Шаблон:Infobox protein family

Infobox protein family
Идентификаторы
Символ	?
Pfam
Pfam clan
InterPro
SMART
PROSITE
MEROPS
SCOP
SUPERFAMILY
TCDB
OPM superfamily
OPM protein
CAZy
CDD

[просмотр] [править] [история] [обновить]

 Документация

---

Это шаблон для семейств белков/доменов as defined in biological databases such as Pfam.

Использование

To use this template, copy the following text and paste it at the top of your article. Fill in as many fields as possible, but don't worry if some information is missing.

{{Infobox protein family
| Symbol = 
| Name = 
| image = 
| width = 
| caption = 
| Pfam = 
| Pfam_clan = 
| InterPro = 
| SMART = 
| PROSITE = 
| MEROPS =
| SCOP = 
| TCDB = 
| OPM family = 
| OPM protein = 
| CAZy = 
| CDD =
}}

Пример

Заполнение данной таблици генерирует следующий шаблон: см. справа

Ligand-binding domain (LBD)
RORγ
Идентификаторы
Символ	Hormone_recep
Pfam	[pfam.xfam.org/family?acc=PF00104 PF00104]
Pfam clan
InterPro	[www.ebi.ac.uk/interpro/entry/IPR000536 IPR000536]
SMART	[smart.embl-heidelberg.de/smart/do_annotation.pl?DOMAIN=SM00430 SM00430]
PROSITE
MEROPS
SCOP	[scop.mrc-lmb.cam.ac.uk/scop/search.cgi?tlev=fa;&pdb=1lbd 1lbd]
SUPERFAMILY	[supfam.org/SUPERFAMILY/cgi-bin/search.cgi?search_field=1lbd 1lbd]
TCDB
OPM superfamily
OPM protein
CAZy
CDD	[www.ncbi.nlm.nih.gov/Structure/cdd/cddsrv.cgi?uid=cd06157 cd06157]
Доступные структуры белков: Pfam [pfam.sanger.ac.uk/family/PF00104?tab=pdbBlock структуры] PDB [www.rcsb.org/pdb/search/smartSubquery.do?smartSearchSubtype=PfamIdQuery&pfamID=PF00104 RCSB PDB]; [www.ebi.ac.uk/pdbe-srv/PDBeXplore/pfam/?pfam=PF00104 PDBe]; [pdbj.org/searchFor?query=PF00104 PDBj] PDBsum [www.ebi.ac.uk/thornton-srv/databases/cgi-bin/pdbsum/GetPfamStr.pl?pfam_id=PF00104 3D-модель]

{{Infobox protein family
| Symbol = Hormone_recep
| Name = Ligand-binding domain (LBD)
| image = RORC_3L0L.png
| width = 
| caption = [[RAR-related orphan receptor gamma|RORγ]]
| Pfam = PF00104
| InterPro = IPR000536
| SMART = SM00430
| PROSITE = 
| SCOP = 1lbd
| TCDB =
| OPM family =
| OPM protein =
| CDD = cd06157
}}

Параметры шаблона

This is template for a protein family/domain as defined in biological databases such as Pfam.

Параметры шаблона

Этот шаблон предпочитает блочное размещение параметров.

Параметр		Описание	Тип	Статус
Symbol	Symbol	без описания По умолчанию пусто Пример пусто Авто-значение пусто	Строка	необязательный
Name	Name	имя По умолчанию пусто Пример пусто Авто-значение пусто	Строка	необязательный
Image	image	имя файла По умолчанию пусто Пример пусто Авто-значение пусто	Страница	необязательный
Width	width	Ширина картинки По умолчанию пусто Пример пусто Авто-значение пусто	Строка	необязательный
Caption	caption	подпись под картинкой По умолчанию пусто Пример пусто Авто-значение пусто	Строка	необязательный
Pfam family identifier	Pfam	Автоматические ссылки на записи Pfam По умолчанию пусто Пример пусто Авто-значение пусто	Строка	необязательный
Pfam clan identifier	Pfam_clan	Автоматические ссылки на клановые записи Pfam;клан -группа родственных белковых семей. По умолчанию пусто Пример пусто Авто-значение пусто	Строка	необязательный
Interpro identifier	Interpro	Автоматические ссылки на статью в Interpro По умолчанию пусто Пример пусто Авто-значение пусто	Строка	необязательный
SMART accession number	SMART	Автоматические ссылки на информацию о домене в Simple Modular Architecture Research Tool По умолчанию пусто Пример пусто Авто-значение пусто	Строка	необязательный
PROSITE record identifier	PROSITE	Автоматические ссылки на поиск PROSITE По умолчанию пусто Пример пусто Авто-значение пусто	Строка	необязательный
MEROPS record identifier	MEROPS	Автоматические ссылки на записи MEROPS (MEROPS описание пептидаз и их ингибиторов) По умолчанию пусто Пример пусто Авто-значение пусто	Строка	необязательный
SCOP (PDB accession number)	SCOP	Given a PDB accession number, auto-links to a SCOP (Structural Classification of Proteins) family level page. Also generates an auto-link to a SCOP SUPERFAMILY record. По умолчанию пусто Пример пусто Авто-значение пусто	Строка	необязательный
TCDB identifier	TCDB	Автоматические ссылки на поиск идентификаторов в Transporter Classification Database По умолчанию пусто Пример пусто Авто-значение пусто	Строка	необязательный
OPM superfamily identifier	OPM family	Автоматические ссылки на описание белка в Orientations of Proteins in Membranes По умолчанию пусто Пример пусто Авто-значение пусто	Строка	необязательный
OPM protein identifier	OPM protein	значение идентификатора PDB; Автоматические ссылки на описание белка в Orientations of Proteins in Membranes По умолчанию пусто Пример пусто Авто-значение пусто	Строка	необязательный
CAZy family identifier	CAZy	Ссылка на описание семейства в Carbohydrate-Active enZYmes. По умолчанию пусто Пример пусто Авто-значение пусто	Строка	необязательный
CDD uid	CDD	Ссылка на Conserved Domain Database По умолчанию пусто Пример пусто Авто-значение пусто	Строка	необязательный

Во избежание поломок страниц, использующих данный шаблон, желательно экспериментировать в своём личном пространстве.