Синдекан 4
| Синдекан 4 | |||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
 PDB прорисовано на основе 1ejp. | |||||||||||||
| |||||||||||||
| Идентификаторы | |||||||||||||
| Символ | [www.genenames.org/cgi-bin/gene_symbol_report?hgnc_id=10661 SDC4] ; SYND4 | ||||||||||||
| Внешние ID | OMIM: [omim.org/entry/600017 600017 ] MGI: [www.informatics.jax.org/searches/accession_report.cgi?id=MGI:1349164 1349164 ] HomoloGene: [www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?cmd=Retrieve&db=homologene&dopt=HomoloGene&list_uids=31121 31121 ] GeneCards: [www.genecards.org/cgi-bin/carddisp.pl?id_type=entrezgene&id=6385 SDC4 Gene] | ||||||||||||
| |||||||||||||
| Профиль экспрессии РНК | |||||||||||||
 | |||||||||||||
| [biogps.org/gene/6385/ Больше информации] | |||||||||||||
| Ортологи | |||||||||||||
| Вид | Человек | Мышь | |||||||||||
| Entrez | [www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=gene&cmd=retrieve&dopt=default&list_uids=6385&rn=1 6385] | [www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=gene&cmd=retrieve&dopt=default&list_uids=20971&rn=1 20971] | |||||||||||
| Ensembl | [www.ensembl.org/Homo_sapiens/geneview?gene=ENSG00000124145;db=core ENSG00000124145] | [www.ensembl.org/Mus_musculus/geneview?gene=ENSMUSG00000017009;db=core ENSMUSG00000017009] | |||||||||||
| UniProt | [www.expasy.org/uniprot/P31431 P31431] | [www.expasy.org/uniprot/O35988 O35988] | |||||||||||
| RefSeq (мРНК) | [www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/viewer.fcgi?val=NM_002999 NM_002999] | [www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/viewer.fcgi?val=NM_011521 NM_011521] | |||||||||||
| RefSeq (белок) | [www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/viewer.fcgi?val=NP_002990 NP_002990] | [www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/viewer.fcgi?val=NP_035651 NP_035651] | |||||||||||
| Локус (UCSC) | [genome.ucsc.edu/cgi-bin/hgTracks?org=Human&db=hg19&position=chr20:43953928-43977064 Chr 20: 43.95 – 43.98 Mb] | [genome.ucsc.edu/cgi-bin/hgTracks?org=Mouse&db=mm10&position=chr2:164424247-164443887 Chr 2: 164.42 – 164.44 Mb] | |||||||||||
| Поиск в PubMed | [www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/entrez?db=gene&cmd=Link&LinkName=gene_pubmed&from_uid=6385] | [www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/entrez?db=gene&cmd=Link&LinkName=gene_pubmed&from_uid=20971] | |||||||||||
Содержание
Функции
Белок является трансмембранным гепарансульфатпротеогликаном, входит в семейство синдеканов. Синдеканы опосредуют связывание клеток, передачу сигнала в клетке и организацию цитоскелета. Являются рецепторами для Tat-белка вируса ВИЧ. Синдекан 4, также как синдекан 2, несёт гепарансульфатные цепи, которые обеспечивают связь цитоскелета с внеклеточным матриксом.
Взаимодействует с белками GIPC, NUDT16L1, CDCP1 и SDCBP. [1]
Структура
Зрелый белок состоит из 180 аминокислот, молекулярная масса белковой части — 21,6 кДа. Включает N-концевой внеклеточный домен (127 аминокислот), единственный спиральный трансмембранный фрагмент и небольшой цитозольный участок. На внеклеточном домене находится 3 участка присоединения O-гепарансульфатных цепей.
- PDB 1ejp EBI.jpg
Структура растворимого фрагмента синдекана 4 (16-мер).
- PDB 1ejq EBI.jpg
Изменение структуры растворимого фрагмента синдекана 4 в присутствии фосфатидилинозитола-4,5-дифосфата.
Тканевая специфичность
Экспрессирован на эпителиальных клетках и фибробластах.
Остеоартрит
Уровень синдекана 4 повышен при остеоартрите. В модельных экспериментах на мышах было показано, что ингибирование этого белка снижает разрушение хряща, вызванного остеоартритом.[2]
См. также
Напишите отзыв о статье "Синдекан 4"
Примечания
- ↑ [www.uniprot.org/uniprot/P31431 uniprot P31431]
- ↑ Hass MJ (Sept 2009). «SDC4: OA joint effort». SciBX 2 (34). DOI:10.1038/scibx.2009.1297.
Литература
- Oh ES, Couchman JR (April 2004). «Syndecans-2 and -4; close cousins, but not identical twins». Mol. Cells 17 (2): 181–7. PMID 15179029.
- Wilcox-Adelman SA, Denhez F, Iwabuchi T, Saoncella S, Calautti E, Goetinck PF (2002). «Syndecan-4: dispensable or indispensable?». Glycoconj. J. 19 (4-5): 305–13. DOI:10.1023/A:1025304602057. PMID 12975609.
- Bass MD, Humphries MJ (November 2002). «Cytoplasmic interactions of syndecan-4 orchestrate adhesion receptor and growth factor receptor signalling». Biochem. J. 368 (Pt 1): 1–15. DOI:10.1042/BJ20021228. PMID 12241528.
- Woods A, Couchman JR (October 2001). «Syndecan-4 and focal adhesion function». Curr. Opin. Cell Biol. 13 (5): 578–83. PMID 11544026.
Ссылки
- [www.cellbiol.ru/book/kletka/matriks Клеточный матрикс. Синдекан.]
Отрывок, характеризующий Синдекан 4
– Пожалуйте, милости просим, братец покойника, – царство небесное! – Макар Алексеевич остались, да, как изволите знать, они в слабости, – сказал старый слуга.Макар Алексеевич был, как знал Пьер, полусумасшедший, пивший запоем брат Иосифа Алексеевича.
– Да, да, знаю. Пойдем, пойдем… – сказал Пьер и вошел в дом. Высокий плешивый старый человек в халате, с красным носом, в калошах на босу ногу, стоял в передней; увидав Пьера, он сердито пробормотал что то и ушел в коридор.
– Большого ума были, а теперь, как изволите видеть, ослабели, – сказал Герасим. – В кабинет угодно? – Пьер кивнул головой. – Кабинет как был запечатан, так и остался. Софья Даниловна приказывали, ежели от вас придут, то отпустить книги.
Пьер вошел в тот самый мрачный кабинет, в который он еще при жизни благодетеля входил с таким трепетом. Кабинет этот, теперь запыленный и нетронутый со времени кончины Иосифа Алексеевича, был еще мрачнее.
Герасим открыл один ставень и на цыпочках вышел из комнаты. Пьер обошел кабинет, подошел к шкафу, в котором лежали рукописи, и достал одну из важнейших когда то святынь ордена. Это были подлинные шотландские акты с примечаниями и объяснениями благодетеля. Он сел за письменный запыленный стол и положил перед собой рукописи, раскрывал, закрывал их и, наконец, отодвинув их от себя, облокотившись головой на руки, задумался.
Несколько раз Герасим осторожно заглядывал в кабинет и видел, что Пьер сидел в том же положении. Прошло более двух часов. Герасим позволил себе пошуметь в дверях, чтоб обратить на себя внимание Пьера. Пьер не слышал его.
– Извозчика отпустить прикажете?
– Ах, да, – очнувшись, сказал Пьер, поспешно вставая. – Послушай, – сказал он, взяв Герасима за пуговицу сюртука и сверху вниз блестящими, влажными восторженными глазами глядя на старичка. – Послушай, ты знаешь, что завтра будет сражение?..
– Сказывали, – отвечал Герасим.
– Я прошу тебя никому не говорить, кто я. И сделай, что я скажу…
– Слушаюсь, – сказал Герасим. – Кушать прикажете?
– Нет, но мне другое нужно. Мне нужно крестьянское платье и пистолет, – сказал Пьер, неожиданно покраснев.
– Слушаю с, – подумав, сказал Герасим.
Весь остаток этого дня Пьер провел один в кабинете благодетеля, беспокойно шагая из одного угла в другой, как слышал Герасим, и что то сам с собой разговаривая, и ночевал на приготовленной ему тут же постели.
Герасим с привычкой слуги, видавшего много странных вещей на своем веку, принял переселение Пьера без удивления и, казалось, был доволен тем, что ему было кому услуживать. Он в тот же вечер, не спрашивая даже и самого себя, для чего это было нужно, достал Пьеру кафтан и шапку и обещал на другой день приобрести требуемый пистолет. Макар Алексеевич в этот вечер два раза, шлепая своими калошами, подходил к двери и останавливался, заискивающе глядя на Пьера. Но как только Пьер оборачивался к нему, он стыдливо и сердито запахивал свой халат и поспешно удалялся. В то время как Пьер в кучерском кафтане, приобретенном и выпаренном для него Герасимом, ходил с ним покупать пистолет у Сухаревой башни, он встретил Ростовых.
1 го сентября в ночь отдан приказ Кутузова об отступлении русских войск через Москву на Рязанскую дорогу.
Первые войска двинулись в ночь. Войска, шедшие ночью, не торопились и двигались медленно и степенно; но на рассвете двигавшиеся войска, подходя к Дорогомиловскому мосту, увидали впереди себя, на другой стороне, теснящиеся, спешащие по мосту и на той стороне поднимающиеся и запружающие улицы и переулки, и позади себя – напирающие, бесконечные массы войск. И беспричинная поспешность и тревога овладели войсками. Все бросилось вперед к мосту, на мост, в броды и в лодки. Кутузов велел обвезти себя задними улицами на ту сторону Москвы.
