывался от еды и молча лежал на локте у костра, бессмысленными красными глазами глядя на русских солдат. Изредка он издавал протяжный стон и опять замолкал. Морель, показывая на плечи, внушал солдатам, что это был офицер и что его надо отогреть. Офицер русский, подошедший к костру, послал спросить у полковника, не возьмет ли он к себе отогреть французского офицера; и когда вернулись и сказали, что полковник велел привести офицера, Рамбалю передали, чтобы он шел. Он встал и хотел идти, но пошатнулся и упал бы, если бы подле стоящий солдат не поддержал его.
– Что? Не будешь? – насмешливо подмигнув, сказал один солдат, обращаясь к Рамбалю.
– Э, дурак! Что врешь нескладно! То то мужик, право, мужик, – послышались с разных сторон упреки пошутившему солдату. Рамбаля окружили, подняли двое на руки, перехватившись ими, и понесли в избу. Рамбаль обнял шеи солдат и, когда его понесли, жалобно заговорил:
– Oh, nies braves, oh, mes bons, mes bons amis! Voila des hommes! oh, mes braves, mes bons amis! [О молодцы! О мои добрые, добрые друзья! Вот люди! О мои добрые друзья!] – и, как ребенок, головой склонился на плечо одному солдату.
Между тем Морель сидел на лучшем месте, окруженный солдатами.
Морель, маленький коренастый француз, с воспаленными, слезившимися глазами, обвязанный по бабьи платком сверх фуражки, был одет в женскую шубенку. Он, видимо, захмелев, обнявши рукой солдата, сидевшего подле него, пел хриплым, перерывающимся голосом французскую песню. Солдаты держались за бока, глядя на него.
– Ну ка, ну ка, научи, как? Я живо перейму. Как?.. – говорил шутник песенник, которого обнимал Морель.
Vive Henri Quatre,
Vive ce roi vaillanti –
[Да здравствует Генрих Четвертый!
Да здравствует сей храбрый король!
и т. д. (французская песня) ]
пропел Морель, подмигивая глазом.
Сe diable a quatre…
– Виварика! Виф серувару! сидябляка… – повторил солдат, взмахнув рукой и действительно уловив напев.
– Вишь, ловко! Го го го го го!.. – поднялся с разных сторон грубый, радостный хохот. Морель, сморщившись, смеялся тоже.
– Ну, валяй еще, еще!
Qui eut le triple talent,
De boire, de battre,
Et d'etre un vert galant…
[Имевший тройной талант,
пить, драться
и быть любезником…]
– A ведь тоже складно. Ну, ну, Залетаев!..
– Кю… – с усилием выговорил Залетаев. – Кью ю ю… – вытянул он, старательно оттопырив губы, – летриптала, де бу де ба и детравагала, – пропел он.
– Ай, важно! Вот так хранцуз! ой… го го го го! – Что ж, еще есть хочешь?
– Дай ему каши то; ведь не скоро наестся с голоду то.
Опять ему дали каши; и Морель, посмеиваясь, принялся за третий котелок. Радостные улыбки стояли на всех лицах молодых солдат, смотревших на Мореля. Старые солдаты, считавшие неприличным заниматься такими пустяками, лежали с другой стороны костра, но изредка, приподнимаясь на локте, с улыбкой взглядывали на Мореля.