SPEN

Поделись знанием:
Перейти к: навигация, поиск
Семейство транскрипционных репрессоров Spen

PDB представлено на основе 1ow1.
Доступные структуры
PDB Поиск ортологов: [www.ebi.ac.uk/pdbe/searchResults.html?display=both&term=Q96T58%20or%20Q3UV27%20or%20Q62504%20or%20A2ADB0 PDBe], [www.rcsb.org/pdb/search/smartSubquery.do?smartSearchSubtype=UpAccessionIdQuery&accessionIdList=Q96T58,Q3UV27,Q62504,A2ADB0 RCSB]
Идентификаторы
Символ[www.genenames.org/cgi-bin/gene_symbol_report?hgnc_id=17575 SPEN] ; HIAA0929; MINT; RBM15C; SHARP
Внешние IDOMIM: [omim.org/entry/613484 613484 ] MGI: [www.informatics.jax.org/searches/accession_report.cgi?id=MGI:1891706 1891706 ] HomoloGene: [www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?cmd=Retrieve&db=homologene&dopt=HomoloGene&list_uids=124461 124461 ] GeneCards: [www.genecards.org/cgi-bin/carddisp.pl?id_type=entrezgene&id=23013 SPEN Gene]
Профиль экспрессии РНК
[biogps.org/gene/23013/ Больше информации]
Ортологи
ВидЧеловекМышь
Entrez[www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=gene&cmd=retrieve&dopt=default&list_uids=23013&rn=1 23013][www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=gene&cmd=retrieve&dopt=default&list_uids=56381&rn=1 56381]
Ensembl[www.ensembl.org/Homo_sapiens/geneview?gene=ENSG00000065526;db=core ENSG00000065526][www.ensembl.org/Mus_musculus/geneview?gene=ENSMUSG00000040761;db=core ENSMUSG00000040761]
UniProt[www.expasy.org/uniprot/Q96T58 Q96T58][www.expasy.org/uniprot/Q62504 Q62504]
RefSeq (мРНК)[www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/viewer.fcgi?val=NM_015001 NM_015001][www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/viewer.fcgi?val=NM_019763 NM_019763]
RefSeq (белок)[www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/viewer.fcgi?val=NP_055816 NP_055816][www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/viewer.fcgi?val=NP_062737 NP_062737]
Локус (UCSC)[genome.ucsc.edu/cgi-bin/hgTracks?org=Human&db=hg19&position=chr1:16174359-16266955 Chr 1:
16.17 – 16.27 Mb]
[genome.ucsc.edu/cgi-bin/hgTracks?org=Mouse&db=mm10&position=chr4:141467890-141538597 Chr 4:
141.47 – 141.54 Mb]
Поиск в PubMed[www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/entrez?db=gene&cmd=Link&LinkName=gene_pubmed&from_uid=23013][www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/entrez?db=gene&cmd=Link&LinkName=gene_pubmed&from_uid=56381]

Белок, взаимодействующий с Msx2  — белок, кодируемый у человека геном SPEN .[1][2][3]

Этот ген кодирует гормон, индуцируемый репрессором транскрипции. Репрессия транскрипции продукта этого гена может произойти в результате взаимодействия с другими репрессорами, благодаря рекрутированию белков, участвующих в дезацетилировании гистонов, или путём поглощения транскрипционных активаторов. Продукт этого гена содержит карбоксильно-концевой домен, который позволяет связывание с другими белками корепрессора. Этот домен также позволяет взаимодействие с членами комплекса NuRD, нуклеосомного комплекса белкового ремоделирования, который содержит активные деацетилазы. Кроме того, этот репрессор содержит несколько мотивов распознавания РНК, которые позволяют связывание с стероидным рецептором коактиватора РНК; это связывание может модулировать активность как лигандных, так и нелигандных стероидных рецепторов.[3]



Взаимодействия

SPEN, как было выявлено, взаимодействует с HDAC1,[4] SRA1[2] и корепрессором ядерных рецепторов 2.[2]

Напишите отзыв о статье "SPEN"

Примечания

  1. Newberry EP, Latifi T, Towler DA (Sep 1999). «The RRM domain of MINT, a novel Msx2 binding protein, recognizes and regulates the rat osteocalcin promoter». Biochemistry 38 (33): 10678–90. DOI:10.1021/bi990967j. PMID 10451362.
  2. 1 2 3 Shi Y, Downes M, Xie W, Kao HY, Ordentlich P, Tsai CC, Hon M, Evans RM (May 2001). «Sharp, an inducible cofactor that integrates nuclear receptor repression and activation». Genes Dev 15 (9): 1140–51. DOI:10.1101/gad.871201. PMID 11331609.
  3. 1 2 [www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/entrez?Db=gene&Cmd=ShowDetailView&TermToSearch=23013 Entrez Gene: SPEN spen homolog, transcriptional regulator (Drosophila)].
  4. Shi, Y; Downes M, Xie W, Kao H Y, Ordentlich P, Tsai C C, Hon M, Evans R M (May. 2001). «Sharp, an inducible cofactor that integrates nuclear receptor repression and activation». Genes Dev. 15 (9): 1140–51. DOI:10.1101/gad.871201. ISSN [worldcat.org/issn/0890-9369 0890-9369]. PMID 11331609.

Литература

  • Ternovskaia LN, Prokhorova LG, Moroz VM (1977). «[Antagonistic interrelationships between the staphylococci and Sarcina isolated from the upper respiratory tracts of virtually healthy persons]». Antibiotiki 21 (12): 1072–5. PMID 1020939.
  • Nagase T, Ishikawa K, Suyama M, et al. (1999). «Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. XIII. The complete sequences of 100 new cDNA clones from brain which code for large proteins in vitro.». DNA Res. 6 (1): 63–70. DOI:10.1093/dnares/6.1.63. PMID 10231032.
  • Shi Y, Hon M, Evans RM (2002). «The peroxisome proliferator-activated receptor delta, an integrator of transcriptional repression and nuclear receptor signaling.». Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 99 (5): 2613–8. DOI:10.1073/pnas.052707099. PMID 11867749.
  • Oswald F, Kostezka U, Astrahantseff K, et al. (2002). «SHARP is a novel component of the Notch/RBP-Jkappa signalling pathway.». EMBO J. 21 (20): 5417–26. DOI:10.1093/emboj/cdf549. PMID 12374742.
  • Ariyoshi M, Schwabe JW (2003). «A conserved structural motif reveals the essential transcriptional repression function of Spen proteins and their role in developmental signaling.». Genes Dev. 17 (15): 1909–20. DOI:10.1101/gad.266203. PMID 12897056.
  • Ota T, Suzuki Y, Nishikawa T, et al. (2004). «Complete sequencing and characterization of 21,243 full-length human cDNAs.». Nat. Genet. 36 (1): 40–5. DOI:10.1038/ng1285. PMID 14702039.
  • Dotzlaw H, Papaioannou M, Moehren U, et al. (2004). «Agonist-antagonist induced coactivator and corepressor interplay on the human androgen receptor.». Mol. Cell. Endocrinol. 213 (1): 79–85. DOI:10.1016/j.mce.2003.10.036. PMID 15062576.
  • Beausoleil SA, Jedrychowski M, Schwartz D, et al. (2004). «Large-scale characterization of HeLa cell nuclear phosphoproteins.». Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 101 (33): 12130–5. DOI:10.1073/pnas.0404720101. PMID 15302935.
  • Vadlamudi RK, Manavathi B, Singh RR, et al. (2005). «An essential role of Pak1 phosphorylation of SHARP in Notch signaling.». Oncogene 24 (28): 4591–6. DOI:10.1038/sj.onc.1208672. PMID 15824732.
  • Li J, Wang J, Yang X, et al. (2007). «The Spen homolog Msx2-interacting nuclear target protein interacts with the E2 ubiquitin-conjugating enzyme UbcH8.». Mol. Cell. Biochem. 288 (1-2): 151–7. DOI:10.1007/s11010-006-9131-9. PMID 16583136.
  • Gregory SG, Barlow KF, McLay KE, et al. (2006). «The DNA sequence and biological annotation of human chromosome 1.». Nature 441 (7091): 315–21. DOI:10.1038/nature04727. PMID 16710414.
  • Lim J, Hao T, Shaw C, et al. (2006). «A protein-protein interaction network for human inherited ataxias and disorders of Purkinje cell degeneration.». Cell 125 (4): 801–14. DOI:10.1016/j.cell.2006.03.032. PMID 16713569.
  • Beausoleil SA, Villén J, Gerber SA, et al. (2006). «A probability-based approach for high-throughput protein phosphorylation analysis and site localization.». Nat. Biotechnol. 24 (10): 1285–92. DOI:10.1038/nbt1240. PMID 16964243.
  • Olsen JV, Blagoev B, Gnad F, et al. (2006). «Global, in vivo, and site-specific phosphorylation dynamics in signaling networks.». Cell 127 (3): 635–48. DOI:10.1016/j.cell.2006.09.026. PMID 17081983.
  • Feng Y, Bommer GT, Zhai Y, et al. (2007). «Drosophila split ends homologue SHARP functions as a positive regulator of Wnt/beta-catenin/T-cell factor signaling in neoplastic transformation.». Cancer Res. 67 (2): 482–91. DOI:10.1158/0008-5472.CAN-06-2314. PMID 17234755.

Отрывок, характеризующий SPEN

Дежурный флигель адъютант, встретивший князя Андрея, попросил его подождать и пошел к военному министру. Через пять минут флигель адъютант вернулся и, особенно учтиво наклонясь и пропуская князя Андрея вперед себя, провел его через коридор в кабинет, где занимался военный министр. Флигель адъютант своею изысканною учтивостью, казалось, хотел оградить себя от попыток фамильярности русского адъютанта. Радостное чувство князя Андрея значительно ослабело, когда он подходил к двери кабинета военного министра. Он почувствовал себя оскорбленным, и чувство оскорбления перешло в то же мгновенье незаметно для него самого в чувство презрения, ни на чем не основанного. Находчивый же ум в то же мгновение подсказал ему ту точку зрения, с которой он имел право презирать и адъютанта и военного министра. «Им, должно быть, очень легко покажется одерживать победы, не нюхая пороха!» подумал он. Глаза его презрительно прищурились; он особенно медленно вошел в кабинет военного министра. Чувство это еще более усилилось, когда он увидал военного министра, сидевшего над большим столом и первые две минуты не обращавшего внимания на вошедшего. Военный министр опустил свою лысую, с седыми висками, голову между двух восковых свечей и читал, отмечая карандашом, бумаги. Он дочитывал, не поднимая головы, в то время как отворилась дверь и послышались шаги.
– Возьмите это и передайте, – сказал военный министр своему адъютанту, подавая бумаги и не обращая еще внимания на курьера.
Князь Андрей почувствовал, что либо из всех дел, занимавших военного министра, действия кутузовской армии менее всего могли его интересовать, либо нужно было это дать почувствовать русскому курьеру. «Но мне это совершенно всё равно», подумал он. Военный министр сдвинул остальные бумаги, сровнял их края с краями и поднял голову. У него была умная и характерная голова. Но в то же мгновение, как он обратился к князю Андрею, умное и твердое выражение лица военного министра, видимо, привычно и сознательно изменилось: на лице его остановилась глупая, притворная, не скрывающая своего притворства, улыбка человека, принимающего одного за другим много просителей.
– От генерала фельдмаршала Кутузова? – спросил он. – Надеюсь, хорошие вести? Было столкновение с Мортье? Победа? Пора!
Он взял депешу, которая была на его имя, и стал читать ее с грустным выражением.
– Ах, Боже мой! Боже мой! Шмит! – сказал он по немецки. – Какое несчастие, какое несчастие!
Пробежав депешу, он положил ее на стол и взглянул на князя Андрея, видимо, что то соображая.
– Ах, какое несчастие! Дело, вы говорите, решительное? Мортье не взят, однако. (Он подумал.) Очень рад, что вы привезли хорошие вести, хотя смерть Шмита есть дорогая плата за победу. Его величество, верно, пожелает вас видеть, но не нынче. Благодарю вас, отдохните. Завтра будьте на выходе после парада. Впрочем, я вам дам знать.
Исчезнувшая во время разговора глупая улыбка опять явилась на лице военного министра.
– До свидания, очень благодарю вас. Государь император, вероятно, пожелает вас видеть, – повторил он и наклонил голову.
Когда князь Андрей вышел из дворца, он почувствовал, что весь интерес и счастие, доставленные ему победой, оставлены им теперь и переданы в равнодушные руки военного министра и учтивого адъютанта. Весь склад мыслей его мгновенно изменился: сражение представилось ему давнишним, далеким воспоминанием.


Князь Андрей остановился в Брюнне у своего знакомого, русского дипломата .Билибина.
– А, милый князь, нет приятнее гостя, – сказал Билибин, выходя навстречу князю Андрею. – Франц, в мою спальню вещи князя! – обратился он к слуге, провожавшему Болконского. – Что, вестником победы? Прекрасно. А я сижу больной, как видите.
Князь Андрей, умывшись и одевшись, вышел в роскошный кабинет дипломата и сел за приготовленный обед. Билибин покойно уселся у камина.
Князь Андрей не только после своего путешествия, но и после всего похода, во время которого он был лишен всех удобств чистоты и изящества жизни, испытывал приятное чувство отдыха среди тех роскошных условий жизни, к которым он привык с детства. Кроме того ему было приятно после австрийского приема поговорить хоть не по русски (они говорили по французски), но с русским человеком, который, он предполагал, разделял общее русское отвращение (теперь особенно живо испытываемое) к австрийцам.
Билибин был человек лет тридцати пяти, холостой, одного общества с князем Андреем. Они были знакомы еще в Петербурге, но еще ближе познакомились в последний приезд князя Андрея в Вену вместе с Кутузовым. Как князь Андрей был молодой человек, обещающий пойти далеко на военном поприще, так, и еще более, обещал Билибин на дипломатическом. Он был еще молодой человек, но уже немолодой дипломат, так как он начал служить с шестнадцати лет, был в Париже, в Копенгагене и теперь в Вене занимал довольно значительное место. И канцлер и наш посланник в Вене знали его и дорожили им. Он был не из того большого количества дипломатов, которые обязаны иметь только отрицательные достоинства, не делать известных вещей и говорить по французски для того, чтобы быть очень хорошими дипломатами; он был один из тех дипломатов, которые любят и умеют работать, и, несмотря на свою лень, он иногда проводил ночи за письменным столом. Он работал одинаково хорошо, в чем бы ни состояла сущность работы. Его интересовал не вопрос «зачем?», а вопрос «как?». В чем состояло дипломатическое дело, ему было всё равно; но составить искусно, метко и изящно циркуляр, меморандум или донесение – в этом он находил большое удовольствие. Заслуги Билибина ценились, кроме письменных работ, еще и по его искусству обращаться и говорить в высших сферах.