SMART (база данных)
| Содержимое | |
|---|---|
| Описание |
Биоинформатический ресурс для идентификации белковых доменов. |
| Организмы |
Все |
| Контакты | |
| Исследовательский центр | |
| Лаборатория |
[www.embl.de/ EMBL] |
| Оригинальная публикация | |
| Сайт |
[smart.embl-heidelberg.de/ mbl-heidelberg.de] |
| Лицензия |
Free to academics, but not commercial users |
| Версия |
7 |
| Curation policy |
Да |
SMART (Simple Modular Architecture Research Tool) — база данных, используемая при идентификации и анализе белковых доменов в белковых последовательностях [1][2]. SMART использует для обнаружения доменов в белковых последовательностях алгоритм, основанный на примерении скрытых марковских моделей ко множественным выравниваниям. По данным на январь 2012 года SMART содержала модели 1009 доменов [3]. Данные SMART использовались при создании Базы Консервативных Доменов (CDD, Conserved Domain Database) и также представляются как часть базы данных InterPro.[4]
База данных организована Европейской молекулярно-биологической лабораторией в Гейдельберге.
См. также
Напишите отзыв о статье "SMART (база данных)"
Ссылки
- [smart.embl-heidelberg.de/ SMART web site]
Примечания
- ↑ Schultz J, Milpetz F, Bork P, Ponting CP (May 1998). «SMART, a simple modular architecture research tool: identification of signaling domains». Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 95 (11): 5857–64. DOI:10.1073/pnas.95.11.5857. PMID 9600884.
- ↑ Letunic I, Doerks T, Bork P (January 2009). «SMART 6: recent updates and new developments». Nucleic Acids Res. 37 (Database issue): D229–32. DOI:10.1093/nar/gkn808. PMID 18978020.
- ↑ Letunic I, Doerks T, Bork P (January 2012). «SMART 7: recent updates to the protein domain annotation resource». Nucleic Acids Res. 40 (Database issue): D302–5. DOI:10.1093/nar/gkr931. PMID 22053084.
- ↑ Mulder NJ, Apweiler R, Attwood TK, et al. (September 2002). «InterPro: an integrated documentation resource for protein families, domains and functional sites». Brief. Bioinformatics 3 (3): 225–35. DOI:10.1093/bib/3.3.225. PMID 12230031.
Отрывок, характеризующий SMART (база данных)
Как ни мало занимался Николай Соней за это время, но что то как бы оторвалось в нем, когда он услыхал это. Долохов был приличная и в некоторых отношениях блестящая партия для бесприданной сироты Сони. С точки зрения старой графини и света нельзя было отказать ему. И потому первое чувство Николая, когда он услыхал это, было озлобление против Сони. Он приготавливался к тому, чтобы сказать: «И прекрасно, разумеется, надо забыть детские обещания и принять предложение»; но не успел он еще сказать этого…– Можешь себе представить! она отказала, совсем отказала! – заговорила Наташа. – Она сказала, что любит другого, – прибавила она, помолчав немного.
«Да иначе и не могла поступить моя Соня!» подумал Николай.
– Сколько ее ни просила мама, она отказала, и я знаю, она не переменит, если что сказала…
– А мама просила ее! – с упреком сказал Николай.
– Да, – сказала Наташа. – Знаешь, Николенька, не сердись; но я знаю, что ты на ней не женишься. Я знаю, Бог знает отчего, я знаю верно, ты не женишься.
– Ну, этого ты никак не знаешь, – сказал Николай; – но мне надо поговорить с ней. Что за прелесть, эта Соня! – прибавил он улыбаясь.
– Это такая прелесть! Я тебе пришлю ее. – И Наташа, поцеловав брата, убежала.
Через минуту вошла Соня, испуганная, растерянная и виноватая. Николай подошел к ней и поцеловал ее руку. Это был первый раз, что они в этот приезд говорили с глазу на глаз и о своей любви.
– Sophie, – сказал он сначала робко, и потом всё смелее и смелее, – ежели вы хотите отказаться не только от блестящей, от выгодной партии; но он прекрасный, благородный человек… он мой друг…
Соня перебила его.
– Я уж отказалась, – сказала она поспешно.
– Ежели вы отказываетесь для меня, то я боюсь, что на мне…
Соня опять перебила его. Она умоляющим, испуганным взглядом посмотрела на него.
– Nicolas, не говорите мне этого, – сказала она.
