Апратаксин

Поделись знанием:
Перейти к: навигация, поиск
Апратаксин
Доступные структуры
PDB Поиск ортологов: [www.ebi.ac.uk/pdbe/searchResults.html?display=both&term=Q7Z2E3%20or%20Q6JV85%20or%20P61797%20or%20Q7YRZ2%20or%20B1AXX6%20or%20Q7TQC5%20or%20Q8K4H4%20or%20P61799 PDBe], [www.rcsb.org/pdb/search/smartSubquery.do?smartSearchSubtype=UpAccessionIdQuery&accessionIdList=Q7Z2E3,Q6JV85,P61797,Q7YRZ2,B1AXX6,Q7TQC5,Q8K4H4,P61799 RCSB]
Идентификаторы
Символ[www.genenames.org/cgi-bin/gene_symbol_report?hgnc_id=15984 APTX] ; AOA; AOA1; AXA1; EAOH; EOAHA; FHA-HIT
Внешние IDOMIM: [omim.org/entry/606350 606350 ] MGI: [www.informatics.jax.org/searches/accession_report.cgi?id=MGI:1913658 1913658 ] HomoloGene: [www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?cmd=Retrieve&db=homologene&dopt=HomoloGene&list_uids=41634 41634 ] GeneCards: [www.genecards.org/cgi-bin/carddisp.pl?id_type=entrezgene&id=54840 APTX Gene]
Профиль экспрессии РНК
[biogps.org/gene/54840/ Больше информации]
Ортологи
ВидЧеловекМышь
Entrez[www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=gene&cmd=retrieve&dopt=default&list_uids=54840&rn=1 54840][www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=gene&cmd=retrieve&dopt=default&list_uids=66408&rn=1 66408]
Ensembl[www.ensembl.org/Homo_sapiens/geneview?gene=ENSG00000137074;db=core ENSG00000137074][www.ensembl.org/Mus_musculus/geneview?gene=ENSMUSG00000028411;db=core ENSMUSG00000028411]
UniProt[www.expasy.org/uniprot/Q7Z2E3 Q7Z2E3][www.expasy.org/uniprot/Q7TQC5 Q7TQC5]
RefSeq (мРНК)[www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/viewer.fcgi?val=NM_001195248 NM_001195248][www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/viewer.fcgi?val=NM_001025444 NM_001025444]
RefSeq (белок)[www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/viewer.fcgi?val=NP_001182177 NP_001182177][www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/viewer.fcgi?val=NP_001020615 NP_001020615]
Локус (UCSC)[genome.ucsc.edu/cgi-bin/hgTracks?org=Human&db=hg19&position=chr9:32972604-33025166 Chr 9:
32.97 – 33.03 Mb]
[genome.ucsc.edu/cgi-bin/hgTracks?org=Mouse&db=mm10&position=chr4:40682382-40703194 Chr 4:
40.68 – 40.7 Mb]
Поиск в PubMed[www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/entrez?db=gene&cmd=Link&LinkName=gene_pubmed&from_uid=54840][www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/entrez?db=gene&cmd=Link&LinkName=gene_pubmed&from_uid=66408]

Апратаксин белок, кодируемый у человека геном APTX [1][2][3].

Этот ген кодирует члена надсемейства гистидиновых триад (HIT), некоторые из которых имеют активность нуклеотидо-связанных и диаденозино-полифосфатных гидролаз. Кодируемый белок может играть роль в репарации одноцепочечной ДНК. Мутации в этом гене были связаны с атаксией с глазодвигательной апраксией. Были определены этого гена несколько вариантов транскриптов, кодирующих различные изоформы, однако, полная природа некоторых вариантов не была определена[3].





Функция

Апратаксин удаляет AMP от концов ДНК вслед за неудачными попытками лигирование ДНК-лигазы IV во время присоединения негомологичного конца[en], позволяя тем самым производить последующие попытки лигирования[4][5].

Взаимодействия

Апратаксин, как было выявлено, взаимодействует с:

Напишите отзыв о статье "Апратаксин"

Примечания

  1. Date H, Onodera O, Tanaka H, Iwabuchi K, Uekawa K, Igarashi S, Koike R, Hiroi T, Yuasa T, Awaya Y, Sakai T, Takahashi T, Nagatomo H, Sekijima Y, Kawachi I, Takiyama Y, Nishizawa M, Fukuhara N, Saito K, Sugano S, Tsuji S (Oct 2001). «Early-onset ataxia with ocular motor apraxia and hypoalbuminemia is caused by mutations in a new HIT superfamily gene». Nat Genet 29 (2): 184–8. DOI:10.1038/ng1001-184. PMID 11586299.
  2. Moreira MC, Barbot C, Tachi N, Kozuka N, Uchida E, Gibson T, Mendonca P, Costa M, Barros J, Yanagisawa T, Watanabe M, Ikeda Y, Aoki M, Nagata T, Coutinho P, Sequeiros J, Koenig M (Oct 2001). «The gene mutated in ataxia-ocular apraxia 1 encodes the new HIT/Zn-finger protein aprataxin». Nat Genet 29 (2): 189–93. DOI:10.1038/ng1001-189. PMID 11586300.
  3. 1 2 [www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/entrez?Db=gene&Cmd=ShowDetailView&TermToSearch=54840 Entrez Gene: APTX aprataxin].
  4. Rass U, Ahel I, West SC (December 2008). «Molecular mechanism of DNA deadenylation by the neurological disease protein aprataxin». J. Biol. Chem. 283 (49): 33994–4001. DOI:10.1074/jbc.M807124200. PMID 18836178.
  5. Reynolds JJ, El-Khamisy SF, Katyal S, Clements P, McKinnon PJ, Caldecott KW (March 2009). «Defective DNA ligation during short-patch single-strand break repair in ataxia oculomotor apraxia 1». Mol. Cell. Biol. 29 (5): 1354–62. DOI:10.1128/MCB.01471-08. PMID 19103743.
  6. 1 2 Date H, Igarashi S, Sano Y, Takahashi T, Takahashi T, Takano H, Tsuji S, Nishizawa M, Onodera O (December 2004). «The FHA domain of aprataxin interacts with the C-terminal region of XRCC1». Biochem. Biophys. Res. Commun. 325 (4): 1279–85. DOI:10.1016/j.bbrc.2004.10.162. PMID 15555565.
  7. 1 2 3 Gueven N, Becherel OJ, Kijas AW, Chen P, Howe O, Rudolph JH, Gatti R, Date H, Onodera O, Taucher-Scholz G, Lavin MF (May 2004). «Aprataxin, a novel protein that protects against genotoxic stress». Hum. Mol. Genet. 13 (10): 1081–93. DOI:10.1093/hmg/ddh122. PMID 15044383.
  8. Clements PM, Breslin C, Deeks ED, Byrd PJ, Ju L, Bieganowski P, Brenner C, Moreira MC, Taylor AM, Caldecott KW (November 2004). «The ataxia-oculomotor apraxia 1 gene product has a role distinct from ATM and interacts with the DNA strand break repair proteins XRCC1 and XRCC4». DNA Repair (Amst.) 3 (11): 1493–502. DOI:10.1016/j.dnarep.2004.06.017. PMID 15380105.

Литература

  • Aicardi J, Barbosa C, Andermann E (1989). «Ataxia-ocular motor apraxia: a syndrome mimicking ataxia-telangiectasia.». Ann. Neurol. 24 (4): 497–502. DOI:10.1002/ana.410240404. PMID 3239952.
  • Gascon GG, Abdo N, Sigut D (1995). «Ataxia-oculomotor apraxia syndrome.». J. Child Neurol. 10 (2): 118–22. DOI:10.1177/088307389501000210. PMID 7782601.
  • Hannan MA, Sigut D, Waghray M, Gascon GG (1995). «Ataxia-ocular motor apraxia syndrome: an investigation of cellular radiosensitivity of patients and their families.». J. Med. Genet. 31 (12): 953–6. DOI:10.1136/jmg.31.12.953. PMID 7891378.
  • Moreira MC, Barbot C, Tachi N (2001). «Homozygosity mapping of Portuguese and Japanese forms of ataxia-oculomotor apraxia to 9p13, and evidence for genetic heterogeneity.». Am. J. Hum. Genet. 68 (2): 501–8. DOI:10.1086/318191. PMID 11170899.
  • Brenner C (2002). «Hint, Fhit, and GalT: function, structure, evolution, and mechanism of three branches of the histidine triad superfamily of nucleotide hydrolases and transferases.». Biochemistry 41 (29): 9003–14. DOI:10.1021/bi025942q. PMID 12119013.
  • Shimazaki H, Takiyama Y, Sakoe K (2002). «Early-onset ataxia with ocular motor apraxia and hypoalbuminemia: the aprataxin gene mutations.». Neurology 59 (4): 590–5. DOI:10.1212/wnl.59.4.590. PMID 12196655.
  • Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH (2003). «Generation and initial analysis of more than 15,000 full-length human and mouse cDNA sequences.». Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 99 (26): 16899–903. DOI:10.1073/pnas.242603899. PMID 12477932.
  • Tranchant C, Fleury M, Moreira MC (2004). «Phenotypic variability of aprataxin gene mutations.». Neurology 60 (5): 868–70. DOI:10.1212/01.wnl.0000048562.88536.a4. PMID 12629250.
  • Le Ber I, Moreira MC, Rivaud-Péchoux S (2003). «Cerebellar ataxia with oculomotor apraxia type 1: clinical and genetic studies.». Brain 126 (Pt 12): 2761–72. DOI:10.1093/brain/awg283. PMID 14506070.
  • Sekijima Y, Hashimoto T, Onodera O (2004). «Severe generalized dystonia as a presentation of a patient with aprataxin gene mutation.». Mov. Disord. 18 (10): 1198–200. DOI:10.1002/mds.10526. PMID 14534929.
  • Ota T, Suzuki Y, Nishikawa T (2004). «Complete sequencing and characterization of 21,243 full-length human cDNAs.». Nat. Genet. 36 (1): 40–5. DOI:10.1038/ng1285. PMID 14702039.
  • Sano Y, Date H, Igarashi S (2004). «Aprataxin, the causative protein for EAOH is a nuclear protein with a potential role as a DNA repair protein.». Ann. Neurol. 55 (2): 241–9. DOI:10.1002/ana.10808. PMID 14755728.
  • Gueven N, Becherel OJ, Kijas AW (2004). «Aprataxin, a novel protein that protects against genotoxic stress.». Hum. Mol. Genet. 13 (10): 1081–93. DOI:10.1093/hmg/ddh122. PMID 15044383.
  • Humphray SJ, Oliver K, Hunt AR (2004). «DNA sequence and analysis of human chromosome 9.». Nature 429 (6990): 369–74. DOI:10.1038/nature02465. PMID 15164053.
  • Habeck M, Zühlke C, Bentele KH (2004). «Aprataxin mutations are a rare cause of early onset ataxia in Germany.». J. Neurol. 251 (5): 591–4. DOI:10.1007/s00415-004-0374-7. PMID 15164193.
  • Hirano M, Nishiwaki T, Kariya S (2004). «Novel splice variants increase molecular diversity of aprataxin, the gene responsible for early-onset ataxia with ocular motor apraxia and hypoalbuminemia.». Neurosci. Lett. 366 (2): 120–5. DOI:10.1016/j.neulet.2004.05.034. PMID 15276230.
  • Amouri R, Moreira MC, Zouari M (2005). «Aprataxin gene mutations in Tunisian families.». Neurology 63 (5): 928–9. DOI:10.1212/01.wnl.0000137044.06573.46. PMID 15365154.
  • Clements PM, Breslin C, Deeks ED (2005). «The ataxia-oculomotor apraxia 1 gene product has a role distinct from ATM and interacts with the DNA strand break repair proteins XRCC1 and XRCC4.». DNA Repair (Amst.) 3 (11): 1493–502. DOI:10.1016/j.dnarep.2004.06.017. PMID 15380105.

Ссылки

  • [www.ncbi.nlm.nih.gov/bookshelf/br.fcgi?book=gene&part=aoa GeneReviews/NCBI/NIH/UW entry on Ataxia with Oculomotor Apraxia Type 1]
  • [www.ncbi.nlm.nih.gov/omim/208920,606350 OMIM entries on Ataxia with Oculomotor Apraxia Type 1]

Отрывок, характеризующий Апратаксин

Так он лежал и теперь на своей кровати, облокотив тяжелую, большую изуродованную голову на пухлую руку, и думал, открытым одним глазом присматриваясь к темноте.
С тех пор как Бенигсен, переписывавшийся с государем и имевший более всех силы в штабе, избегал его, Кутузов был спокойнее в том отношении, что его с войсками не заставят опять участвовать в бесполезных наступательных действиях. Урок Тарутинского сражения и кануна его, болезненно памятный Кутузову, тоже должен был подействовать, думал он.
«Они должны понять, что мы только можем проиграть, действуя наступательно. Терпение и время, вот мои воины богатыри!» – думал Кутузов. Он знал, что не надо срывать яблоко, пока оно зелено. Оно само упадет, когда будет зрело, а сорвешь зелено, испортишь яблоко и дерево, и сам оскомину набьешь. Он, как опытный охотник, знал, что зверь ранен, ранен так, как только могла ранить вся русская сила, но смертельно или нет, это был еще не разъясненный вопрос. Теперь, по присылкам Лористона и Бертелеми и по донесениям партизанов, Кутузов почти знал, что он ранен смертельно. Но нужны были еще доказательства, надо было ждать.
«Им хочется бежать посмотреть, как они его убили. Подождите, увидите. Все маневры, все наступления! – думал он. – К чему? Все отличиться. Точно что то веселое есть в том, чтобы драться. Они точно дети, от которых не добьешься толку, как было дело, оттого что все хотят доказать, как они умеют драться. Да не в том теперь дело.
И какие искусные маневры предлагают мне все эти! Им кажется, что, когда они выдумали две три случайности (он вспомнил об общем плане из Петербурга), они выдумали их все. А им всем нет числа!»
Неразрешенный вопрос о том, смертельна или не смертельна ли была рана, нанесенная в Бородине, уже целый месяц висел над головой Кутузова. С одной стороны, французы заняли Москву. С другой стороны, несомненно всем существом своим Кутузов чувствовал, что тот страшный удар, в котором он вместе со всеми русскими людьми напряг все свои силы, должен был быть смертелен. Но во всяком случае нужны были доказательства, и он ждал их уже месяц, и чем дальше проходило время, тем нетерпеливее он становился. Лежа на своей постели в свои бессонные ночи, он делал то самое, что делала эта молодежь генералов, то самое, за что он упрекал их. Он придумывал все возможные случайности, в которых выразится эта верная, уже свершившаяся погибель Наполеона. Он придумывал эти случайности так же, как и молодежь, но только с той разницей, что он ничего не основывал на этих предположениях и что он видел их не две и три, а тысячи. Чем дальше он думал, тем больше их представлялось. Он придумывал всякого рода движения наполеоновской армии, всей или частей ее – к Петербургу, на него, в обход его, придумывал (чего он больше всего боялся) и ту случайность, что Наполеон станет бороться против него его же оружием, что он останется в Москве, выжидая его. Кутузов придумывал даже движение наполеоновской армии назад на Медынь и Юхнов, но одного, чего он не мог предвидеть, это того, что совершилось, того безумного, судорожного метания войска Наполеона в продолжение первых одиннадцати дней его выступления из Москвы, – метания, которое сделало возможным то, о чем все таки не смел еще тогда думать Кутузов: совершенное истребление французов. Донесения Дорохова о дивизии Брусье, известия от партизанов о бедствиях армии Наполеона, слухи о сборах к выступлению из Москвы – все подтверждало предположение, что французская армия разбита и сбирается бежать; но это были только предположения, казавшиеся важными для молодежи, но не для Кутузова. Он с своей шестидесятилетней опытностью знал, какой вес надо приписывать слухам, знал, как способны люди, желающие чего нибудь, группировать все известия так, что они как будто подтверждают желаемое, и знал, как в этом случае охотно упускают все противоречащее. И чем больше желал этого Кутузов, тем меньше он позволял себе этому верить. Вопрос этот занимал все его душевные силы. Все остальное было для него только привычным исполнением жизни. Таким привычным исполнением и подчинением жизни были его разговоры с штабными, письма к m me Stael, которые он писал из Тарутина, чтение романов, раздачи наград, переписка с Петербургом и т. п. Но погибель французов, предвиденная им одним, было его душевное, единственное желание.
В ночь 11 го октября он лежал, облокотившись на руку, и думал об этом.
В соседней комнате зашевелилось, и послышались шаги Толя, Коновницына и Болховитинова.
– Эй, кто там? Войдите, войди! Что новенького? – окликнул их фельдмаршал.
Пока лакей зажигал свечу, Толь рассказывал содержание известий.
– Кто привез? – спросил Кутузов с лицом, поразившим Толя, когда загорелась свеча, своей холодной строгостью.
– Не может быть сомнения, ваша светлость.
– Позови, позови его сюда!
Кутузов сидел, спустив одну ногу с кровати и навалившись большим животом на другую, согнутую ногу. Он щурил свой зрячий глаз, чтобы лучше рассмотреть посланного, как будто в его чертах он хотел прочесть то, что занимало его.
– Скажи, скажи, дружок, – сказал он Болховитинову своим тихим, старческим голосом, закрывая распахнувшуюся на груди рубашку. – Подойди, подойди поближе. Какие ты привез мне весточки? А? Наполеон из Москвы ушел? Воистину так? А?
Болховитинов подробно доносил сначала все то, что ему было приказано.
– Говори, говори скорее, не томи душу, – перебил его Кутузов.
Болховитинов рассказал все и замолчал, ожидая приказания. Толь начал было говорить что то, но Кутузов перебил его. Он хотел сказать что то, но вдруг лицо его сщурилось, сморщилось; он, махнув рукой на Толя, повернулся в противную сторону, к красному углу избы, черневшему от образов.
– Господи, создатель мой! Внял ты молитве нашей… – дрожащим голосом сказал он, сложив руки. – Спасена Россия. Благодарю тебя, господи! – И он заплакал.


Со времени этого известия и до конца кампании вся деятельность Кутузова заключается только в том, чтобы властью, хитростью, просьбами удерживать свои войска от бесполезных наступлений, маневров и столкновений с гибнущим врагом. Дохтуров идет к Малоярославцу, но Кутузов медлит со всей армией и отдает приказания об очищении Калуги, отступление за которую представляется ему весьма возможным.
Кутузов везде отступает, но неприятель, не дожидаясь его отступления, бежит назад, в противную сторону.
Историки Наполеона описывают нам искусный маневр его на Тарутино и Малоярославец и делают предположения о том, что бы было, если бы Наполеон успел проникнуть в богатые полуденные губернии.
Но не говоря о том, что ничто не мешало Наполеону идти в эти полуденные губернии (так как русская армия давала ему дорогу), историки забывают то, что армия Наполеона не могла быть спасена ничем, потому что она в самой себе несла уже тогда неизбежные условия гибели. Почему эта армия, нашедшая обильное продовольствие в Москве и не могшая удержать его, а стоптавшая его под ногами, эта армия, которая, придя в Смоленск, не разбирала продовольствия, а грабила его, почему эта армия могла бы поправиться в Калужской губернии, населенной теми же русскими, как и в Москве, и с тем же свойством огня сжигать то, что зажигают?