PRPF31

Поделись знанием:
Перейти к: навигация, поиск
Фактор процессирования пре-мРНК 31

PDB прорисовано по 2ozb.
Доступные структуры
PDB Поиск ортологов: [www.ebi.ac.uk/pdbe/searchResults.html?display=both&term=F1T0A5%20or%20Q8WWY3%20or%20Q7SXM7%20or%20Q9VUM1%20or%20Q7PV98%20or%20Q9N592%20or%20O42904%20or%20Q7SGD3%20or%20Q8RXN6%20or%20Q7XU07%20or%20Q8H4L0 PDBe], [www.rcsb.org/pdb/search/smartSubquery.do?smartSearchSubtype=UpAccessionIdQuery&accessionIdList=F1T0A5,Q8WWY3,Q7SXM7,Q9VUM1,Q7PV98,Q9N592,O42904,Q7SGD3,Q8RXN6,Q7XU07,Q8H4L0 RCSB]
Идентификаторы
Символ[www.genenames.org/cgi-bin/gene_symbol_report?hgnc_id=15446 PRPF31] ; NY-BR-99; PRP31; RP11; SNRNP61
Внешние IDOMIM: [omim.org/entry/606419 606419 ] MGI: [www.informatics.jax.org/searches/accession_report.cgi?id=MGI:1916238 1916238 ] HomoloGene: [www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?cmd=Retrieve&db=homologene&dopt=HomoloGene&list_uids=5980 5980 ] GeneCards: [www.genecards.org/cgi-bin/carddisp.pl?id_type=entrezgene&id=26121 PRPF31 Gene]
Ортологи
ВидЧеловекМышь
Entrez[www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=gene&cmd=retrieve&dopt=default&list_uids=26121&rn=1 26121][www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=gene&cmd=retrieve&dopt=default&list_uids=68988&rn=1 68988]
Ensembl[www.ensembl.org/Homo_sapiens/geneview?gene=ENSG00000105618;db=core ENSG00000105618][www.ensembl.org/Mus_musculus/geneview?gene=ENSMUSG00000008373;db=core ENSMUSG00000008373]
UniProt[www.expasy.org/uniprot/Q8WWY3 Q8WWY3][www.expasy.org/uniprot/Q8CCF0 Q8CCF0]
RefSeq (мРНК)[www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/viewer.fcgi?val=NM_015629 NM_015629][www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/viewer.fcgi?val=NM_001159714 NM_001159714]
RefSeq (белок)[www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/viewer.fcgi?val=NP_056444 NP_056444][www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/viewer.fcgi?val=NP_001153186 NP_001153186]
Локус (UCSC)[genome.ucsc.edu/cgi-bin/hgTracks?org=Human&db=hg19&position=chr19:54618837-54635140 Chr 19:
54.62 – 54.64 Mb]
[genome.ucsc.edu/cgi-bin/hgTracks?org=Mouse&db=mm10&position=chr7:3629985-3642486 Chr 7:
3.63 – 3.64 Mb]
Поиск в PubMed[www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/entrez?db=gene&cmd=Link&LinkName=gene_pubmed&from_uid=26121][www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/entrez?db=gene&cmd=Link&LinkName=gene_pubmed&from_uid=68988]


PRP31 — обрабатывающий пре-мРНК фактор 31, гомолог (S. Cerevisiae [1]) (англ. «PRP31 pre-mRNA processing factor 31 homolog (S. cerevisiae)») , также известный как PRPF31 , —— белок , кодируемый у человека геном PRPF31. [2]





Функция

PRPF31 — ген, кодирующий фактор сплайсинга hPRP31. Это имеет важное значение для формирования сплайсосом hPRP31 связаных с U4/U4 di-snRNP и взаимодействущих с другим фактором сплайсинга hPRP6 , для формирования U4/U6- U5 tri-snRNP. Было выявлено, что когда срывается РНК-интерференция hPRP31, U4/U6 di-snPRNPs накапливаются в тельцах Кахаля и U4/U6-U5 tri-snRNP не может сформироваться. [3]

PRPF31 набирает интроны после присоединения U4 и U6 РНК и 15.5K белка NHP2L1. Добавление PRPF31 имеет решающее значение для перехода сплайсосомного комплекса в активированное состояние. [4]

Клиническое значение

Мутация в PRPF31 является одной из 4 известных мутаций факторов сплайсинга, которые, как известно, вызывают пигментный ретинит . Первая мутация в PRPF31 была обнаружена Vithana и др. в 2001 году. [2] пигментный ретинит (RP) является клинически и генетически гетерогенной группой дистрофии сетчатки, характеризующейся прогрессирующей дегенерацией фоторецепторов, что в конечном счете, приводит к серьезным нарушениям зрения. [5]

Наследование

Мутации в PRPF31 наследуются аутосомно-доминантным образом, что приводит к 2,5% случаев аутосомно-доминантного пигментного ретинита (adRP) в смешанном населении Великобритании. [6] Однако, картина наследования мутаций PRPF31 не является типично доминантным наследованием, показывая феномен частичной пенетрантности , в результате чего доминантные мутации появляются с "пропусками" поколений. Это, как полагают, из-за наличия двух аллелей дикого типа (англ. «wild type»), высокоэкспрессивного аллеля и низкоэкспрессивного аллеля. Если пациент имеет мутантный аллель и высокоэкспрессивный аллель, то они не являют фенотип болезни. Если пациент имеет мутантный аллель и алель низкого уровня экспрессивности, остаточный уровень белка падает ниже порога для нормального функционирования, и в этом случае они являют фенотип болезни. Поэтому картину наследования PRPF31 можно рассматривать как разновидность гаплонедостаточности. Этот вариант гаплонедостаточности виден только в двух других заболеваниях человека: протопорфирия эритроцитов , вызваннае мутациями в гене FECH; и наследственный овалоцитоз , вызванные мутациями в спектриновом гене. [7] [8]

Напишите отзыв о статье "PRPF31"

Примечания

  1. Вероятно, Saccharomyces cerevisiae- пекарские дрожжи, имеется ввиду человеческий гомолог этого грибка
  2. 1 2 Vithana EN, Abu-Safieh L, Allen MJ, Carey A, Papaioannou M, Chakarova C, Al-Maghtheh M, Ebenezer ND, Willis C, Moore AT, Bird AC, Hunt DM, Bhattacharya SS (August 2001). «A human homolog of yeast pre-mRNA splicing gene, PRP31, underlies autosomal dominant retinitis pigmentosa on chromosome 19q13.4 (RP11)». Mol. Cell 8 (2): 375–81. DOI:10.1016/S1097-2765(01)00305-7. PMID 11545739.
  3. Schaffert N, Hossbach M, Heintzmann R, Achsel T, Lührmann R (August 2004). «RNAi knockdown of hPrp31 leads to an accumulation of U4/U6 di-snRNPs in Cajal bodies». EMBO J. 23 (15): 3000–9. DOI:10.1038/sj.emboj.7600296. PMID 15257298.
  4. Liu S, Li P, Dybkov O, Nottrott S, Hartmuth K, Lührmann R, Carlomagno T, Wahl MC (April 2007). «Binding of the human Prp31 Nop domain to a composite RNA-protein platform in U4 snRNP». Science 316 (5821): 115–20. DOI:10.1126/science.1137924. PMID 17412961.
  5. [www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/entrez?Db=gene&Cmd=ShowDetailView&TermToSearch=26121 Entrez Gene: PRPF31 PRP31 pre-mRNA processing factor 31 homolog (S. cerevisiae)].
  6. Waseem NH, Vaclavik V, Webster A, Jenkins SA, Bird AC, Bhattacharya SS (March 2007). «Mutations in the gene coding for the pre-mRNA splicing factor, PRPF31, in patients with autosomal dominant retinitis pigmentosa». Investigative Ophthalmology & Visual Science 48 (3): 1330–4. DOI:10.1167/iovs.06-0963. PMID 17325180.
  7. Randon J, Boulanger L, Marechal J, Garbarz M, Vallier A, Ribeiro L, Tamagnini G, Dhermy D, Delaunay J (Nov 1994). «A variant of spectrin low-expression allele alpha LELY carrying a hereditary elliptocytosis mutation in codon 28». Br J Haematol. 88 (3): 534–40. DOI:10.1111/j.1365-2141.1994.tb05070.x. PMID 7819065.
  8. Gouya L, Puy H, Lamoril J, Da Silva V, Grandchamp B, Nordmann Y, Deybach JC. (Jun 1998). «Inheritance in erythropoietic protoporphyria: a common wild-type ferrochelatase allelic variant with low expression accounts for clinical manifestation». Am J Hum Genet 93 (6): 2150–10. PMID 10068685.

Литература

  • Tarizzo ML (1975). «The World Health Organization and the prevention of blindness». Transactions. Section on Ophthalmology. American Academy of Ophthalmology and Otolaryngology 79 (3 Pt 2): OP453–6. PMID 1154573.
  • al-Maghtheh M, Inglehearn CF, Keen TJ, et al. (1994). «Identification of a sixth locus for autosomal dominant retinitis pigmentosa on chromosome 19». Hum. Mol. Genet. 3 (2): 351–4. DOI:10.1093/hmg/3.2.351. PMID 8004108.
  • Al-Maghtheh M, Vithana E, Tarttelin E, et al. (1996). «Evidence for a major retinitis pigmentosa locus on 19q13.4 (RP11) and association with a unique bimodal expressivity phenotype». Am. J. Hum. Genet. 59 (4): 864–71. PMID 8808602.
  • Hartley JL, Temple GF, Brasch MA (2001). «DNA Cloning Using In Vitro Site-Specific Recombination». Genome Res. 10 (11): 1788–95. DOI:10.1101/gr.143000. PMID 11076863.
  • Wiemann S, Weil B, Wellenreuther R, et al. (2001). «Toward a Catalog of Human Genes and Proteins: Sequencing and Analysis of 500 Novel Complete Protein Coding Human cDNAs». Genome Res. 11 (3): 422–35. DOI:10.1101/gr.GR1547R. PMID 11230166.
  • Simpson JC, Wellenreuther R, Poustka A, et al. (2001). «Systematic subcellular localization of novel proteins identified by large-scale cDNA sequencing». EMBO Rep. 1 (3): 287–92. DOI:10.1093/embo-reports/kvd058. PMID 11256614.
  • Vithana EN, Abu-Safieh L, Allen MJ, et al. (2001). «A human homolog of yeast pre-mRNA splicing gene, PRP31, underlies autosomal dominant retinitis pigmentosa on chromosome 19q13.4 (RP11)». Mol. Cell 8 (2): 375–81. DOI:10.1016/S1097-2765(01)00305-7. PMID 11545739.
  • Makarova OV, Makarov EM, Liu S, et al. (2002). «Protein 61K, encoded by a gene (PRPF31) linked to autosomal dominant retinitis pigmentosa, is required for U4/U6·U5 tri-snRNP formation and pre-mRNA splicing». EMBO J. 21 (5): 1148–57. DOI:10.1093/emboj/21.5.1148. PMID 11867543.
  • Deery EC, Vithana EN, Newbold RJ, et al. (2003). «Disease mechanism for retinitis pigmentosa (RP11) caused by mutations in the splicing factor gene PRPF31». Hum. Mol. Genet. 11 (25): 3209–19. DOI:10.1093/hmg/11.25.3209. PMID 12444105.
  • Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Generation and initial analysis of more than 15,000 full-length human and mouse cDNA sequences». Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 99 (26): 16899–903. DOI:10.1073/pnas.242603899. PMID 12477932.
  • Martínez-Gimeno M, Gamundi MJ, Hernan I, et al. (2003). «Mutations in the pre-mRNA splicing-factor genes PRPF3, PRPF8, and PRPF31 in Spanish families with autosomal dominant retinitis pigmentosa». Invest. Ophthalmol. Vis. Sci. 44 (5): 2171–7. DOI:10.1167/iovs.02-0871. PMID 12714658.
  • Scanlan MJ, Gout I, Gordon CM, et al. (2003). «Humoral immunity to human breast cancer: antigen definition and quantitative analysis of mRNA expression». Cancer Immun. 1: 4. PMID 12747765.
  • Wang L, Ribaudo M, Zhao K, et al. (2003). «Novel Deletion in the Pre-mRNA Splicing Gene PRPF31 Causes Autosomal Dominant Retinitis Pigmentosa in a Large Chinese Family». Am. J. Med. Genet. A 121 (3): 235–9. DOI:10.1002/ajmg.a.20224. PMID 12923864.
  • Reuter TY, Medhurst AL, Waisfisz Q, et al. (2003). «Yeast two-hybrid screens imply involvement of Fanconi anemia proteins in transcription regulation, cell signaling, oxidative metabolism, and cellular transport». Exp. Cell Res. 289 (2): 211–21. DOI:10.1016/S0014-4827(03)00261-1. PMID 14499622.
  • Vithana EN, Abu-Safieh L, Pelosini L, et al. (2003). «Expression of PRPF31 mRNA in patients with autosomal dominant retinitis pigmentosa: a molecular clue for incomplete penetrance?». Invest. Ophthalmol. Vis. Sci. 44 (10): 4204–9. DOI:10.1167/iovs.03-0253. PMID 14507862.
  • Ota T, Suzuki Y, Nishikawa T, et al. (2004). «Complete sequencing and characterization of 21,243 full-length human cDNAs». Nat. Genet. 36 (1): 40–5. DOI:10.1038/ng1285. PMID 14702039.
  • Grimwood J, Gordon LA, Olsen A, et al. (2004). «The DNA sequence and biology of human chromosome 19». Nature 428 (6982): 529–35. DOI:10.1038/nature02399. PMID 15057824.
  • Xia K, Zheng D, Pan Q, et al. (2004). «A novel PRPF31 splice-site mutation in a Chinese family with autosomal dominant retinitis pigmentosa». Mol. Vis. 10: 361–5. PMID 15162096.
  • Schaffert N, Hossbach M, Heintzmann R, et al. (2005). «RNAi knockdown of hPrp31 leads to an accumulation of U4/U6 di-snRNPs in Cajal bodies». EMBO J. 23 (15): 3000–9. DOI:10.1038/sj.emboj.7600296. PMID 15257298.
  • Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA, et al. (2004). «The Status, Quality, and Expansion of the NIH Full-Length cDNA Project: The Mammalian Gene Collection (MGC)». Genome Res. 14 (10B): 2121–7. DOI:10.1101/gr.2596504. PMID 15489334.

Отрывок, характеризующий PRPF31

Кутузов, как и все старые люди, мало спал по ночам. Он днем часто неожиданно задремывал; но ночью он, не раздеваясь, лежа на своей постели, большею частию не спал и думал.
Так он лежал и теперь на своей кровати, облокотив тяжелую, большую изуродованную голову на пухлую руку, и думал, открытым одним глазом присматриваясь к темноте.
С тех пор как Бенигсен, переписывавшийся с государем и имевший более всех силы в штабе, избегал его, Кутузов был спокойнее в том отношении, что его с войсками не заставят опять участвовать в бесполезных наступательных действиях. Урок Тарутинского сражения и кануна его, болезненно памятный Кутузову, тоже должен был подействовать, думал он.
«Они должны понять, что мы только можем проиграть, действуя наступательно. Терпение и время, вот мои воины богатыри!» – думал Кутузов. Он знал, что не надо срывать яблоко, пока оно зелено. Оно само упадет, когда будет зрело, а сорвешь зелено, испортишь яблоко и дерево, и сам оскомину набьешь. Он, как опытный охотник, знал, что зверь ранен, ранен так, как только могла ранить вся русская сила, но смертельно или нет, это был еще не разъясненный вопрос. Теперь, по присылкам Лористона и Бертелеми и по донесениям партизанов, Кутузов почти знал, что он ранен смертельно. Но нужны были еще доказательства, надо было ждать.
«Им хочется бежать посмотреть, как они его убили. Подождите, увидите. Все маневры, все наступления! – думал он. – К чему? Все отличиться. Точно что то веселое есть в том, чтобы драться. Они точно дети, от которых не добьешься толку, как было дело, оттого что все хотят доказать, как они умеют драться. Да не в том теперь дело.
И какие искусные маневры предлагают мне все эти! Им кажется, что, когда они выдумали две три случайности (он вспомнил об общем плане из Петербурга), они выдумали их все. А им всем нет числа!»
Неразрешенный вопрос о том, смертельна или не смертельна ли была рана, нанесенная в Бородине, уже целый месяц висел над головой Кутузова. С одной стороны, французы заняли Москву. С другой стороны, несомненно всем существом своим Кутузов чувствовал, что тот страшный удар, в котором он вместе со всеми русскими людьми напряг все свои силы, должен был быть смертелен. Но во всяком случае нужны были доказательства, и он ждал их уже месяц, и чем дальше проходило время, тем нетерпеливее он становился. Лежа на своей постели в свои бессонные ночи, он делал то самое, что делала эта молодежь генералов, то самое, за что он упрекал их. Он придумывал все возможные случайности, в которых выразится эта верная, уже свершившаяся погибель Наполеона. Он придумывал эти случайности так же, как и молодежь, но только с той разницей, что он ничего не основывал на этих предположениях и что он видел их не две и три, а тысячи. Чем дальше он думал, тем больше их представлялось. Он придумывал всякого рода движения наполеоновской армии, всей или частей ее – к Петербургу, на него, в обход его, придумывал (чего он больше всего боялся) и ту случайность, что Наполеон станет бороться против него его же оружием, что он останется в Москве, выжидая его. Кутузов придумывал даже движение наполеоновской армии назад на Медынь и Юхнов, но одного, чего он не мог предвидеть, это того, что совершилось, того безумного, судорожного метания войска Наполеона в продолжение первых одиннадцати дней его выступления из Москвы, – метания, которое сделало возможным то, о чем все таки не смел еще тогда думать Кутузов: совершенное истребление французов. Донесения Дорохова о дивизии Брусье, известия от партизанов о бедствиях армии Наполеона, слухи о сборах к выступлению из Москвы – все подтверждало предположение, что французская армия разбита и сбирается бежать; но это были только предположения, казавшиеся важными для молодежи, но не для Кутузова. Он с своей шестидесятилетней опытностью знал, какой вес надо приписывать слухам, знал, как способны люди, желающие чего нибудь, группировать все известия так, что они как будто подтверждают желаемое, и знал, как в этом случае охотно упускают все противоречащее. И чем больше желал этого Кутузов, тем меньше он позволял себе этому верить. Вопрос этот занимал все его душевные силы. Все остальное было для него только привычным исполнением жизни. Таким привычным исполнением и подчинением жизни были его разговоры с штабными, письма к m me Stael, которые он писал из Тарутина, чтение романов, раздачи наград, переписка с Петербургом и т. п. Но погибель французов, предвиденная им одним, было его душевное, единственное желание.
В ночь 11 го октября он лежал, облокотившись на руку, и думал об этом.
В соседней комнате зашевелилось, и послышались шаги Толя, Коновницына и Болховитинова.
– Эй, кто там? Войдите, войди! Что новенького? – окликнул их фельдмаршал.
Пока лакей зажигал свечу, Толь рассказывал содержание известий.
– Кто привез? – спросил Кутузов с лицом, поразившим Толя, когда загорелась свеча, своей холодной строгостью.
– Не может быть сомнения, ваша светлость.
– Позови, позови его сюда!
Кутузов сидел, спустив одну ногу с кровати и навалившись большим животом на другую, согнутую ногу. Он щурил свой зрячий глаз, чтобы лучше рассмотреть посланного, как будто в его чертах он хотел прочесть то, что занимало его.
– Скажи, скажи, дружок, – сказал он Болховитинову своим тихим, старческим голосом, закрывая распахнувшуюся на груди рубашку. – Подойди, подойди поближе. Какие ты привез мне весточки? А? Наполеон из Москвы ушел? Воистину так? А?
Болховитинов подробно доносил сначала все то, что ему было приказано.
– Говори, говори скорее, не томи душу, – перебил его Кутузов.
Болховитинов рассказал все и замолчал, ожидая приказания. Толь начал было говорить что то, но Кутузов перебил его. Он хотел сказать что то, но вдруг лицо его сщурилось, сморщилось; он, махнув рукой на Толя, повернулся в противную сторону, к красному углу избы, черневшему от образов.
– Господи, создатель мой! Внял ты молитве нашей… – дрожащим голосом сказал он, сложив руки. – Спасена Россия. Благодарю тебя, господи! – И он заплакал.


Со времени этого известия и до конца кампании вся деятельность Кутузова заключается только в том, чтобы властью, хитростью, просьбами удерживать свои войска от бесполезных наступлений, маневров и столкновений с гибнущим врагом. Дохтуров идет к Малоярославцу, но Кутузов медлит со всей армией и отдает приказания об очищении Калуги, отступление за которую представляется ему весьма возможным.
Кутузов везде отступает, но неприятель, не дожидаясь его отступления, бежит назад, в противную сторону.
Историки Наполеона описывают нам искусный маневр его на Тарутино и Малоярославец и делают предположения о том, что бы было, если бы Наполеон успел проникнуть в богатые полуденные губернии.
Но не говоря о том, что ничто не мешало Наполеону идти в эти полуденные губернии (так как русская армия давала ему дорогу), историки забывают то, что армия Наполеона не могла быть спасена ничем, потому что она в самой себе несла уже тогда неизбежные условия гибели. Почему эта армия, нашедшая обильное продовольствие в Москве и не могшая удержать его, а стоптавшая его под ногами, эта армия, которая, придя в Смоленск, не разбирала продовольствия, а грабила его, почему эта армия могла бы поправиться в Калужской губернии, населенной теми же русскими, как и в Москве, и с тем же свойством огня сжигать то, что зажигают?
Армия не могла нигде поправиться. Она, с Бородинского сражения и грабежа Москвы, несла в себе уже как бы химические условия разложения.
Люди этой бывшей армии бежали с своими предводителями сами не зная куда, желая (Наполеон и каждый солдат) только одного: выпутаться лично как можно скорее из того безвыходного положения, которое, хотя и неясно, они все сознавали.
Только поэтому, на совете в Малоярославце, когда, притворяясь, что они, генералы, совещаются, подавая разные мнения, последнее мнение простодушного солдата Мутона, сказавшего то, что все думали, что надо только уйти как можно скорее, закрыло все рты, и никто, даже Наполеон, не мог сказать ничего против этой всеми сознаваемой истины.