тмРНК
тмРНК (tmRNA, 10S RNA) — «транспортно-матричная» рибонуклеиновая кислота. Часть тмРНК по структуре аналогична транспортной РНК, и после аминоацилирования несёт остаток аланина, другая же кодирует короткий пептид (маркер протеолиза). тмРНК кодируется геном ssrA, который в большинстве случаев кодирует тмРНК, состоящую из одной цепи нуклеотидов; у некоторых альфа- и бета-протеобактерий, цианобактерий и в примитивных митохондриях протист семейства Jakobidae измененный ген ssrA кодирует тмРНК, состоящую из двух отдельных РНК, которые соединены комплементарным спариванием оснований. В цитоплазме тмРНК образует рибонуклеопротеидный комплекс (tmRNP) с маленьким белком В (Small Protein B, SmpB), фактором элонгации Tu (EF-Tu) и рибосомным белком S1.
Функции тмРНК
Трансляция неполных, не содержащих стоп-кодонов мРНК приводит к тому, что рибосома задерживается на таких РНК, так как невозможна нормальная терминация трансляции и диссоциация рибосомных субъединиц. Также задержка рибосомы происходит на участках РНК, содержащих несколько идущих подряд «редких» кодонов.
В таких случаях тмРНК участвует в терминации трансляции по механизму, называемому транс-трансляцией:
- тРНК-подобная часть тмРНК попадает в А-сайт рибосомы;
- происходит транспептидация, перенос недосинтезированного пептида на аланин в составе тмРНК;
- далее на матрице тмРНК синтезируется метка из 11 аминокислот - (A)ANDENYALAA (включая уже присоединенный аланин); считывание кодонов при этом происходит с MLR-региона (messenger RNA-like region) тмРНК;
- на стоп-кодоне тмРНК происходит терминация трансляции, а помеченный белок подвергается протеолизу.
У большинства бактерий деградация белков с ssrA-хвостом осуществляется АТФ-зависимыми протеазами ClpXP (в основном)[1],ClpAP, Lon[2], и FtsH[3] (в значительно меньшей степени). Исключение составляют Mycobacteriae, у которых главную роль играет Lon[4]. Не до конца транслированный фрагмент мРНК при этом расщепляется нуклеазами.
Детальный механизм транс-трансляции в настоящее время исследуется.
Напишите отзыв о статье "ТмРНК"
Литература
- ↑ [www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/9573050 Gottesman et. al Genes Dev. 1998 May 1;12(9):1338-47.]
- ↑ [www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/18550539 Lies and Maurizi, J Biol Chem. 2008 Aug 22;283(34):22918-29. doi: 10.1074/jbc.M801692200. Epub 2008 Jun 12.]
- ↑ [www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/12667449 Herman et. al Mol Cell. 2003 Mar;11(3):659-69.]
- ↑ Gur E, Sauer RT (October 2008). «[www.pnas.org/cgi/pmidlookup?view=long&pmid=18852454 Evolution of the ssrA degradation tag in Mycoplasma: specificity switch to a different protease]». Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 105 (42): 16113–8. DOI:10.1073/pnas.0808802105. PMID 18852454. Проверено 2010-07-14.
Ссылки
- [rnp.uthct.edu/rnp/tmRDB/tmRDB.html tmRDB: A database of tmRNA sequences]
- [www.indiana.edu/~tmrna/ The tmRNA website]
- [www.sanger.ac.uk/cgi-bin/Rfam/getacc?RF00023 Rfam entry for tmRNA]
- Roche, ED; Sauer RT (1999). «SsrA-mediated peptide tagging caused by rare codons and tRNA scarcity.». EMBO J. 18(16): 4579-89. PMID 10449423.
| ||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
Это заготовка статьи по молекулярной биологии. Вы можете помочь проекту, дополнив её. |
Отрывок, характеризующий ТмРНК
– Прости меня, ежели я тебя утруждаю… – Пьер понял, что князь Андрей хотел говорить о Наташе, и широкое лицо его выразило сожаление и сочувствие. Это выражение лица Пьера рассердило князя Андрея; он решительно, звонко и неприятно продолжал: – Я получил отказ от графини Ростовой, и до меня дошли слухи об искании ее руки твоим шурином, или тому подобное. Правда ли это?– И правда и не правда, – начал Пьер; но князь Андрей перебил его.
– Вот ее письма и портрет, – сказал он. Он взял связку со стола и передал Пьеру.
– Отдай это графине… ежели ты увидишь ее.
– Она очень больна, – сказал Пьер.
– Так она здесь еще? – сказал князь Андрей. – А князь Курагин? – спросил он быстро.
– Он давно уехал. Она была при смерти…
– Очень сожалею об ее болезни, – сказал князь Андрей. – Он холодно, зло, неприятно, как его отец, усмехнулся.
– Но господин Курагин, стало быть, не удостоил своей руки графиню Ростову? – сказал князь Андрей. Он фыркнул носом несколько раз.
– Он не мог жениться, потому что он был женат, – сказал Пьер.
Князь Андрей неприятно засмеялся, опять напоминая своего отца.
– А где же он теперь находится, ваш шурин, могу ли я узнать? – сказал он.
– Он уехал в Петер…. впрочем я не знаю, – сказал Пьер.
– Ну да это всё равно, – сказал князь Андрей. – Передай графине Ростовой, что она была и есть совершенно свободна, и что я желаю ей всего лучшего.
Пьер взял в руки связку бумаг. Князь Андрей, как будто вспоминая, не нужно ли ему сказать еще что нибудь или ожидая, не скажет ли чего нибудь Пьер, остановившимся взглядом смотрел на него.
– Послушайте, помните вы наш спор в Петербурге, – сказал Пьер, помните о…
– Помню, – поспешно отвечал князь Андрей, – я говорил, что падшую женщину надо простить, но я не говорил, что я могу простить. Я не могу.
– Разве можно это сравнивать?… – сказал Пьер. Князь Андрей перебил его. Он резко закричал:
– Да, опять просить ее руки, быть великодушным, и тому подобное?… Да, это очень благородно, но я не способен итти sur les brisees de monsieur [итти по стопам этого господина]. – Ежели ты хочешь быть моим другом, не говори со мною никогда про эту… про всё это. Ну, прощай. Так ты передашь…
Пьер вышел и пошел к старому князю и княжне Марье.
Старик казался оживленнее обыкновенного. Княжна Марья была такая же, как и всегда, но из за сочувствия к брату, Пьер видел в ней радость к тому, что свадьба ее брата расстроилась. Глядя на них, Пьер понял, какое презрение и злобу они имели все против Ростовых, понял, что нельзя было при них даже и упоминать имя той, которая могла на кого бы то ни было променять князя Андрея.
За обедом речь зашла о войне, приближение которой уже становилось очевидно. Князь Андрей не умолкая говорил и спорил то с отцом, то с Десалем, швейцарцем воспитателем, и казался оживленнее обыкновенного, тем оживлением, которого нравственную причину так хорошо знал Пьер.
В этот же вечер, Пьер поехал к Ростовым, чтобы исполнить свое поручение. Наташа была в постели, граф был в клубе, и Пьер, передав письма Соне, пошел к Марье Дмитриевне, интересовавшейся узнать о том, как князь Андрей принял известие. Через десять минут Соня вошла к Марье Дмитриевне.
– Наташа непременно хочет видеть графа Петра Кирилловича, – сказала она.
– Да как же, к ней что ль его свести? Там у вас не прибрано, – сказала Марья Дмитриевна.
