Шаблон:GNF Protein box
GNF Protein box | |||||
---|---|---|---|---|---|
Идентификаторы | |||||
Символ | [www.genenames.org/cgi-bin/gene_symbol_report?hgnc_id={{{HGNCid}}} {{{Symbol}}}] | ||||
| |||||
Ортологи | |||||
Вид | Человек | Мышь | |||
Entrez | n/a | n/a | |||
Ensembl | n/a | n/a | |||
UniProt | n/a | n/a | |||
RefSeq (мРНК) | n/a | n/a | |||
RefSeq (белок) | n/a | n/a | |||
Локус (UCSC) | n/a | n/a | |||
Поиск в PubMed | n/a | n/a |
Этот шаблон реализован на основе Lua. Не указано название использующегося модуля! |
Задать вопросы по поводу данного шаблона можно на странице обсуждение.
Перенос шаблона
В английской википедии каждый шаблон GNF Protein box вынесен в отдельную подстраницу. Что бы получить доступ к полному коду шаблону, нажмите на букву E (edit) в нижним правом углу шаблона и скопируйте полученный текст.
Использование
Для того, чтобы использовать данный шаблон, скопируйте нижеприведенный текст и вставьте в начале Вашей статьи. Заполните максимально возможное количество полей, но не беспокойтесь, если некоторые поля останутся пустыми. Для примера того, как может быть заполнен шаблон, перейдите на страницу Лактоферрин.
{{GNF_Protein_box | Name = | image = | image_source = | PDB = | HGNCid = | MGIid = | Symbol = | AltSymbols = | OMIM = | ECnumber = | Homologene = | GeneAtlas_image = | Function = | NotAProtein = | Orthologs = | Hs_EntrezGene = | Hs_Ensembl = | Hs_RefseqmRNA = | Hs_RefseqProtein = | Hs_GenLoc_db = | Hs_GenLoc_chr = | Hs_GenLoc_start = | Hs_GenLoc_end = | Hs_Uniprot = | Mm_EntrezGene = | Mm_Ensembl = | Mm_RefseqmRNA = | Mm_RefseqProtein = | Mm_GenLoc_db = mm9 | Mm_GenLoc_chr = | Mm_GenLoc_start = | Mm_GenLoc_end = | Mm_Uniprot = | path = | IUPHAR = }}
Категории
Шаблон автоматически включает в статьях категорию Категория:Белки по алфавиту, при наличии заполненного параметра ECnumber
— категорию Категория:Ферменты по алфавиту, при наличии любого заполненного параметра, начинающегшося на префикс Hs, например Hs_EntrezGene
— категорию Категория:Белки человека. Отключить простановку всех категорий можно добавлением параметра nocat
c любым значением, например так: |nocat = 1
.
Параметры
name
- В этом поле записывается полное название белка, в идеале номенклатурное название, которое можно найти например [www.gene.ucl.ac.uk/nomenclature/ тут]. Обратите внимание, что есть особое поле symbol.
image
- В этом поле указывается ссылка на файл, представляющий собой двухмерное изображение трёхмерной структуры белка, в общем случае созданное из файла PDB
- Если поле image заполнено, следует использовать параметр image_source для того, чтобы обозначить структуру, использованную для генерации изображения, предпочтительно используя шаблон Шаблон:PDB2.
PDB
- This field is used to display a list of available PDB entries. Enter as a list of PDB templates, e.g., «
{{PDB2|1SNX}}, {{PDB2|2ETZ}}
»
HGNCid
- В этом поле вводится уникальный идентификатор белка по [www.gene.ucl.ac.uk/nomenclature/ HGNC (HUGO Gene Nomenclature Committee)].
MGIid
- В этом поле перечисляются уникальные идентификаторы проекта Mouse Genome Informatics .
Symbol
- В этом поле вводится официальный номенклатурный символ (аббревиатура) по [www.gene.ucl.ac.uk/nomenclature/ HGNC]. обратите внимание, что существует отдельный параметр Name.
AltSymbols
- В этом поле перечисляются альтернативные символы белка, используемые в публичных базах данных либо по литературным источникам.
OMIM
- В этом поле перечисляются уникальные идентификаторы по базе данных Mendelian Inheritance in Man.
ECnumber
- В этом поле вводится Шифр КФ.
Homologene
- В этом поле перечисляются уникальные идентификаторы по базе данных HomoloGene
GeneAtlas_image#
- В этом поле вводится название файла профиля экспрессии GeneAtlas, показывающая где именно ген экспрессируется во множестве тканей организма. Замените # на значение от 1 до 3.
Protein_domain_image
- В этом поле вводится путь к изображению структуры домена белка (необязательный параметр)
Function
- В этом поле перечисляются функции гена, в общем случае полученные по Генная онтология (en:Gene Ontology). Это поле может быть заполнено как список шаблонов GNF_GO, например «
{{GNF_GO|id=GO:0000166}}{{GNF_GO|id=GO:0004715}}
».
Component
- В этом поле перечисляются места функционирования белкав, в общем случае полученные по en:Gene Ontology. Это поле может быть заполнено как список шаблонов GNF_GO, например «
{{GNF_GO|id=GO:0000166}}{{GNF_GO|id=GO:0004715}}
»
Process
- В этом поле перечисляются функции белка, в общем случае полученные по en:Gene Ontology. Это поле может быть заполнено как список шаблонов GNF_GO, например «
{{GNF_GO|id=GO:0000166}}{{GNF_GO|id=GO:0004715}}
»
Orthologs
- В этом вводятся видоспецифичные идентификаторы белков других организмов. В этом поле должен использоваться шаблон GNF_Ortholog_box.
Path
- Если присутствует этот параметр, то внизу шаблона появятся ссылки "смотреть/обсуждать/редактировать", ведущие к данному, конкретному шаблону. В норме шаблон называется "PBB/<entrez id>", где <entrez id> в норме представляет собой Hs_EntrezGene (номер доступа EntrezGene).
IUPHAR
- При устанвке значения "yes", появится ссылка на страницу International Union of Basic and Clinical Pharmacology, содержащая информацию об этом белке (обычно для рецепторов или ионных каналов).
ChEMBL
- В этом поле перечисляются уникальны идентификаторы бызы данных ChEMBL.
См. также
Во избежание поломок страниц, использующих данный шаблон, желательно экспериментировать в своём личном пространстве.