Фаг Т4

Поделись знанием:
Перейти к: навигация, поиск
Бактериофаг Т4

Строение бактериофага Т4
Научная классификация
Международное научное название

Escherichia virus T4

Синонимы

по данным ICTV[2]:

  • Coliphage T2
  • Coliphage T4
  • Coliphage T6
  • Enterobacteria phage C16
  • Enterobacteria phage PST
  • Enterobacteria phage T4
  • Phage C16
  • Phage PST
Группа по Балтимору

I: дцДНК-вирусы


Систематика
на Викивидах

Поиск изображений
на Викискладе

Бактериофаг T4 (англ. Escherichia virus T4, ранее Enterobacteria phage T4) — один из самых изученных вирусов, бактериофаг, поражающий энтеробактерии, в том числе Escherichia coli. Имеет геномную ДНК порядка 169—170 тысяч пар нуклеотидов, упакованную в икосаэдрическую головку. Вирион также имеет ствол, основание ствола и стволовые отростки — шесть длинных и шесть коротких.

Бактериофаг T4 использует ДНК-полимеразу кольцевого типа; его скользящая манжетка является тримером, сходным с PCNA, но она не имеет гомологии ни с PCNA, ни с полимеразой β.

T4 является относительно крупным фагом, имеет диаметр около 90 нм и длину около 200 нм. Фаг T4 использует только литический цикл развития, но не лизогенный.

С фагом Т4 или подобными бактериофагами работали лауреаты Нобелевской премии Макс Дельбрюк, Сальвадор Лурия, Альфред Херши, Джеймс Уотсон и Френсис Крик, а также другие известные ученые — Майкл Россманн, Вадим Месянжинов, Фумио Арисака, Сеймур Бензер, Брюс Альбертс.

В 2016 году, как и другие бактериофаги, был переименован в Escherichia virus T4[3].

Напишите отзыв о статье "Фаг Т4"



Литература

  • [www.youtube.com/watch?v=Ofd_lgEymto Белковая сборка Т4 (анимация)]
  • Leiman, P.G., Kanamaru, S., Mesyanzhinov, V.V., Arisaka, F., and Rossmann, M.G., «Structure and morphogenesis of bacteriophage T4.»[commerce.metapress.com/content/agh59p6ck92yu1df/resource-secured/?target=fulltext.pdf&sid=hcdyjszn4a5lch552m5hysqe&sh=www.springerlink.com]
  • Karam, J., Petrov, V., Nolan, J., Chin, D., Shatley, C., Krisch, H., and Letarov, A. The T4-like phages genome project. [phage.bioc.tulane.edu/ phage.bioc.tulane.edu/]. (The T4-like phage full genomic sequence depository)
  • Mosig, G., and F. Eiserling. 2006. T4 and related phages: structure and development, R. Calendar and S. T. Abedon (eds.), The Bacteriophages. Oxford University Press, Oxford. (Review of phage T4 biology) ISBN 0-19-514850-9
  • Filee J. Tetart F., Suttle C.A., Krisch H.M. (2005). «[www.pnas.org/cgi/content/full/102/35/12471 Marine T4-type bacteriophages, a ubiquitous component of the dark matter of the biosphere]». Proc. Natl. Acad. Sci. USA 102 (35): 12471–6. DOI:10.1073/pnas.0503404102. PMID 16116082. (Indication of prevalence and T4-like phages in the wild)
  • Chibani-Chennoufi S., Canchaya C., Bruttin A., Brussow H. (2004). «[jb.asm.org/cgi/content/full/186/24/8276 Comparative genomics of the T4-Like Escherichia coli phage JS98: implications for the evolution of T4 phages]». J. Bacteriol. 186 (24): 8276–86. DOI:10.1128/JB.186.24.8276-8286.2004. PMID 15576776. (Characterization of a T4-like phage)
  • Desplats C, Krisch HM (May 2003). «[linkinghub.elsevier.com/retrieve/pii/S0923-2508(03)00069-X The diversity and evolution of the T4-type bacteriophages]». Res. Microbiol. 154 (4): 259–67. DOI:10.1016/S0923-2508(03)00069-X. PMID 12798230.
  • Miller, E.S., Kutter E., Mosig G., Arisaka F., Kunisawa T., Ruger W. (2003). «[mmbr.asm.org/cgi/content/full/67/1/86 Bacteriophage T4 genome]». Microbiol. Mol. Biol. Rev. 67 (1): 86–156. DOI:10.1128/MMBR.67.1.86-156.2003. PMID 12626685. (Review of phage T4, from the perspective of its genome)
  • Desplats C., Dez C., Tetart F., Eleaume H., Krisch H.M. (2002). «[jb.asm.org/cgi/content/full/184/10/2789 Snapshot of the genome of the pseudo-T-even bacteriophage RB49]». J. Bacteriol. 184 (10): 2789–2804. DOI:10.1128/JB.184.10.2789-2804.2002. PMID 11976309. (Overview of the RB49 genome, a T4-like phage)
  • Malys N, Chang DY, Baumann RG, Xie D, Black LW (2002). «A bipartite bacteriophage T4 SOC and HOC randomized peptide display library: detection and analysis of phage T4 terminase (gp17) and late sigma factor (gp55) interaction». J Mol Biol 319 (2): 289–304. DOI:10.1016/S0022-2836(02)00298-X. PMID 12051907. (T4 phage application in biotechnology for studying protein interaction)
  • Tétart F., Desplats C., Kutateladze M., Monod C., Ackermann H.-W., Krisch H.M. (2001). «[jb.asm.org/cgi/content/full/183/1/358 Phylogeny of the major head and tail genes of the wide-ranging T4-type bacteriophages]». J. Bacteriol. 183 (1): 358–366. DOI:10.1128/JB.183.1.358-366.2001. PMID 11114936. (Indication of the prevalence of T4-type sequences in the wild)
  • Abedon S.T. (2000). «[www.genetics.org/cgi/content/full/155/2/481 The murky origin of Snow White and her T-even dwarfs]». Genetics 155 (2): 481–6. PMID 10835374. (Historical description of the isolation of the T4-like phages T2, T4, and T6)
  • Ackermann HW, Krisch HM (1997). «[link.springer.de/link/service/journals/00705/bibs/7142012/71422329.htm A catalogue of T4-type bacteriophages]». Arch. Virol. 142 (12): 2329–45. DOI:10.1007/s007050050246. PMID 9672598. (Nearly complete list of then-known T4-like phages)
  • Monod C, Repoila F, Kutateladze M, Tétart F, Krisch HM (March 1997). «[linkinghub.elsevier.com/retrieve/pii/S0022-2836(96)90867-0 The genome of the pseudo T-even bacteriophages, a diverse group that resembles T4]». J. Mol. Biol. 267 (2): 237–49. DOI:10.1006/jmbi.1996.0867. PMID 9096222. (Overview of various T4-like phages from the perspective of their genomes)
  • Kutter E., Gachechiladze K., Poglazov A., Marusich E., Shneider M., Aronsson P., Napuli A., Porter D., Mesyanzhinov V. (1995). «[www.springerlink.com/content/k5v006j37333445m/ Evolution of T4-related phages]». Virus Genes 11 (2-3): 285–297. DOI:10.1007/BF01728666. PMID 8828153. (Comparison of the genomes of various T4-like phages)
  • Karam, J. D. et al. 1994. Molecular Biology of Bacteriophage T4. ASM Press, Washington, DC. (The second T4 bible, go here, as well as Mosig and Eiserling, 2006, to begin to learn about the biology T4 phage) ISBN 1-55581-064-0
  • Eddy, S. R. 1992. Introns in the T-Even Bacteriophages. Ph.D. thesis. University of Colorado at Boulder. (Chapter 3 provides overview of various T4-like phages as well as the isolation of then-new T4-like phages)
  • Mathews, C. K., E. M. Kutter, G. Mosig, and P. B. Berget. 1983. Bacteriophage T4. American Society for Microbiology, Washington, DC. (The first T4 bible; not all information here is duplicated in Karam et al., 1994; see especially the introductory chapter by Doermann for a historical overview of the T4-like phages) ISBN 0-914826-56-5
  • Russell, R. L. 1967. Speciation Among the T-Even Bacteriophages. Ph.D. thesis. California Institute of Technology. (Isolation of the RB series of T4-like phages)
  • Kay D., Fildes P. (1962). «Hydroxymethylcytosine-containing and tryptophan-dependent bacteriophages isolated from city effluents». J. Gen. Microbiol. 27: 143–6. PMID 14454648. (T4-like phage isolation, including that of phage Ox2)

Примечания

  1. [ictvonline.org/virusTaxonomy.asp Таксономия вирусов] на сайте Международного комитета по таксономии вирусов (ICTV) (англ.)
  2. [ictvonline.org/taxonomyHistory.asp?taxnode_id=20150062&taxa_name=Escherichia%20virus%20T4 ICTV Taxonomy History for Escherichia virus T4] на сайте ICTV (англ.) (Проверено 20 июня 2016).
  3. [ictvonline.org/proposals/2015.025aB.A.v4.phagesp_ren.pdf To rename all (522) existing bacterial virus and 2 archaeal virus species] : [англ.] // ICTVonline. — Code assigned: 2015.025aB. — 2015. — 18 p.</span>
  4. </ol>


Отрывок, характеризующий Фаг Т4

Пьер поспешно достал кошелек, часы, и долго не мог снять с жирного пальца обручальное кольцо. Когда это было сделано, масон сказал:
– В знак повиновенья прошу вас раздеться. – Пьер снял фрак, жилет и левый сапог по указанию ритора. Масон открыл рубашку на его левой груди, и, нагнувшись, поднял его штанину на левой ноге выше колена. Пьер поспешно хотел снять и правый сапог и засучить панталоны, чтобы избавить от этого труда незнакомого ему человека, но масон сказал ему, что этого не нужно – и подал ему туфлю на левую ногу. С детской улыбкой стыдливости, сомнения и насмешки над самим собою, которая против его воли выступала на лицо, Пьер стоял, опустив руки и расставив ноги, перед братом ритором, ожидая его новых приказаний.
– И наконец, в знак чистосердечия, я прошу вас открыть мне главное ваше пристрастие, – сказал он.
– Мое пристрастие! У меня их было так много, – сказал Пьер.
– То пристрастие, которое более всех других заставляло вас колебаться на пути добродетели, – сказал масон.
Пьер помолчал, отыскивая.
«Вино? Объедение? Праздность? Леность? Горячность? Злоба? Женщины?» Перебирал он свои пороки, мысленно взвешивая их и не зная которому отдать преимущество.
– Женщины, – сказал тихим, чуть слышным голосом Пьер. Масон не шевелился и не говорил долго после этого ответа. Наконец он подвинулся к Пьеру, взял лежавший на столе платок и опять завязал ему глаза.
– Последний раз говорю вам: обратите всё ваше внимание на самого себя, наложите цепи на свои чувства и ищите блаженства не в страстях, а в своем сердце. Источник блаженства не вне, а внутри нас…
Пьер уже чувствовал в себе этот освежающий источник блаженства, теперь радостью и умилением переполнявший его душу.


Скоро после этого в темную храмину пришел за Пьером уже не прежний ритор, а поручитель Вилларский, которого он узнал по голосу. На новые вопросы о твердости его намерения, Пьер отвечал: «Да, да, согласен», – и с сияющею детскою улыбкой, с открытой, жирной грудью, неровно и робко шагая одной разутой и одной обутой ногой, пошел вперед с приставленной Вилларским к его обнаженной груди шпагой. Из комнаты его повели по коридорам, поворачивая взад и вперед, и наконец привели к дверям ложи. Вилларский кашлянул, ему ответили масонскими стуками молотков, дверь отворилась перед ними. Чей то басистый голос (глаза Пьера всё были завязаны) сделал ему вопросы о том, кто он, где, когда родился? и т. п. Потом его опять повели куда то, не развязывая ему глаз, и во время ходьбы его говорили ему аллегории о трудах его путешествия, о священной дружбе, о предвечном Строителе мира, о мужестве, с которым он должен переносить труды и опасности. Во время этого путешествия Пьер заметил, что его называли то ищущим, то страждущим, то требующим, и различно стучали при этом молотками и шпагами. В то время как его подводили к какому то предмету, он заметил, что произошло замешательство и смятение между его руководителями. Он слышал, как шопотом заспорили между собой окружающие люди и как один настаивал на том, чтобы он был проведен по какому то ковру. После этого взяли его правую руку, положили на что то, а левою велели ему приставить циркуль к левой груди, и заставили его, повторяя слова, которые читал другой, прочесть клятву верности законам ордена. Потом потушили свечи, зажгли спирт, как это слышал по запаху Пьер, и сказали, что он увидит малый свет. С него сняли повязку, и Пьер как во сне увидал, в слабом свете спиртового огня, несколько людей, которые в таких же фартуках, как и ритор, стояли против него и держали шпаги, направленные в его грудь. Между ними стоял человек в белой окровавленной рубашке. Увидав это, Пьер грудью надвинулся вперед на шпаги, желая, чтобы они вонзились в него. Но шпаги отстранились от него и ему тотчас же опять надели повязку. – Теперь ты видел малый свет, – сказал ему чей то голос. Потом опять зажгли свечи, сказали, что ему надо видеть полный свет, и опять сняли повязку и более десяти голосов вдруг сказали: sic transit gloria mundi. [так проходит мирская слава.]
Пьер понемногу стал приходить в себя и оглядывать комнату, где он был, и находившихся в ней людей. Вокруг длинного стола, покрытого черным, сидело человек двенадцать, всё в тех же одеяниях, как и те, которых он прежде видел. Некоторых Пьер знал по петербургскому обществу. На председательском месте сидел незнакомый молодой человек, в особом кресте на шее. По правую руку сидел итальянец аббат, которого Пьер видел два года тому назад у Анны Павловны. Еще был тут один весьма важный сановник и один швейцарец гувернер, живший прежде у Курагиных. Все торжественно молчали, слушая слова председателя, державшего в руке молоток. В стене была вделана горящая звезда; с одной стороны стола был небольшой ковер с различными изображениями, с другой было что то в роде алтаря с Евангелием и черепом. Кругом стола было 7 больших, в роде церковных, подсвечников. Двое из братьев подвели Пьера к алтарю, поставили ему ноги в прямоугольное положение и приказали ему лечь, говоря, что он повергается к вратам храма.