Матриксная металлопротеиназа 16

Поделись знанием:
Перейти к: навигация, поиск
Матриксная металлопротеиназа 16

PDB rendering based on 1rm8.
Доступные структуры
PDB Поиск ортологов: [www.ebi.ac.uk/pdbe/searchResults.html?display=both&term=P51512%20or%20Q8BSA6%20or%20Q9WTR0%20or%20O35548%20or%20Q98947%20or%20Q5XF51%20or%20O04529%20or%20Q9ZUJ5%20or%20Q6Z7S6%20or%20Q67VB1 PDBe], [www.rcsb.org/pdb/search/smartSubquery.do?smartSearchSubtype=UpAccessionIdQuery&accessionIdList=P51512,Q8BSA6,Q9WTR0,O35548,Q98947,Q5XF51,O04529,Q9ZUJ5,Q6Z7S6,Q67VB1 RCSB]
Идентификаторы
Символ[www.genenames.org/cgi-bin/gene_symbol_report?hgnc_id=7162 MMP16] ; C8orf57; MMP-X2; MT-MMP2; MT-MMP3; MT3-MMP
Внешние IDOMIM: [omim.org/entry/602262 602262 ] MGI: [www.informatics.jax.org/searches/accession_report.cgi?id=MGI:1276107 1276107 ] HomoloGene: [www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?cmd=Retrieve&db=homologene&dopt=HomoloGene&list_uids=55939 55939 ] ChEMBL: [www.ebi.ac.uk/chembldb/index.php/target/inspect/CHEMBL2200 2200] GeneCards: [www.genecards.org/cgi-bin/carddisp.pl?id_type=entrezgene&id=4325 MMP16 Gene]
номер EC[www.genome.jp/dbget-bin/www_bget?enzyme+3.4.24.- 3.4.24.-]
Профиль экспрессии РНК
[biogps.org/gene/4325/ Больше информации]
Ортологи
ВидЧеловекМышь
Entrez[www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=gene&cmd=retrieve&dopt=default&list_uids=4325&rn=1 4325][www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=gene&cmd=retrieve&dopt=default&list_uids=17389&rn=1 17389]
Ensembl[www.ensembl.org/Homo_sapiens/geneview?gene=ENSG00000156103;db=core ENSG00000156103][www.ensembl.org/Mus_musculus/geneview?gene=ENSMUSG00000028226;db=core ENSMUSG00000028226]
UniProt[www.expasy.org/uniprot/P51512 P51512][www.expasy.org/uniprot/Q9WTR0 Q9WTR0]
RefSeq (мРНК)[www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/viewer.fcgi?val=NM_005941 NM_005941][www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/viewer.fcgi?val=NM_019724 NM_019724]
RefSeq (белок)[www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/viewer.fcgi?val=NP_005932 NP_005932][www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/viewer.fcgi?val=NP_062698 NP_062698]
Локус (UCSC)[genome.ucsc.edu/cgi-bin/hgTracks?org=Human&db=hg19&position=chr8:89044237-89340254 Chr 8:
89.04 – 89.34 Mb]
[genome.ucsc.edu/cgi-bin/hgTracks?org=Mouse&db=mm10&position=chr4:17852893-18119145 Chr 4:
17.85 – 18.12 Mb]
Поиск в PubMed[www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/entrez?db=gene&cmd=Link&LinkName=gene_pubmed&from_uid=4325][www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/entrez?db=gene&cmd=Link&LinkName=gene_pubmed&from_uid=17389]


Матриксная металлопротеиназа 16 (англ. matrix metallopeptidase 16, MMP16) — мембранная эндопептидаза подсемейства матриксных металлопротеиназ, кодируется геном человека MMP16.





Функция

MMP16 расщепляет различные компоненты внеклеточного матрикса, включая коллаген III типа и фибронектин. Активирует прожелатиназу A. Участвует в перестройке сосудов.

Взаимодействует с CSPG4 через хондроитинсульфат-гликозаминогликановую цепь последнего.

Структура

Синтезированный белок состоит из 607 аминокислот. После отщепления сигнального пептида и пропептида эндопептидазой фурином зрелый белок включает 488 аминокислот. Состоит из N-концевого внеклеточного участка (445 аминокислот), единственного трансмембранного фрагмента и короткого (22 аминокислоты) цитозольного участка. Внеклеточный участок включает 4 гемопексин-подобных доменов, цистеиновый переключатель, 4 участка связывания цинка и каталитический центр, 1 участок N-гликозилирования и 1 участок фосфорилирования (по тирозину-52).[1]

Тканевая специфичность

MMP15 экспрессируется в сердце, мозге, плаценте, яичниках и тонком кишечнике. Короткая изоформа синтезируется в яичниках.

См. также

Напишите отзыв о статье "Матриксная металлопротеиназа 16"

Примечания

  1. [www.uniprot.org/uniprot/P51512 Uniprot P51512]

Библиография

  • Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Generation and initial analysis of more than 15,000 full-length human and mouse cDNA sequences». Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 99 (26): 16899–903. DOI:10.1073/pnas.242603899. PMID 12477932.
  • Jung M, Römer A, Keyszer G, et al. (2003). «mRNA expression of the five membrane-type matrix metalloproteinases MT1-MT5 in human prostatic cell lines and their down-regulation in human malignant prostatic tissue». Prostate 55 (2): 89–98. DOI:10.1002/pros.10194. PMID 12661033.
  • Takino T, Koshikawa N, Miyamori H, et al. (2003). «Cleavage of metastasis suppressor gene product KiSS-1 protein/metastin by matrix metalloproteinases». Oncogene 22 (30): 4617–26. DOI:10.1038/sj.onc.1206542. PMID 12879005.
  • Rozanov DV, Hahn-Dantona E, Strickland DK, Strongin AY (2004). «The low density lipoprotein receptor-related protein LRP is regulated by membrane type-1 matrix metalloproteinase (MT1-MMP) proteolysis in malignant cells». J. Biol. Chem. 279 (6): 4260–8. DOI:10.1074/jbc.M311569200. PMID 14645246.
  • Lang R, Braun M, Sounni NE, et al. (2004). «Crystal structure of the catalytic domain of MMP-16/MT3-MMP: characterization of MT-MMP specific features». J. Mol. Biol. 336 (1): 213–25. DOI:10.1016/j.jmb.2003.12.022. PMID 14741217.
  • Shofuda T, Shofuda K, Ferri N, et al. (2004). «Cleavage of focal adhesion kinase in vascular smooth muscle cells overexpressing membrane-type matrix metalloproteinases». Arterioscler. Thromb. Vasc. Biol. 24 (5): 839–44. DOI:10.1161/01.ATV.0000126680.78500.4c. PMID 15044209.
  • Wang SC, Lien HC, Xia W, et al. (2004). «Binding at and transactivation of the COX-2 promoter by nuclear tyrosine kinase receptor ErbB-2». Cancer Cell 6 (3): 251–61. DOI:10.1016/j.ccr.2004.07.012. PMID 15380516.
  • Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA, et al. (2004). «The Status, Quality, and Expansion of the NIH Full-Length cDNA Project: The Mammalian Gene Collection (MGC)». Genome Res. 14 (10B): 2121–7. DOI:10.1101/gr.2596504. PMID 15489334.
  • Kimura K, Wakamatsu A, Suzuki Y, et al. (2006). «Diversification of transcriptional modulation: Large-scale identification and characterization of putative alternative promoters of human genes». Genome Res. 16 (1): 55–65. DOI:10.1101/gr.4039406. PMID 16344560.

Отрывок, характеризующий Матриксная металлопротеиназа 16

– Неужели? – спросил Пьер. – Это где же?
– Да вот поедемте со мной на курган, от нас видно. А у нас на батарее еще сносно, – сказал адъютант. – Что ж, едете?
– Да, я с вами, – сказал Пьер, глядя вокруг себя и отыскивая глазами своего берейтора. Тут только в первый раз Пьер увидал раненых, бредущих пешком и несомых на носилках. На том самом лужке с пахучими рядами сена, по которому он проезжал вчера, поперек рядов, неловко подвернув голову, неподвижно лежал один солдат с свалившимся кивером. – А этого отчего не подняли? – начал было Пьер; но, увидав строгое лицо адъютанта, оглянувшегося в ту же сторону, он замолчал.
Пьер не нашел своего берейтора и вместе с адъютантом низом поехал по лощине к кургану Раевского. Лошадь Пьера отставала от адъютанта и равномерно встряхивала его.
– Вы, видно, не привыкли верхом ездить, граф? – спросил адъютант.
– Нет, ничего, но что то она прыгает очень, – с недоуменьем сказал Пьер.
– Ээ!.. да она ранена, – сказал адъютант, – правая передняя, выше колена. Пуля, должно быть. Поздравляю, граф, – сказал он, – le bapteme de feu [крещение огнем].
Проехав в дыму по шестому корпусу, позади артиллерии, которая, выдвинутая вперед, стреляла, оглушая своими выстрелами, они приехали к небольшому лесу. В лесу было прохладно, тихо и пахло осенью. Пьер и адъютант слезли с лошадей и пешком вошли на гору.
– Здесь генерал? – спросил адъютант, подходя к кургану.
– Сейчас были, поехали сюда, – указывая вправо, отвечали ему.
Адъютант оглянулся на Пьера, как бы не зная, что ему теперь с ним делать.
– Не беспокойтесь, – сказал Пьер. – Я пойду на курган, можно?
– Да пойдите, оттуда все видно и не так опасно. А я заеду за вами.
Пьер пошел на батарею, и адъютант поехал дальше. Больше они не видались, и уже гораздо после Пьер узнал, что этому адъютанту в этот день оторвало руку.
Курган, на который вошел Пьер, был то знаменитое (потом известное у русских под именем курганной батареи, или батареи Раевского, а у французов под именем la grande redoute, la fatale redoute, la redoute du centre [большого редута, рокового редута, центрального редута] место, вокруг которого положены десятки тысяч людей и которое французы считали важнейшим пунктом позиции.
Редут этот состоял из кургана, на котором с трех сторон были выкопаны канавы. В окопанном канавами место стояли десять стрелявших пушек, высунутых в отверстие валов.
В линию с курганом стояли с обеих сторон пушки, тоже беспрестанно стрелявшие. Немного позади пушек стояли пехотные войска. Входя на этот курган, Пьер никак не думал, что это окопанное небольшими канавами место, на котором стояло и стреляло несколько пушек, было самое важное место в сражении.
Пьеру, напротив, казалось, что это место (именно потому, что он находился на нем) было одно из самых незначительных мест сражения.
Войдя на курган, Пьер сел в конце канавы, окружающей батарею, и с бессознательно радостной улыбкой смотрел на то, что делалось вокруг него. Изредка Пьер все с той же улыбкой вставал и, стараясь не помешать солдатам, заряжавшим и накатывавшим орудия, беспрестанно пробегавшим мимо него с сумками и зарядами, прохаживался по батарее. Пушки с этой батареи беспрестанно одна за другой стреляли, оглушая своими звуками и застилая всю окрестность пороховым дымом.
В противность той жуткости, которая чувствовалась между пехотными солдатами прикрытия, здесь, на батарее, где небольшое количество людей, занятых делом, бело ограничено, отделено от других канавой, – здесь чувствовалось одинаковое и общее всем, как бы семейное оживление.
Появление невоенной фигуры Пьера в белой шляпе сначала неприятно поразило этих людей. Солдаты, проходя мимо его, удивленно и даже испуганно косились на его фигуру. Старший артиллерийский офицер, высокий, с длинными ногами, рябой человек, как будто для того, чтобы посмотреть на действие крайнего орудия, подошел к Пьеру и любопытно посмотрел на него.