Нуклеолин

Поделись знанием:
Перейти к: навигация, поиск
Структура домена RRM1 нуклеолина

Изображение основано на данных документа 2fc8 в PDB
Доступные структуры
PDB Поиск ортологов: [www.ebi.ac.uk/pdbe/searchResults.html?display=both&term= PDBe], [www.rcsb.org/pdb/search/smartSubquery.do?smartSearchSubtype=UpAccessionIdQuery&accessionIdList= RCSB]
Идентификаторы
Символ[www.genenames.org/cgi-bin/gene_symbol_report?hgnc_id=7667 NCL] ; C23
Внешние IDOMIM: [omim.org/entry/164035 164035 ] HomoloGene: [www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?cmd=Retrieve&db=homologene&dopt=HomoloGene&list_uids=136488 136488 ] GeneCards: [www.genecards.org/cgi-bin/carddisp.pl?id_type=entrezgene&id=4691 NCL Gene]
Профиль экспрессии РНК
[biogps.org/gene/4691/ Больше информации]
Ортологи
ВидЧеловекМышь
Entrez[www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=gene&cmd=retrieve&dopt=default&list_uids=4691&rn=1 4691][www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=gene&cmd=retrieve&dopt=default&list_uids=17975&rn=1 17975]
Ensembl[www.ensembl.org/Homo_sapiens/geneview?gene=ENSG00000115053;db=core ENSG00000115053][www.ensembl.org/Mus_musculus/geneview?gene=ENSMUSG00000026234;db=core ENSMUSG00000026234]
UniProt[www.expasy.org/uniprot/P19338 P19338][www.expasy.org/uniprot/P09405 P09405]
RefSeq (мРНК)[www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/viewer.fcgi?val=NM_005381 NM_005381][www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/viewer.fcgi?val=NM_010880 NM_010880]
RefSeq (белок)[www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/viewer.fcgi?val=NP_005372 NP_005372][www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/viewer.fcgi?val=NP_035010 NP_035010]
Локус (UCSC)[genome.ucsc.edu/cgi-bin/hgTracks?org=Human&db=hg19&position=chr2:232318242-232348352 Chr 2:
232.32 – 232.35 Mb]
[genome.ucsc.edu/cgi-bin/hgTracks?org=Mouse&db=mm10&position=chr1:86344719-86359455 Chr 1:
86.34 – 86.36 Mb]
Поиск в PubMed[www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/entrez?db=gene&cmd=Link&LinkName=gene_pubmed&from_uid=4691][www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/entrez?db=gene&cmd=Link&LinkName=gene_pubmed&from_uid=17975]

Нуклеолин  — белок, кодируемый у человека геном NCL[1][2].





Ген

Человеческий ген NCL расположен на хромосоме 2 и состоит из 14 экзонов и 13 интронов общим размером около около 11 kb. 11-ый интрон гена NCL кодирует малую ядрышковую РНК U20[3].

Функция

Нуклеолин - эукариотический ядрышковый фосфопротеин, участвует в синтезе и созревании рибосом[3]. Белок находится в основном в плотных волокнистых регионах ядрышка.

Нуклеолин также может действовать как транскрипционный коактиватор COUP-TFII[4].

Клиническое значение

Мидкин и плейотрофин связываются с расположенным на клеточной поверхности нуклеолином как с рецептором низкого сродства. Такое связывание может предотвратить развитие ВИЧ-инфекции[5][6].

Нуклеолин на поверхности клетки представляет собой рецептор для белка слияния респираторно-синцитиального вируса[7]. Предотвращение взаимодействия нуклеолина с белком слияния вируса оказалось весьма эффективной терапевтической мерой против РСВ-инфекции в клеточных культурах и животных моделях[8][9][10].

Взаимодействия

Нуклеолин, как было выявлено, взаимодействует с:

Напишите отзыв о статье "Нуклеолин"

Примечания

  1. (Sep 1990) «Genomic organization and chromosomal localization of the human nucleolin gene». The Journal of Biological Chemistry 265 (25): 14922–31. PMID 2394707.
  2. (Aug 1988) «A major nucleolar protein, nucleolin, induces chromatin decondensation by binding to histone H1». European Journal of Biochemistry / FEBS 175 (3): 525–30. DOI:10.1111/j.1432-1033.1988.tb14224.x. PMID 3409881.
  3. 1 2 [www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/entrez?Db=gene&Cmd=ShowDetailView&TermToSearch=4691 Entrez Gene: NCL nucleolin].
  4. (May 2012) «[www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/22693611 Identification and characterization of nucleolin as a COUP-TFII coactivator of retinoic acid receptor β transcription in breast cancer cells]». PloS One 7 (5). DOI:10.1371/journal.pone.0038278. PMID 22693611.
  5. (Oct 2002) «The anti-HIV cytokine midkine binds the cell surface-expressed nucleolin as a low affinity receptor». The Journal of Biological Chemistry 277 (40): 37492–502. DOI:10.1074/jbc.M201194200. PMID 12147681.
  6. (Sep 2005) «Pleiotrophin inhibits HIV infection by binding the cell surface-expressed nucleolin». The FEBS Journal 272 (18): 4646–59. DOI:10.1111/j.1742-4658.2005.04870.x. PMID 16156786.
  7. (Sep 2011) «Identification of nucleolin as a cellular receptor for human respiratory syncytial virus». Nature Medicine 17 (9): 1132-5. DOI:10.1038/nm.2444. PMID 21841784.
  8. (Nov 2012) «The RSV fusion receptor: not what everyone expected it to be». Microbes and Infection / Institut Pasteur 14 (13): 1205-10. DOI:10.1016/j.micinf.2012.07.015. PMID 22884716.
  9. (Mar 2013) «RSV fusion: time for a new model». Viruses 5 (3): 873-85. DOI:10.3390/v5030873. PMID 23518574.
  10. (Nov 2014) «Respiratory syncytial virus receptor expression in the mouse and viral tropism». Histology and Histopathology Epub ahead of print. PMID 25374027.
  11. (Jun 1996) «The physical association of casein kinase 2 with nucleolin». The Journal of Biological Chemistry 271 (26): 15662-8. DOI:10.1074/jbc.271.26.15662. PMID 8663258.
  12. (Feb 2003) «Centaurin-alpha 1 associates in vitro and in vivo with nucleolin». Biochemical and Biophysical Research Communications 301 (2): 502-8. DOI:10.1016/s0006-291x(02)03010-3. PMID 12565890.
  13. (Oct 2011) «Competitive regulation of nucleolin expression by HuR and miR-494». Molecular and Cellular Biology 31 (20): 4219-31. DOI:10.1128/MCB.05955-11. PMID 21859890.
  14. (Apr 1996) «C23 interacts with B23, a putative nucleolar-localization-signal-binding protein». European Journal of Biochemistry / FEBS 237 (1): 153-8. DOI:10.1111/j.1432-1033.1996.0153n.x. PMID 8620867.
  15. (Aug 2002) «Stress-dependent nucleolin mobilization mediated by p53-nucleolin complex formation». Molecular and Cellular Biology 22 (16): 6014-22. DOI:10.1128/mcb.22.16.6014-6022.2002. PMID 12138209.
  16. (Sep 2002) «Interaction of protein phosphatase 1 delta with nucleolin in human osteoblastic cells». The Journal of Histochemistry and Cytochemistry 50 (9): 1187-93. DOI:10.1177/002215540205000905. PMID 12185196.
  17. (Nov 2003) «S100C/A11 is a key mediator of Ca(2+)-induced growth inhibition of human epidermal keratinocytes». The Journal of Cell Biology 163 (4): 825-35. DOI:10.1083/jcb.200304017. PMID 14623863.
  18. (Jul 2002) «Nucleolin associates with a subset of the human Ro ribonucleoprotein complexes». Journal of Molecular Biology 320 (3): 475-88. DOI:10.1016/s0022-2836(02)00518-1. PMID 12096904.
  19. (Apr 1998) «Interaction between the N-terminus of human topoisomerase I and SV40 large T antigen». Nucleic Acids Research 26 (7): 1841-7. DOI:10.1093/nar/26.7.1841. PMID 9512561.
  20. (Jan 1996) «Identification of a nucleolin binding site in human topoisomerase I». The Journal of Biological Chemistry 271 (4): 1993-7. DOI:10.1074/jbc.271.4.1993. PMID 8567649.
  21. (Dec 2004) «Nucleolin interacts with telomerase». The Journal of Biological Chemistry 279 (49): 51508-15. DOI:10.1074/jbc.M407643200. PMID 15371412.

Литература

  • (1999) «Nucleolin: a multifunctional major nucleolar phosphoprotein». Critical Reviews in Biochemistry and Molecular Biology 33 (6): 407–36. DOI:10.1080/10409239891204260. PMID 9918513.
  • (Aug 1991) «Granzyme A binding to target cell proteins. Granzyme A binds to and cleaves nucleolin in vitro». The Journal of Biological Chemistry 266 (22): 14703–8. PMID 1860869.
  • (Jul 1990) «Mitosis-specific phosphorylation of nucleolin by p34cdc2 protein kinase». Molecular and Cellular Biology 10 (7): 3607–18. PMID 2192260.
  • (Jun 1989) «Cloning and sequencing of the human nucleolin cDNA». FEBS Letters 250 (1): 99–105. DOI:10.1016/0014-5793(89)80692-1. PMID 2737305.
  • (Jul 1995) «Human DNA helicase IV is nucleolin, an RNA helicase modulated by phosphorylation». Gene 160 (2): 143–8. DOI:10.1016/0378-1119(95)00207-M. PMID 7642087.
  • (Dec 1994) «Major cell surface-located protein substrates of an ecto-protein kinase are homologs of known nuclear proteins». Biochemistry 33 (49): 14696–706. DOI:10.1021/bi00253a007. PMID 7993898.
  • (Sep 1994) «U20, a novel small nucleolar RNA, is encoded in an intron of the nucleolin gene in mammals». Molecular and Cellular Biology 14 (9): 5766–76. DOI:10.1128/mcb.14.9.5766. PMID 8065311.
  • (Jul 1993) «Nuclear proteins that bind the pre-mRNA 3' splice site sequence r(UUAG/G) and the human telomeric DNA sequence d(TTAGGG)n». Molecular and Cellular Biology 13 (7): 4301–10. PMID 8321232.
  • (Dec 1995) «A fraction enriched in a novel glucocorticoid receptor-interacting protein stimulates receptor-dependent transcription in vitro». The Journal of Biological Chemistry 270 (51): 30755–9. DOI:10.1074/jbc.270.51.30755. PMID 8530516.
  • (Jan 1996) «Identification of a nucleolin binding site in human topoisomerase I». The Journal of Biological Chemistry 271 (4): 1993–7. DOI:10.1074/jbc.271.4.1993. PMID 8567649.
  • (Apr 1996) «C23 interacts with B23, a putative nucleolar-localization-signal-binding protein». European Journal of Biochemistry / FEBS 237 (1): 153–8. DOI:10.1111/j.1432-1033.1996.0153n.x. PMID 8620867.
  • (Jun 1996) «The physical association of casein kinase 2 with nucleolin». The Journal of Biological Chemistry 271 (26): 15662–8. DOI:10.1074/jbc.271.26.15662. PMID 8663258.
  • (Dec 1997) «Nucleolin is a protein kinase C-zeta substrate. Connection between cell surface signaling and nucleus in PC12 cells». The Journal of Biological Chemistry 272 (49): 31130–7. DOI:10.1074/jbc.272.49.31130. PMID 9388266.
  • (Apr 1998) «Interaction between the N-terminus of human topoisomerase I and SV40 large T antigen». Nucleic Acids Research 26 (7): 1841–7. DOI:10.1093/nar/26.7.1841. PMID 9512561.
  • (Jul 1998) «A B-cell-specific DNA recombination complex». The Journal of Biological Chemistry 273 (27): 17025–35. DOI:10.1074/jbc.273.27.17025. PMID 9642267.
  • (Nov 1998) «Cellular adhesion mediated by factor J, a complement inhibitor. Evidence for nucleolin involvement». The Journal of Biological Chemistry 273 (48): 31718–25. DOI:10.1074/jbc.273.48.31718. PMID 9822633.
  • (Jul 1999) «A novel RNA polymerase II-containing complex potentiates Tat-enhanced HIV-1 transcription». The EMBO Journal 18 (13): 3688–701. DOI:10.1093/emboj/18.13.3688. PMID 10393184.

</div>

Отрывок, характеризующий Нуклеолин

«Ну, за что они меня?…» думал про себя Тушин, со страхом глядя на начальника.
– Я… ничего… – проговорил он, приставляя два пальца к козырьку. – Я…
Но полковник не договорил всего, что хотел. Близко пролетевшее ядро заставило его, нырнув, согнуться на лошади. Он замолк и только что хотел сказать еще что то, как еще ядро остановило его. Он поворотил лошадь и поскакал прочь.
– Отступать! Все отступать! – прокричал он издалека. Солдаты засмеялись. Через минуту приехал адъютант с тем же приказанием.
Это был князь Андрей. Первое, что он увидел, выезжая на то пространство, которое занимали пушки Тушина, была отпряженная лошадь с перебитою ногой, которая ржала около запряженных лошадей. Из ноги ее, как из ключа, лилась кровь. Между передками лежало несколько убитых. Одно ядро за другим пролетало над ним, в то время как он подъезжал, и он почувствовал, как нервическая дрожь пробежала по его спине. Но одна мысль о том, что он боится, снова подняла его. «Я не могу бояться», подумал он и медленно слез с лошади между орудиями. Он передал приказание и не уехал с батареи. Он решил, что при себе снимет орудия с позиции и отведет их. Вместе с Тушиным, шагая через тела и под страшным огнем французов, он занялся уборкой орудий.
– А то приезжало сейчас начальство, так скорее драло, – сказал фейерверкер князю Андрею, – не так, как ваше благородие.
Князь Андрей ничего не говорил с Тушиным. Они оба были и так заняты, что, казалось, и не видали друг друга. Когда, надев уцелевшие из четырех два орудия на передки, они двинулись под гору (одна разбитая пушка и единорог были оставлены), князь Андрей подъехал к Тушину.
– Ну, до свидания, – сказал князь Андрей, протягивая руку Тушину.
– До свидания, голубчик, – сказал Тушин, – милая душа! прощайте, голубчик, – сказал Тушин со слезами, которые неизвестно почему вдруг выступили ему на глаза.


Ветер стих, черные тучи низко нависли над местом сражения, сливаясь на горизонте с пороховым дымом. Становилось темно, и тем яснее обозначалось в двух местах зарево пожаров. Канонада стала слабее, но трескотня ружей сзади и справа слышалась еще чаще и ближе. Как только Тушин с своими орудиями, объезжая и наезжая на раненых, вышел из под огня и спустился в овраг, его встретило начальство и адъютанты, в числе которых были и штаб офицер и Жерков, два раза посланный и ни разу не доехавший до батареи Тушина. Все они, перебивая один другого, отдавали и передавали приказания, как и куда итти, и делали ему упреки и замечания. Тушин ничем не распоряжался и молча, боясь говорить, потому что при каждом слове он готов был, сам не зная отчего, заплакать, ехал сзади на своей артиллерийской кляче. Хотя раненых велено было бросать, много из них тащилось за войсками и просилось на орудия. Тот самый молодцоватый пехотный офицер, который перед сражением выскочил из шалаша Тушина, был, с пулей в животе, положен на лафет Матвевны. Под горой бледный гусарский юнкер, одною рукой поддерживая другую, подошел к Тушину и попросился сесть.
– Капитан, ради Бога, я контужен в руку, – сказал он робко. – Ради Бога, я не могу итти. Ради Бога!
Видно было, что юнкер этот уже не раз просился где нибудь сесть и везде получал отказы. Он просил нерешительным и жалким голосом.
– Прикажите посадить, ради Бога.
– Посадите, посадите, – сказал Тушин. – Подложи шинель, ты, дядя, – обратился он к своему любимому солдату. – А где офицер раненый?
– Сложили, кончился, – ответил кто то.
– Посадите. Садитесь, милый, садитесь. Подстели шинель, Антонов.
Юнкер был Ростов. Он держал одною рукой другую, был бледен, и нижняя челюсть тряслась от лихорадочной дрожи. Его посадили на Матвевну, на то самое орудие, с которого сложили мертвого офицера. На подложенной шинели была кровь, в которой запачкались рейтузы и руки Ростова.
– Что, вы ранены, голубчик? – сказал Тушин, подходя к орудию, на котором сидел Ростов.
– Нет, контужен.
– Отчего же кровь то на станине? – спросил Тушин.
– Это офицер, ваше благородие, окровянил, – отвечал солдат артиллерист, обтирая кровь рукавом шинели и как будто извиняясь за нечистоту, в которой находилось орудие.
Насилу, с помощью пехоты, вывезли орудия в гору, и достигши деревни Гунтерсдорф, остановились. Стало уже так темно, что в десяти шагах нельзя было различить мундиров солдат, и перестрелка стала стихать. Вдруг близко с правой стороны послышались опять крики и пальба. От выстрелов уже блестело в темноте. Это была последняя атака французов, на которую отвечали солдаты, засевшие в дома деревни. Опять всё бросилось из деревни, но орудия Тушина не могли двинуться, и артиллеристы, Тушин и юнкер, молча переглядывались, ожидая своей участи. Перестрелка стала стихать, и из боковой улицы высыпали оживленные говором солдаты.
– Цел, Петров? – спрашивал один.
– Задали, брат, жару. Теперь не сунутся, – говорил другой.
– Ничего не видать. Как они в своих то зажарили! Не видать; темь, братцы. Нет ли напиться?
Французы последний раз были отбиты. И опять, в совершенном мраке, орудия Тушина, как рамой окруженные гудевшею пехотой, двинулись куда то вперед.
В темноте как будто текла невидимая, мрачная река, всё в одном направлении, гудя шопотом, говором и звуками копыт и колес. В общем гуле из за всех других звуков яснее всех были стоны и голоса раненых во мраке ночи. Их стоны, казалось, наполняли собой весь этот мрак, окружавший войска. Их стоны и мрак этой ночи – это было одно и то же. Через несколько времени в движущейся толпе произошло волнение. Кто то проехал со свитой на белой лошади и что то сказал, проезжая. Что сказал? Куда теперь? Стоять, что ль? Благодарил, что ли? – послышались жадные расспросы со всех сторон, и вся движущаяся масса стала напирать сама на себя (видно, передние остановились), и пронесся слух, что велено остановиться. Все остановились, как шли, на середине грязной дороги.
Засветились огни, и слышнее стал говор. Капитан Тушин, распорядившись по роте, послал одного из солдат отыскивать перевязочный пункт или лекаря для юнкера и сел у огня, разложенного на дороге солдатами. Ростов перетащился тоже к огню. Лихорадочная дрожь от боли, холода и сырости трясла всё его тело. Сон непреодолимо клонил его, но он не мог заснуть от мучительной боли в нывшей и не находившей положения руке. Он то закрывал глаза, то взглядывал на огонь, казавшийся ему горячо красным, то на сутуловатую слабую фигуру Тушина, по турецки сидевшего подле него. Большие добрые и умные глаза Тушина с сочувствием и состраданием устремлялись на него. Он видел, что Тушин всею душой хотел и ничем не мог помочь ему.
Со всех сторон слышны были шаги и говор проходивших, проезжавших и кругом размещавшейся пехоты. Звуки голосов, шагов и переставляемых в грязи лошадиных копыт, ближний и дальний треск дров сливались в один колеблющийся гул.
Теперь уже не текла, как прежде, во мраке невидимая река, а будто после бури укладывалось и трепетало мрачное море. Ростов бессмысленно смотрел и слушал, что происходило перед ним и вокруг него. Пехотный солдат подошел к костру, присел на корточки, всунул руки в огонь и отвернул лицо.
– Ничего, ваше благородие? – сказал он, вопросительно обращаясь к Тушину. – Вот отбился от роты, ваше благородие; сам не знаю, где. Беда!
Вместе с солдатом подошел к костру пехотный офицер с подвязанной щекой и, обращаясь к Тушину, просил приказать подвинуть крошечку орудия, чтобы провезти повозку. За ротным командиром набежали на костер два солдата. Они отчаянно ругались и дрались, выдергивая друг у друга какой то сапог.
– Как же, ты поднял! Ишь, ловок, – кричал один хриплым голосом.
Потом подошел худой, бледный солдат с шеей, обвязанной окровавленною подверткой, и сердитым голосом требовал воды у артиллеристов.
– Что ж, умирать, что ли, как собаке? – говорил он.
Тушин велел дать ему воды. Потом подбежал веселый солдат, прося огоньку в пехоту.
– Огоньку горяченького в пехоту! Счастливо оставаться, землячки, благодарим за огонек, мы назад с процентой отдадим, – говорил он, унося куда то в темноту краснеющуюся головешку.
За этим солдатом четыре солдата, неся что то тяжелое на шинели, прошли мимо костра. Один из них споткнулся.
– Ишь, черти, на дороге дрова положили, – проворчал он.
– Кончился, что ж его носить? – сказал один из них.
– Ну, вас!
И они скрылись во мраке с своею ношей.
– Что? болит? – спросил Тушин шопотом у Ростова.
– Болит.
– Ваше благородие, к генералу. Здесь в избе стоят, – сказал фейерверкер, подходя к Тушину.
– Сейчас, голубчик.
Тушин встал и, застегивая шинель и оправляясь, отошел от костра…
Недалеко от костра артиллеристов, в приготовленной для него избе, сидел князь Багратион за обедом, разговаривая с некоторыми начальниками частей, собравшимися у него. Тут был старичок с полузакрытыми глазами, жадно обгладывавший баранью кость, и двадцатидвухлетний безупречный генерал, раскрасневшийся от рюмки водки и обеда, и штаб офицер с именным перстнем, и Жерков, беспокойно оглядывавший всех, и князь Андрей, бледный, с поджатыми губами и лихорадочно блестящими глазами.
В избе стояло прислоненное в углу взятое французское знамя, и аудитор с наивным лицом щупал ткань знамени и, недоумевая, покачивал головой, может быть оттого, что его и в самом деле интересовал вид знамени, а может быть, и оттого, что ему тяжело было голодному смотреть на обед, за которым ему не достало прибора. В соседней избе находился взятый в плен драгунами французский полковник. Около него толпились, рассматривая его, наши офицеры. Князь Багратион благодарил отдельных начальников и расспрашивал о подробностях дела и о потерях. Полковой командир, представлявшийся под Браунау, докладывал князю, что, как только началось дело, он отступил из леса, собрал дроворубов и, пропустив их мимо себя, с двумя баталионами ударил в штыки и опрокинул французов.