Ku

Поделись знанием:
Перейти к: навигация, поиск
Перекрестно-комплементирующий белок репарации рентгеновских повреждений 5
Кристаллическая структура белка Ku человека, связанного с ДНК. Ku70 показан пурпурным, Ku80 синим, а цепочки ДНК зеленым.[1]
Обозначения
Символы [www.genenames.org/data/hgnc_data.php?hgnc_id=HGNC:12833 XRCC5]; Ku80
Entrez Gene [www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=gene&cmd=retrieve&dopt=default&list_uids=7520&rn=1 7520]
HGNC [www.genenames.org/data/hgnc_data.php?hgnc_id=12833 12833]
OMIM [www.ncbi.nlm.nih.gov/omim/194364 194364]
PDB [www.pdb.org/pdb/cgi/explore.cgi?pdbId=1JEY 1JEY]
RefSeq [genome.ucsc.edu/cgi-bin/hgTracks?Submit=Submit&position=NM_021141&rn=1 NM_021141]
UniProt [www.uniprot.org/uniprot/P13010 P13010]
Другие данные
Локус 2-я хр., [www.ncbi.nlm.nih.gov/Omim/getmap.cgi?chromosome=2q35 2q35]
Перекрестно-комплементирующий белок репарации рентгеновских повреждений 6
Обозначения
Символы [www.genenames.org/data/hgnc_data.php?hgnc_id=HGNC:4055 XRCC6]; Ku70, G22P1
Entrez Gene [www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=gene&cmd=retrieve&dopt=default&list_uids=2547&rn=1 2547]
HGNC [www.genenames.org/data/hgnc_data.php?hgnc_id=4055 4055]
OMIM [www.ncbi.nlm.nih.gov/omim/152690 152690]
PDB [www.pdb.org/pdb/cgi/explore.cgi?pdbId=1JEY 1JEY]
RefSeq [genome.ucsc.edu/cgi-bin/hgTracks?Submit=Submit&position=NM_001469&rn=1 NM_001469]
UniProt [www.uniprot.org/uniprot/P12956 P12956]
Другие данные
Локус 22-я хр., [www.ncbi.nlm.nih.gov/Omim/getmap.cgi?chromosome=22q11 22q11] -q13

Ku — белок, связывающийся с двуцепочечными разрывами в структуре ДНК. Ku необходим для репарации ДНК по пути негомологичного соединения концов (NHEJ). Эволюционно Ku консервативен от бактерий до человека. Древний бактериальный Ku является гомодимером,[2] эукариотический гомолог Ku — гетеродимер, состоящий из двух полипептидов — Ku70 (продукт гена XRCC6) и Ku80 (закодирован геном XRCC5), молекулярная масса этих полипептидов составляет 70 и 80 кДа, соответственно. Субъединицы Ku образуют корзиноподобную структуру, закрепляющуюся на конце молекулы ДНК.[3] После связывания Ku может скользить по цепочке ДНК, на конец которой могут нанизываться новые молекулы Ku. У высших эукариот Ku образует комплекс с каталитической субъединицей ДНК-зависимой протеинкиназы (DNA-PKcs) и образует полную ДНК-зависимую протеинкиназу, DNA-PK.[4] Ku, по-видимому, функционирует как молекулярный остов, к которому прикрепляются другие белки, принимающие участие в процессе NHEJ.

Обе субъединицы Ku были экспериментально удалены из генома мыши. Такие мыши имели различные хромосомные перестройки, что указывает на необходимость NHEJ для поддержания целостности генома.[5][6]

Во многих организмах Ku имеет дополнительные функции по поддержанию структуры теломер.[7]

Обилие Ku80 по-видимому, влияет на продолжительность жизни организмов.[8]

Напишите отзыв о статье "Ku"



Примечания

  1. PDB [www.rcsb.org/pdb/explore/explore.do?structureId=1JEY 1JEY]; Walker JR, Corpina RA, Goldberg J (August 2001). «Structure of the Ku heterodimer bound to DNA and its implications for double-strand break repair». Nature 412 (6847): 607–14. DOI:10.1038/35088000. PMID 11493912.
  2. Doherty AJ, Jackson SP, Weller GR (July 2001). «Identification of bacterial homologues of the Ku DNA repair proteins». FEBS Lett. 500 (3): 186–8. DOI:10.1016/S0014-5793(01)02589-3. PMID 11445083.
  3. Walker JR, Corpina RA, Goldberg J (August 2001). «Structure of the Ku heterodimer bound to DNA and its implications for double-strand break repair». Nature 412 (6847): 607–14. DOI:10.1038/35088000. PMID 11493912.
  4. Carter T, Vancurová I, Sun I, Lou W, DeLeon S (December 1990). «A DNA-activated protein kinase from HeLa cell nuclei». Mol. Cell. Biol. 10 (12): 6460–71. PMID 2247066.
  5. Difilippantonio MJ, Zhu J, Chen HT, Meffre E, Nussenzweig MC, Max EE, Ried T, Nussenzweig A (March 2000). «DNA repair protein Ku80 suppresses chromosomal aberrations and malignant transformation». Nature 404 (6777): 510–4. DOI:10.1038/35006670. PMID 10761921. Проверено 2009-07-16.
  6. Ferguson DO, Sekiguchi JM, Chang S, Frank KM, Gao Y, DePinho RA, Alt FW (June 2000). «The nonhomologous end-joining pathway of DNA repair is required for genomic stability and the suppression of translocations». Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 97 (12): 6630–3. DOI:10.1073/pnas.110152897. PMID 10823907.
  7. Boulton SJ, Jackson SP (March 1998). «Components of the Ku-dependent non-homologous end-joining pathway are involved in telomeric length maintenance and telomeric silencing». EMBO J. 17 (6): 1819–28. DOI:10.1093/emboj/17.6.1819. PMID 9501103.
  8. Lorenzini A, Johnson FB, Oliver A, Tresini M, Smith JS, Hdeib M, Sell C, Cristofalo VJ, Stamato TD (Nov-Dec 2009). «Significant correlation of species longevity with DNA double strand break recognition but not with telomere length». Mech Ageing Dev. 130 (11-12): 784–92. DOI:10.1016/j.mad.2009.10.004. PMID 19896964.


Отрывок, характеризующий Ku

Но в это время вошел адъютант и что то доложил Даву.
Даву вдруг просиял при известии, сообщенном адъютантом, и стал застегиваться. Он, видимо, совсем забыл о Пьере.
Когда адъютант напомнил ему о пленном, он, нахмурившись, кивнул в сторону Пьера и сказал, чтобы его вели. Но куда должны были его вести – Пьер не знал: назад в балаган или на приготовленное место казни, которое, проходя по Девичьему полю, ему показывали товарищи.
Он обернул голову и видел, что адъютант переспрашивал что то.
– Oui, sans doute! [Да, разумеется!] – сказал Даву, но что «да», Пьер не знал.
Пьер не помнил, как, долго ли он шел и куда. Он, в состоянии совершенного бессмыслия и отупления, ничего не видя вокруг себя, передвигал ногами вместе с другими до тех пор, пока все остановились, и он остановился. Одна мысль за все это время была в голове Пьера. Это была мысль о том: кто, кто же, наконец, приговорил его к казни. Это были не те люди, которые допрашивали его в комиссии: из них ни один не хотел и, очевидно, не мог этого сделать. Это был не Даву, который так человечески посмотрел на него. Еще бы одна минута, и Даву понял бы, что они делают дурно, но этой минуте помешал адъютант, который вошел. И адъютант этот, очевидно, не хотел ничего худого, но он мог бы не войти. Кто же это, наконец, казнил, убивал, лишал жизни его – Пьера со всеми его воспоминаниями, стремлениями, надеждами, мыслями? Кто делал это? И Пьер чувствовал, что это был никто.
Это был порядок, склад обстоятельств.
Порядок какой то убивал его – Пьера, лишал его жизни, всего, уничтожал его.


От дома князя Щербатова пленных повели прямо вниз по Девичьему полю, левее Девичьего монастыря и подвели к огороду, на котором стоял столб. За столбом была вырыта большая яма с свежевыкопанной землей, и около ямы и столба полукругом стояла большая толпа народа. Толпа состояла из малого числа русских и большого числа наполеоновских войск вне строя: немцев, итальянцев и французов в разнородных мундирах. Справа и слева столба стояли фронты французских войск в синих мундирах с красными эполетами, в штиблетах и киверах.
Преступников расставили по известному порядку, который был в списке (Пьер стоял шестым), и подвели к столбу. Несколько барабанов вдруг ударили с двух сторон, и Пьер почувствовал, что с этим звуком как будто оторвалась часть его души. Он потерял способность думать и соображать. Он только мог видеть и слышать. И только одно желание было у него – желание, чтобы поскорее сделалось что то страшное, что должно было быть сделано. Пьер оглядывался на своих товарищей и рассматривал их.
Два человека с края были бритые острожные. Один высокий, худой; другой черный, мохнатый, мускулистый, с приплюснутым носом. Третий был дворовый, лет сорока пяти, с седеющими волосами и полным, хорошо откормленным телом. Четвертый был мужик, очень красивый, с окладистой русой бородой и черными глазами. Пятый был фабричный, желтый, худой малый, лет восемнадцати, в халате.
Пьер слышал, что французы совещались, как стрелять – по одному или по два? «По два», – холодно спокойно отвечал старший офицер. Сделалось передвижение в рядах солдат, и заметно было, что все торопились, – и торопились не так, как торопятся, чтобы сделать понятное для всех дело, но так, как торопятся, чтобы окончить необходимое, но неприятное и непостижимое дело.
Чиновник француз в шарфе подошел к правой стороне шеренги преступников в прочел по русски и по французски приговор.
Потом две пары французов подошли к преступникам и взяли, по указанию офицера, двух острожных, стоявших с края. Острожные, подойдя к столбу, остановились и, пока принесли мешки, молча смотрели вокруг себя, как смотрит подбитый зверь на подходящего охотника. Один все крестился, другой чесал спину и делал губами движение, подобное улыбке. Солдаты, торопясь руками, стали завязывать им глаза, надевать мешки и привязывать к столбу.