shRNA
Малые РНК, образующие шпильки, или короткие РНК, образующие шпильки (англ. shRNA, small hairpin RNA, short hairpin RNA) — короткие молекулы рибонуклеиновых кислот, образующие во вторичной структуре плотные шпильки (структуры типа «стебель-петля»). ShRNA могут быть использованы для подавления экспрессии генов путём РНК-интерференции. Короткие РНК, образующие шпильки, вводят в клетки при помощи векторов, в которых кодирующие их последовательности находятся под контролем конститутивно активных (таких как U6) или индуцируемых промоторов. Такие векторы, как правило, содержат последовательности нуклеотидов, которые позволяют им интегрироваться в геном клетки и тем самым обеспечивать наследуемое подавление экспрессии целевого гена[1].
Малые РНК, образующие шпильки, транскрибируются РНК-полимеразой III. Образование shRNA в клетках млекопитающих иногда вызывает интерфероновый ответ для защиты клетки, как в случае вирусной атаки. Такие процессы не наблюдаются в случае miRNA (микроРНК), которые транскрибируются РНК-полимеразой II[2].
После завершения транскрипции малые РНК, образующие шпильки, разрезаются клеточными ферментами с образованием малых интерферирующих РНК (англ. siRNA). Малые интерферирующие РНК входят в состав РНК-индуцируемого комплекса выключения гена (RISC). Этот комплекс связывается с мРНК, участки которых комплементарны siRNA, и разрезает их.
Малые РНК, образующие шпильки, также используются и у растений. В таком случае традиционно используют конститувно активный промотор CaMV35S из вируса мозаики цветной капусты (англ. cauliflower mosaic virus 35S promoter)[3].
Напишите отзыв о статье "ShRNA"
Примечания
- ↑ Paddison P, Caudy A, Bernstein E, Hannon G, Conklin D (2002). «[www.genesdev.org/cgi/content/full/16/8/948 Short hairpin RNAs (shRNAs) induce sequence-specific silencing in mammalian cells]». Genes Dev. 16 (8): 948–58. DOI:10.1101/gad.981002. PMID 11959843.
- ↑ Cao W, Hunter R, Strnatka D, McQueen C, Erickson R (2005). «[jag.igr.poznan.pl/2005-Volume-46/2/pdf/2005_Volume_46_2-217-225.pdf DNA constructs designed to produce short hairpin, interfering RNAs in transgenic mice sometimes show early lethality and an interferon response]». J. Appl. Genet. 46 (2): 217–25. PMID 15876690.
- ↑ McIntyre G, Fanning G (2006). «[www.pubmedcentral.gov/articlerender.fcgi?tool=pmcentrez&artid=1343552 Design and cloning strategies for constructing shRNA expression vectors]». BMC Biotechnol. 6: 1. DOI:10.1186/1472-6750-6-1. PMID 16396676.
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
Это заготовка статьи по молекулярной биологии. Вы можете помочь проекту, дополнив её. |
Отрывок, характеризующий ShRNA
Ростов в эту ночь был со взводом во фланкёрской цепи, впереди отряда Багратиона. Гусары его попарно были рассыпаны в цепи; сам он ездил верхом по этой линии цепи, стараясь преодолеть сон, непреодолимо клонивший его. Назади его видно было огромное пространство неясно горевших в тумане костров нашей армии; впереди его была туманная темнота. Сколько ни вглядывался Ростов в эту туманную даль, он ничего не видел: то серелось, то как будто чернелось что то; то мелькали как будто огоньки, там, где должен быть неприятель; то ему думалось, что это только в глазах блестит у него. Глаза его закрывались, и в воображении представлялся то государь, то Денисов, то московские воспоминания, и он опять поспешно открывал глаза и близко перед собой он видел голову и уши лошади, на которой он сидел, иногда черные фигуры гусар, когда он в шести шагах наезжал на них, а вдали всё ту же туманную темноту. «Отчего же? очень может быть, – думал Ростов, – что государь, встретив меня, даст поручение, как и всякому офицеру: скажет: „Поезжай, узнай, что там“. Много рассказывали же, как совершенно случайно он узнал так какого то офицера и приблизил к себе. Что, ежели бы он приблизил меня к себе! О, как бы я охранял его, как бы я говорил ему всю правду, как бы я изобличал его обманщиков», и Ростов, для того чтобы живо представить себе свою любовь и преданность государю, представлял себе врага или обманщика немца, которого он с наслаждением не только убивал, но по щекам бил в глазах государя. Вдруг дальний крик разбудил Ростова. Он вздрогнул и открыл глаза.
«Где я? Да, в цепи: лозунг и пароль – дышло, Ольмюц. Экая досада, что эскадрон наш завтра будет в резервах… – подумал он. – Попрошусь в дело. Это, может быть, единственный случай увидеть государя. Да, теперь недолго до смены. Объеду еще раз и, как вернусь, пойду к генералу и попрошу его». Он поправился на седле и тронул лошадь, чтобы еще раз объехать своих гусар. Ему показалось, что было светлей. В левой стороне виднелся пологий освещенный скат и противоположный, черный бугор, казавшийся крутым, как стена. На бугре этом было белое пятно, которого никак не мог понять Ростов: поляна ли это в лесу, освещенная месяцем, или оставшийся снег, или белые дома? Ему показалось даже, что по этому белому пятну зашевелилось что то. «Должно быть, снег – это пятно; пятно – une tache», думал Ростов. «Вот тебе и не таш…»
