Гистондеацетилаза 6

Поделись знанием:
Перейти к: навигация, поиск
Гистондеацетилаза 6

Представлено на основе PDB [www.rcsb.org/pdb/cgi/explore.cgi?pdbId=3C5K 3C5K].
Доступные структуры
PDB Поиск ортологов: [www.ebi.ac.uk/pdbe/searchResults.html?display=both&term=Q9UBN7%20or%20A5PJZ7%20or%20Q8IR38%20or%20Q20296 PDBe], [www.rcsb.org/pdb/search/smartSubquery.do?smartSearchSubtype=UpAccessionIdQuery&accessionIdList=Q9UBN7,A5PJZ7,Q8IR38,Q20296 RCSB]
Идентификаторы
Символ[www.genenames.org/cgi-bin/gene_symbol_report?hgnc_id=14064 HDAC6] ; CPBHM; HD6; PPP1R90
Внешние IDOMIM: [omim.org/entry/300272 300272 ] MGI: [www.informatics.jax.org/searches/accession_report.cgi?id=MGI:1333752 1333752 ] HomoloGene: [www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?cmd=Retrieve&db=homologene&dopt=HomoloGene&list_uids=31353 31353 ] IUPHAR: ChEMBL: [www.ebi.ac.uk/chembldb/index.php/target/inspect/CHEMBL1865 1865] GeneCards: [www.genecards.org/cgi-bin/carddisp.pl?id_type=entrezgene&id=10013 HDAC6 Gene]
номер EC[www.genome.jp/dbget-bin/www_bget?enzyme+3.5.1.98 3.5.1.98]
Профиль экспрессии РНК
[biogps.org/gene/10013/ Больше информации]
Ортологи
ВидЧеловекМышь
Entrez[www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=gene&cmd=retrieve&dopt=default&list_uids=10013&rn=1 10013][www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=gene&cmd=retrieve&dopt=default&list_uids=15185&rn=1 15185]
Ensembl[www.ensembl.org/Homo_sapiens/geneview?gene=ENSG00000094631;db=core ENSG00000094631][www.ensembl.org/Mus_musculus/geneview?gene=ENSMUSG00000031161;db=core ENSMUSG00000031161]
UniProt[www.expasy.org/uniprot/Q9UBN7 Q9UBN7][www.expasy.org/uniprot/Q9Z2V5 Q9Z2V5]
RefSeq (мРНК)[www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/viewer.fcgi?val=NM_006044 NM_006044][www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/viewer.fcgi?val=NM_001130416 NM_001130416]
RefSeq (белок)[www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/viewer.fcgi?val=NP_006035 NP_006035][www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/viewer.fcgi?val=NP_001123888 NP_001123888]
Локус (UCSC)[genome.ucsc.edu/cgi-bin/hgTracks?org=Human&db=hg19&position=chrHG1436_HG1432_PATCH:48660776-48684381 Chr HG1436_HG1432_PATCH:
48.66 – 48.68 Mb]		[genome.ucsc.edu/cgi-bin/hgTracks?org=Mouse&db=mm10&position=chrX:7930120-7947889 Chr X:
7.93 – 7.95 Mb]
Поиск в PubMed[www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/entrez?db=gene&cmd=Link&LinkName=gene_pubmed&from_uid=10013][www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/entrez?db=gene&cmd=Link&LinkName=gene_pubmed&from_uid=15185]
Шаблон: просмотр • обсуждение • править

Гистондеацетилаза 6 (англ. Histone deacetylase 6) — фермент, кодируемый у человека геном HDAC6[1][2].





Функция

Гистоны играют важнейшую роль в регуляции транскрипции, клеточного цикла и процесса развития. Ацетилирование/деацетилирование гистонов изменяет структуру хроматина и влияет на транскрипцию. Гистондеацетилаза 6 относится к классу II семейства гистондезацетилаз/acuc/APHA. Он содержит два каталитических домена, которые функционируют независимо друг от друга. Белок обладает гистондеацетилазной активностью и подавляет транскрипцию[3].

Клиническая значимость

Мутации в этом гене были связаны с болезнью Альцгеймера[4].

Суперэкспрессия этого белка коррелирует с онкогенезом и выживаемостью клеток, а также способствует метастазированию раковых клеток[5].

Функции

Гистондеацетилаза 6 участвует в разборке ресничек клетки, что необходимо для начала митоза[6]. Также способствует миграции клеток и катализирует деацетилирование α-тубулина[7], что может способствовать метастазированию раковых опухолей[5]. Влияет на транскрипцию и трансляцию путём регулирования белка теплового шока Hsp90 и стресс-гранул соответственно[5].

Известен высоким сродством к убиквитинированным белкам[8]. Гистондеацетилаза 6 играет важную роль в формировании стресс-гранул[en]; при фармакологическом ингибировании или при подавлении синтеза гистондеацетилазы 6 на генетическом уровне прекращается образование стресс-гранул.

Взаимодействия

HDAC6, как было выявлено, взаимодействует с HDAC11[9] и ZBTB16[10] .

HDAC6 также взаимодействует с белком G3BP1[en] стресс-гранул[8].

См также

Напишите отзыв о статье "Гистондеацетилаза 6"

Примечания

  1. ↑ Grozinger CM, Hassig CA, Schreiber SL (Jun 1999). «Three proteins define a class of human histone deacetylases related to yeast Hda1p». Proc Natl Acad Sci U S A 96 (9): 4868–73. DOI:10.1073/pnas.96.9.4868. PMID 10220385.
  2. ↑ Nagase T, Ishikawa K, Suyama M, Kikuno R, Hirosawa M, Miyajima N, Tanaka A, Kotani H, Nomura N, Ohara O (May 1999). «Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. XII. The complete sequences of 100 new cDNA clones from brain which code for large proteins in vitro». DNA Res 5 (6): 355–64. DOI:10.1093/dnares/5.6.355. PMID 10048485.
  3. ↑ [www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/entrez?Db=gene&Cmd=ShowDetailView&TermToSearch=10013 Entrez Gene: HDAC6 histone deacetylase 6].
  4. ↑ Cook C, Gendron TF, Scheffel K, Carlomagno Y, Dunmore J, DeTure M, Petrucelli L (5 April 2012). «Loss of HDAC6, a novel CHIP substrate, alleviates abnormal tau accumulation». Human Molecular Genetics. DOI:10.1093/hmg/dds125. PMID 22492994.
  5. ↑ 1 2 3 Aldana-Masangkay GI, Sakamoto KM (2011). «The role of HDAC6 in cancer». J. Biomed. Biotechnol. 2011: 875824. DOI:10.1155/2011/875824. PMID 21076528.
  6. ↑ Gradilone S. A., Radtke B. N., Bogert P. S., Huang B. Q., Gajdos G. B., LaRusso N. F. [www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/23370327 HDAC6 inhibition restores ciliary expression and decreases tumor growth.] (англ.) // Cancer research. — 2013. — Vol. 73, no. 7. — P. 2259—2270. — DOI:10.1158/0008-5472.CAN-12-2938. — PMID 23370327. исправить
  7. ↑ Gao YS, Hubbert CC, Lu J, Lee YS, Lee JY, Yao TP (2007). «Histone deacetylase 6 regulates growth factor-induced actin remodeling and endocytosis». Mol. Cell. Biol. 27 (24): 8637–47. DOI:10.1128/MCB.00393-07. PMID 17938201.
  8. ↑ 1 2 Kwon S, Zhang Y, Matthias P (December 2007). «The deacetylase HDAC6 is a novel critical component of stress granules involved in the stress response». Genes Dev. 21 (24): 3381–94. DOI:10.1101/gad.461107. PMID 18079183.
  9. ↑ Gao L, Cueto MA, Asselbergs F, Atadja P (Jul 2002). «Cloning and functional characterization of HDAC11, a novel member of the human histone deacetylase family». J. Biol. Chem. 277 (28): 25748–55. DOI:10.1074/jbc.M111871200. PMID 11948178.
  10. ↑ Chauchereau A, Mathieu M, de Saintignon J, Ferreira R, Pritchard LL, Mishal Z, Dejean A, Harel-Bellan A (Nov 2004). «HDAC4 mediates transcriptional repression by the acute promyelocytic leukaemia-associated protein PLZF». Oncogene 23 (54): 8777–84. DOI:10.1038/sj.onc.1208128. PMID 15467736.

Литература

  • Pazin MJ, Kadonaga JT (1997). «What's up and down with histone deacetylation and transcription?». Cell 89 (3): 325–8. DOI:10.1016/S0092-8674(00)80211-1. PMID 9150131.
  • Wolffe AP (1997). «Transcriptional control. Sinful repression». Nature 387 (6628): 16–7. DOI:10.1038/387016a0. PMID 9139815.
  • Huynh KD, Fischle W, Verdin E, Bardwell VJ (2000). «BCoR, a novel corepressor involved in BCL-6 repression». Genes Dev. 14 (14): 1810–23. DOI:10.1101/gad.14.14.1810. PMID 10898795.
  • Mahlknecht U, Schnittger S, Landgraf F, Schoch C, Ottmann OG, Hiddemann W, Hoelzer D (2001). «Assignment of the human histone deacetylase 6 gene (HDAC6) to X chromosome p11.23 by in situ hybridization». Cytogenet. Cell Genet. 93 (1–2): 135–6. DOI:10.1159/000056967. PMID 11474198.
  • Kao HY, Lee CH, Komarov A, Han CC, Evans RM (2002). «Isolation and characterization of mammalian HDAC10, a novel histone deacetylase». J. Biol. Chem. 277 (1): 187–93. DOI:10.1074/jbc.M108931200. PMID 11677242.
  • Seigneurin-Berny D, Verdel A, Curtet S, Lemercier C, Garin J, Rousseaux S, Khochbin S (2001). «Identification of Components of the Murine Histone Deacetylase 6 Complex: Link between Acetylation and Ubiquitination Signaling Pathways». Mol. Cell. Biol. 21 (23): 8035–44. DOI:10.1128/MCB.21.23.8035-8044.2001. PMID 11689694.
  • Tong JJ, Liu J, Bertos NR, Yang XJ (2002). «Identification of HDAC10, a novel class II human histone deacetylase containing a leucine-rich domain». Nucleic Acids Res. 30 (5): 1114–23. DOI:10.1093/nar/30.5.1114. PMID 11861901.
  • Gao L, Cueto MA, Asselbergs F, Atadja P (2002). «Cloning and functional characterization of HDAC11, a novel member of the human histone deacetylase family». J. Biol. Chem. 277 (28): 25748–55. DOI:10.1074/jbc.M111871200. PMID 11948178.
  • Hubbert C, Guardiola A, Shao R, Kawaguchi Y, Ito A, Nixon A, Yoshida M, Wang XF, Yao TP (2002). «HDAC6 is a microtubule-associated deacetylase». Nature 417 (6887): 455–8. DOI:10.1038/417455a. PMID 12024216.
  • Kirsh O, Seeler JS, Pichler A, Gast A, Müller S, Miska E, Mathieu M, Harel-Bellan A, Kouzarides T, Melchior F, Dejean A (2002). «The SUMO E3 ligase RanBP2 promotes modification of the HDAC4 deacetylase». EMBO J. 21 (11): 2682–91. DOI:10.1093/emboj/21.11.2682. PMID 12032081.
  • Hook SS, Orian A, Cowley SM, Eisenman RN (2002). «Histone deacetylase 6 binds polyubiquitin through its zinc finger (PAZ domain) and copurifies with deubiquitinating enzymes». Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 99 (21): 13425–30. DOI:10.1073/pnas.172511699. PMID 12354939.
  • Westendorf JJ, Zaidi SK, Cascino JE, Kahler R, van Wijnen AJ, Lian JB, Yoshida M, Stein GS, Li X (2002). «Runx2 (Cbfa1, AML-3) Interacts with Histone Deacetylase 6 and Represses the p21CIP1/WAF1 Promoter». Mol. Cell. Biol. 22 (22): 7982–92. DOI:10.1128/MCB.22.22.7982-7992.2002. PMID 12391164.
  • North BJ, Marshall BL, Borra MT, Denu JM, Verdin E (2003). «The human Sir2 ortholog, SIRT2, is an NAD+-dependent tubulin deacetylase». Mol. Cell 11 (2): 437–44. DOI:10.1016/S1097-2765(03)00038-8. PMID 12620231.
  • Voelter-Mahlknecht S, Mahlknecht U (2004). «Cloning and structural characterization of the human histone deacetylase 6 gene». Int. J. Mol. Med. 12 (1): 87–93. DOI:10.3892/ijmm.12.1.87. PMID 12792815.
  • Brush MH, Guardiola A, Connor JH, Yao TP, Shenolikar S (2004). «Deactylase inhibitors disrupt cellular complexes containing protein phosphatases and deacetylases». J. Biol. Chem. 279 (9): 7685–91. DOI:10.1074/jbc.M310997200. PMID 14670976.
  • Pandey UB, Batlevi Y, Baehrecke EH, Taylor JP (Nov–Dec 2007). «[www.landesbioscience.com/journals/auto/abstract.php?id=5050 HDAC6 at the intersection of autophagy, the ubiquitin-proteasome system and neurodegeneration]». Autophagy 3 (6): 643–5. DOI:10.4161/auto.5050. PMID 17912024. (Epub 2007 Sep 10)
  • Pandey UB, Nie Z, Batlevi Y, McCray BA, Ritson GP, Nedelsky NB, Schwartz SL, DiProspero NA, Knight MA, Schuldiner O, Padmanabhan R, Hild M, Berry DL, Garza D, Hubbert CC, Yao TP, Baehrecke EH, Taylor JP (June 14, 2007). «HDAC6 rescues neurodegeneration and provides an essential link between autophagy and the UPS». Nature 447 (7146): 859–63. DOI:10.1038/nature05853. PMID 17568747.

Отрывок, характеризующий Гистондеацетилаза 6

Алпатыч, приехав в Богучарово несколько времени перед кончиной старого князя, заметил, что между народом происходило волнение и что, противно тому, что происходило в полосе Лысых Гор на шестидесятиверстном радиусе, где все крестьяне уходили (предоставляя казакам разорять свои деревни), в полосе степной, в богучаровской, крестьяне, как слышно было, имели сношения с французами, получали какие то бумаги, ходившие между ними, и оставались на местах. Он знал через преданных ему дворовых людей, что ездивший на днях с казенной подводой мужик Карп, имевший большое влияние на мир, возвратился с известием, что казаки разоряют деревни, из которых выходят жители, но что французы их не трогают. Он знал, что другой мужик вчера привез даже из села Вислоухова – где стояли французы – бумагу от генерала французского, в которой жителям объявлялось, что им не будет сделано никакого вреда и за все, что у них возьмут, заплатят, если они останутся. В доказательство того мужик привез из Вислоухова сто рублей ассигнациями (он не знал, что они были фальшивые), выданные ему вперед за сено.
Наконец, важнее всего, Алпатыч знал, что в тот самый день, как он приказал старосте собрать подводы для вывоза обоза княжны из Богучарова, поутру была на деревне сходка, на которой положено было не вывозиться и ждать. А между тем время не терпело. Предводитель, в день смерти князя, 15 го августа, настаивал у княжны Марьи на том, чтобы она уехала в тот же день, так как становилось опасно. Он говорил, что после 16 го он не отвечает ни за что. В день же смерти князя он уехал вечером, но обещал приехать на похороны на другой день. Но на другой день он не мог приехать, так как, по полученным им самим известиям, французы неожиданно подвинулись, и он только успел увезти из своего имения свое семейство и все ценное.
Лет тридцать Богучаровым управлял староста Дрон, которого старый князь звал Дронушкой.
Дрон был один из тех крепких физически и нравственно мужиков, которые, как только войдут в года, обрастут бородой, так, не изменяясь, живут до шестидесяти – семидесяти лет, без одного седого волоса или недостатка зуба, такие же прямые и сильные в шестьдесят лет, как и в тридцать.
Дрон, вскоре после переселения на теплые реки, в котором он участвовал, как и другие, был сделан старостой бурмистром в Богучарове и с тех пор двадцать три года безупречно пробыл в этой должности. Мужики боялись его больше, чем барина. Господа, и старый князь, и молодой, и управляющий, уважали его и в шутку называли министром. Во все время своей службы Дрон нн разу не был ни пьян, ни болен; никогда, ни после бессонных ночей, ни после каких бы то ни было трудов, не выказывал ни малейшей усталости и, не зная грамоте, никогда не забывал ни одного счета денег и пудов муки по огромным обозам, которые он продавал, и ни одной копны ужи на хлеба на каждой десятине богучаровских полей.
Этого то Дрона Алпатыч, приехавший из разоренных Лысых Гор, призвал к себе в день похорон князя и приказал ему приготовить двенадцать лошадей под экипажи княжны и восемнадцать подвод под обоз, который должен был быть поднят из Богучарова. Хотя мужики и были оброчные, исполнение приказания этого не могло встретить затруднения, по мнению Алпатыча, так как в Богучарове было двести тридцать тягол и мужики были зажиточные. Но староста Дрон, выслушав приказание, молча опустил глаза. Алпатыч назвал ему мужиков, которых он знал и с которых он приказывал взять подводы.
Дрон отвечал, что лошади у этих мужиков в извозе. Алпатыч назвал других мужиков, и у тех лошадей не было, по словам Дрона, одни были под казенными подводами, другие бессильны, у третьих подохли лошади от бескормицы. Лошадей, по мнению Дрона, нельзя было собрать не только под обоз, но и под экипажи.
Алпатыч внимательно посмотрел на Дрона и нахмурился. Как Дрон был образцовым старостой мужиком, так и Алпатыч недаром управлял двадцать лет имениями князя и был образцовым управляющим. Он в высшей степени способен был понимать чутьем потребности и инстинкты народа, с которым имел дело, и потому он был превосходным управляющим. Взглянув на Дрона, он тотчас понял, что ответы Дрона не были выражением мысли Дрона, но выражением того общего настроения богучаровского мира, которым староста уже был захвачен. Но вместе с тем он знал, что нажившийся и ненавидимый миром Дрон должен был колебаться между двумя лагерями – господским и крестьянским. Это колебание он заметил в его взгляде, и потому Алпатыч, нахмурившись, придвинулся к Дрону.
– Ты, Дронушка, слушай! – сказал он. – Ты мне пустого не говори. Его сиятельство князь Андрей Николаич сами мне приказали, чтобы весь народ отправить и с неприятелем не оставаться, и царский на то приказ есть. А кто останется, тот царю изменник. Слышишь?
– Слушаю, – отвечал Дрон, не поднимая глаз.
Алпатыч не удовлетворился этим ответом.
– Эй, Дрон, худо будет! – сказал Алпатыч, покачав головой.
– Власть ваша! – сказал Дрон печально.
– Эй, Дрон, оставь! – повторил Алпатыч, вынимая руку из за пазухи и торжественным жестом указывая ею на пол под ноги Дрона. – Я не то, что тебя насквозь, я под тобой на три аршина все насквозь вижу, – сказал он, вглядываясь в пол под ноги Дрона.
Дрон смутился, бегло взглянул на Алпатыча и опять опустил глаза.
– Ты вздор то оставь и народу скажи, чтобы собирались из домов идти в Москву и готовили подводы завтра к утру под княжнин обоз, да сам на сходку не ходи. Слышишь?
Дрон вдруг упал в ноги.
– Яков Алпатыч, уволь! Возьми от меня ключи, уволь ради Христа.
– Оставь! – сказал Алпатыч строго. – Под тобой насквозь на три аршина вижу, – повторил он, зная, что его мастерство ходить за пчелами, знание того, когда сеять овес, и то, что он двадцать лет умел угодить старому князю, давно приобрели ему славу колдуна и что способность видеть на три аршина под человеком приписывается колдунам.
Дрон встал и хотел что то сказать, но Алпатыч перебил его:
– Что вы это вздумали? А?.. Что ж вы думаете? А?
– Что мне с народом делать? – сказал Дрон. – Взбуровило совсем. Я и то им говорю…
– То то говорю, – сказал Алпатыч. – Пьют? – коротко спросил он.
– Весь взбуровился, Яков Алпатыч: другую бочку привезли.
– Так ты слушай. Я к исправнику поеду, а ты народу повести, и чтоб они это бросили, и чтоб подводы были.
– Слушаю, – отвечал Дрон.
Больше Яков Алпатыч не настаивал. Он долго управлял народом и знал, что главное средство для того, чтобы люди повиновались, состоит в том, чтобы не показывать им сомнения в том, что они могут не повиноваться. Добившись от Дрона покорного «слушаю с», Яков Алпатыч удовлетворился этим, хотя он не только сомневался, но почти был уверен в том, что подводы без помощи воинской команды не будут доставлены.
И действительно, к вечеру подводы не были собраны. На деревне у кабака была опять сходка, и на сходке положено было угнать лошадей в лес и не выдавать подвод. Ничего не говоря об этом княжне, Алпатыч велел сложить с пришедших из Лысых Гор свою собственную кладь и приготовить этих лошадей под кареты княжны, а сам поехал к начальству.

Х
После похорон отца княжна Марья заперлась в своей комнате и никого не впускала к себе. К двери подошла девушка сказать, что Алпатыч пришел спросить приказания об отъезде. (Это было еще до разговора Алпатыча с Дроном.) Княжна Марья приподнялась с дивана, на котором она лежала, и сквозь затворенную дверь проговорила, что она никуда и никогда не поедет и просит, чтобы ее оставили в покое.
Окна комнаты, в которой лежала княжна Марья, были на запад. Она лежала на диване лицом к стене и, перебирая пальцами пуговицы на кожаной подушке, видела только эту подушку, и неясные мысли ее были сосредоточены на одном: она думала о невозвратимости смерти и о той своей душевной мерзости, которой она не знала до сих пор и которая выказалась во время болезни ее отца. Она хотела, но не смела молиться, не смела в том душевном состоянии, в котором она находилась, обращаться к богу. Она долго лежала в этом положении.
Солнце зашло на другую сторону дома и косыми вечерними лучами в открытые окна осветило комнату и часть сафьянной подушки, на которую смотрела княжна Марья. Ход мыслей ее вдруг приостановился. Она бессознательно приподнялась, оправила волоса, встала и подошла к окну, невольно вдыхая в себя прохладу ясного, но ветреного вечера.
«Да, теперь тебе удобно любоваться вечером! Его уж нет, и никто тебе не помешает», – сказала она себе, и, опустившись на стул, она упала головой на подоконник.
Кто то нежным и тихим голосом назвал ее со стороны сада и поцеловал в голову. Она оглянулась. Это была m lle Bourienne, в черном платье и плерезах. Она тихо подошла к княжне Марье, со вздохом поцеловала ее и тотчас же заплакала. Княжна Марья оглянулась на нее. Все прежние столкновения с нею, ревность к ней, вспомнились княжне Марье; вспомнилось и то, как он последнее время изменился к m lle Bourienne, не мог ее видеть, и, стало быть, как несправедливы были те упреки, которые княжна Марья в душе своей делала ей. «Да и мне ли, мне ли, желавшей его смерти, осуждать кого нибудь! – подумала она.
Княжне Марье живо представилось положение m lle Bourienne, в последнее время отдаленной от ее общества, но вместе с тем зависящей от нее и живущей в чужом доме. И ей стало жалко ее. Она кротко вопросительно посмотрела на нее и протянула ей руку. M lle Bourienne тотчас заплакала, стала целовать ее руку и говорить о горе, постигшем княжну, делая себя участницей этого горя. Она говорила о том, что единственное утешение в ее горе есть то, что княжна позволила ей разделить его с нею. Она говорила, что все бывшие недоразумения должны уничтожиться перед великим горем, что она чувствует себя чистой перед всеми и что он оттуда видит ее любовь и благодарность. Княжна слушала ее, не понимая ее слов, но изредка взглядывая на нее и вслушиваясь в звуки ее голоса.


Источник — «http://wiki-org.ru/wiki/index.php?title=Гистондеацетилаза_6&oldid=74747794»