SPATA7

Поделись знанием:
Перейти к: навигация, поиск
Связанный со сперматогенезом белок 7
Идентификаторы
Символ[www.genenames.org/cgi-bin/gene_symbol_report?hgnc_id=20423 SPATA7] ; HSD-3.1; HSD3; LCA3
Внешние IDOMIM: [omim.org/entry/609868 609868 ] MGI: [www.informatics.jax.org/searches/accession_report.cgi?id=MGI:2144877 2144877 ] HomoloGene: [www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?cmd=Retrieve&db=homologene&dopt=HomoloGene&list_uids=10189 10189 ] GeneCards: [www.genecards.org/cgi-bin/carddisp.pl?id_type=entrezgene&id=55812 SPATA7 Gene]
Профиль экспрессии РНК
[biogps.org/gene/55812/ Больше информации]
Ортологи
ВидЧеловекМышь
Entrez[www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=gene&cmd=retrieve&dopt=default&list_uids=55812&rn=1 55812][www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=gene&cmd=retrieve&dopt=default&list_uids=104871&rn=1 104871]
Ensembl[www.ensembl.org/Homo_sapiens/geneview?gene=ENSG00000042317;db=core ENSG00000042317][www.ensembl.org/Mus_musculus/geneview?gene=ENSMUSG00000021007;db=core ENSMUSG00000021007]
UniProt[www.expasy.org/uniprot/Q9P0W8 Q9P0W8][www.expasy.org/uniprot/Q80VP2 Q80VP2]
RefSeq (мРНК)[www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/viewer.fcgi?val=NM_001040428 NM_001040428][www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/viewer.fcgi?val=NM_178914 NM_178914]
RefSeq (белок)[www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/viewer.fcgi?val=NP_001035518 NP_001035518][www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/viewer.fcgi?val=NP_849245 NP_849245]
Локус (UCSC)[genome.ucsc.edu/cgi-bin/hgTracks?org=Human&db=hg19&position=chr14:88851268-88936694 Chr 14:
88.85 – 88.94 Mb]
[genome.ucsc.edu/cgi-bin/hgTracks?org=Mouse&db=mm9&position=chr12:98628157-98669815 Chr 12:
98.63 – 98.67 Mb]
Поиск в PubMed[www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/entrez?db=gene&cmd=Link&LinkName=gene_pubmed&from_uid=55812][www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/entrez?db=gene&cmd=Link&LinkName=gene_pubmed&from_uid=104871]

Связанный со сперматогенезом белок 7 (англ. Spermatogenesis-associated protein 7) — белок, что у человека кодируется геном SPATA7.

Этот ген, первоначально выделенный из семенников, имеет отношение также к сетчатке. Мутации в этом гене связаны с врожденным амаврозом Лебера и пигментным ретинитом несовершеннолетних. Альтернативные варианты транскриптов сплайсинга, кодирующих различные изоформы, были найдены для этого гена.[1]

Напишите отзыв о статье "SPATA7"



Примечания

  1. [www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/entrez?Db=gene&Cmd=ShowDetailView&TermToSearch=55812 Entrez Gene: SPATA7 spermatogenesis associated 7].

Литература

  • Maruyama K, Sugano S (1994). «Oligo-capping: a simple method to replace the cap structure of eukaryotic mRNAs with oligoribonucleotides.». Gene 138 (1-2): 171–4. DOI:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID 8125298.
  • Suzuki Y, Yoshitomo-Nakagawa K, Maruyama K, et al. (1997). «Construction and characterization of a full length-enriched and a 5'-end-enriched cDNA library.». Gene 200 (1-2): 149–56. DOI:10.1016/S0378-1119(97)00411-3. PMID 9373149.
  • Hartley JL, Temple GF, Brasch MA (2001). «DNA cloning using in vitro site-specific recombination.». Genome Res. 10 (11): 1788–95. DOI:10.1101/gr.143000. PMID 11076863.
  • Wiemann S, Weil B, Wellenreuther R, et al. (2001). «Toward a catalog of human genes and proteins: sequencing and analysis of 500 novel complete protein coding human cDNAs.». Genome Res. 11 (3): 422–35. DOI:10.1101/gr.GR1547R. PMID 11230166.
  • Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Generation and initial analysis of more than 15,000 full-length human and mouse cDNA sequences.». Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 99 (26): 16899–903. DOI:10.1073/pnas.242603899. PMID 12477932.
  • Heilig R, Eckenberg R, Petit JL, et al. (2003). «The DNA sequence and analysis of human chromosome 14.». Nature 421 (6923): 601–7. DOI:10.1038/nature01348. PMID 12508121.
  • Zhang X, Liu H, Zhang Y, et al. (2004). «A novel gene, RSD-3/HSD-3.1, encodes a meiotic-related protein expressed in rat and human testis.». J. Mol. Med. 81 (6): 380–7. DOI:10.1007/s00109-003-0434-y. PMID 12736779.
  • Ota T, Suzuki Y, Nishikawa T, et al. (2004). «Complete sequencing and characterization of 21,243 full-length human cDNAs.». Nat. Genet. 36 (1): 40–5. DOI:10.1038/ng1285. PMID 14702039.
  • Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA, et al. (2004). «The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).». Genome Res. 14 (10B): 2121–7. DOI:10.1101/gr.2596504. PMID 15489334.
  • Wiemann S, Arlt D, Huber W, et al. (2004). «From ORFeome to biology: a functional genomics pipeline.». Genome Res. 14 (10B): 2136–44. DOI:10.1101/gr.2576704. PMID 15489336.
  • Mehrle A, Rosenfelder H, Schupp I, et al. (2006). «The LIFEdb database in 2006.». Nucleic Acids Res. 34 (Database issue): D415–8. DOI:10.1093/nar/gkj139. PMID 16381901.

Отрывок, характеризующий SPATA7

В переднем ряду заколыхались крупы лошадей. Грачик потянул поводья и сам тронулся.
Справа Ростов видел первые ряды своих гусар, а еще дальше впереди виднелась ему темная полоса, которую он не мог рассмотреть, но считал неприятелем. Выстрелы были слышны, но в отдалении.
– Прибавь рыси! – послышалась команда, и Ростов чувствовал, как поддает задом, перебивая в галоп, его Грачик.
Он вперед угадывал его движения, и ему становилось все веселее и веселее. Он заметил одинокое дерево впереди. Это дерево сначала было впереди, на середине той черты, которая казалась столь страшною. А вот и перешли эту черту, и не только ничего страшного не было, но всё веселее и оживленнее становилось. «Ох, как я рубану его», думал Ростов, сжимая в руке ефес сабли.
– О о о а а а!! – загудели голоса. «Ну, попадись теперь кто бы ни был», думал Ростов, вдавливая шпоры Грачику, и, перегоняя других, выпустил его во весь карьер. Впереди уже виден был неприятель. Вдруг, как широким веником, стегнуло что то по эскадрону. Ростов поднял саблю, готовясь рубить, но в это время впереди скакавший солдат Никитенко отделился от него, и Ростов почувствовал, как во сне, что продолжает нестись с неестественною быстротой вперед и вместе с тем остается на месте. Сзади знакомый гусар Бандарчук наскакал на него и сердито посмотрел. Лошадь Бандарчука шарахнулась, и он обскакал мимо.
«Что же это? я не подвигаюсь? – Я упал, я убит…» в одно мгновение спросил и ответил Ростов. Он был уже один посреди поля. Вместо двигавшихся лошадей и гусарских спин он видел вокруг себя неподвижную землю и жнивье. Теплая кровь была под ним. «Нет, я ранен, и лошадь убита». Грачик поднялся было на передние ноги, но упал, придавив седоку ногу. Из головы лошади текла кровь. Лошадь билась и не могла встать. Ростов хотел подняться и упал тоже: ташка зацепилась за седло. Где были наши, где были французы – он не знал. Никого не было кругом.
Высвободив ногу, он поднялся. «Где, с какой стороны была теперь та черта, которая так резко отделяла два войска?» – он спрашивал себя и не мог ответить. «Уже не дурное ли что нибудь случилось со мной? Бывают ли такие случаи, и что надо делать в таких случаях?» – спросил он сам себя вставая; и в это время почувствовал, что что то лишнее висит на его левой онемевшей руке. Кисть ее была, как чужая. Он оглядывал руку, тщетно отыскивая на ней кровь. «Ну, вот и люди, – подумал он радостно, увидав несколько человек, бежавших к нему. – Они мне помогут!» Впереди этих людей бежал один в странном кивере и в синей шинели, черный, загорелый, с горбатым носом. Еще два и еще много бежало сзади. Один из них проговорил что то странное, нерусское. Между задними такими же людьми, в таких же киверах, стоял один русский гусар. Его держали за руки; позади его держали его лошадь.