Гистондеацетилаза 8

Поделись знанием:
Перейти к: навигация, поиск
Гистондеацетилаза 8

PDB представлено на основе 1t64.
Доступные структуры
PDB Поиск ортологов: [www.ebi.ac.uk/pdbe/searchResults.html?display=both&term=Q9BY41%20or%20Q8VH37%20or%20A2AWU6%20or%20Q7SXM0 PDBe], [www.rcsb.org/pdb/search/smartSubquery.do?smartSearchSubtype=UpAccessionIdQuery&accessionIdList=Q9BY41,Q8VH37,A2AWU6,Q7SXM0 RCSB]
Идентификаторы
Символ[www.genenames.org/cgi-bin/gene_symbol_report?hgnc_id=13315 HDAC8] ; CDLS5; HD8; HDACL1; MRXS6; RPD3; WTS
Внешние IDOMIM: [omim.org/entry/300269 300269 ] MGI: [www.informatics.jax.org/searches/accession_report.cgi?id=MGI:1917565 1917565 ] HomoloGene: [www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?cmd=Retrieve&db=homologene&dopt=HomoloGene&list_uids=41274 41274 ] IUPHAR: ChEMBL: [www.ebi.ac.uk/chembldb/index.php/target/inspect/CHEMBL3192 3192] GeneCards: [www.genecards.org/cgi-bin/carddisp.pl?id_type=entrezgene&id=55869 HDAC8 Gene]
номер EC[www.genome.jp/dbget-bin/www_bget?enzyme+3.5.1.98 3.5.1.98]
Ортологи
ВидЧеловекМышь
Entrez[www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=gene&cmd=retrieve&dopt=default&list_uids=55869&rn=1 55869][www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=gene&cmd=retrieve&dopt=default&list_uids=70315&rn=1 70315]
Ensembl[www.ensembl.org/Homo_sapiens/geneview?gene=ENSG00000147099;db=core ENSG00000147099][www.ensembl.org/Mus_musculus/geneview?gene=ENSMUSG00000067567;db=core ENSMUSG00000067567]
UniProt[www.expasy.org/uniprot/Q9BY41 Q9BY41][www.expasy.org/uniprot/Q8VH37 Q8VH37]
RefSeq (мРНК)[www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/viewer.fcgi?val=NM_001166418 NM_001166418][www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/viewer.fcgi?val=NM_027382 NM_027382]
RefSeq (белок)[www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/viewer.fcgi?val=NP_001159890 NP_001159890][www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/viewer.fcgi?val=NP_081658 NP_081658]
Локус (UCSC)[genome.ucsc.edu/cgi-bin/hgTracks?org=Human&db=hg19&position=chrHG1438_PATCH:71549366-71792953 Chr HG1438_PATCH:
71.55 – 71.79 Mb]
[genome.ucsc.edu/cgi-bin/hgTracks?org=Mouse&db=mm10&position=chrX:102284639-102505359 Chr X:
102.28 – 102.51 Mb]
Поиск в PubMed[www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/entrez?db=gene&cmd=Link&LinkName=gene_pubmed&from_uid=55869][www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/entrez?db=gene&cmd=Link&LinkName=gene_pubmed&from_uid=70315]

Гистондеацетилаза 8 (англ. Histone deacetylase 8) — фермент, кодируемый у человека геном HDAC8 [1][2][3].





Функция

Гистоны играют важнейшую роль в регуляции транскрипции, прогрессировании клеточного цикла и процессов развития. Ацетилирование/деацетилирование гистонов изменяет хромосомную структуру и влияет на доступ факторов транскрипции к ДНК. Белок, кодируемый этим геном относится к классу I в семействе гистондезацетилазы/acuc/Apha. Он обладает деятельностью гистондеацетилазы и подавляет транскрипцию, когда связан с промотором[3].

Гистондеацетилаза 8 участвует в морфогенезе черепа[4] и метаболическом контроле над комплексом транскрипции ERR-альфа[en]/PGC1-alpha[en][5].

Клиническое значение

HDAC8 был связан с некоторым числом болезненных состояний, в частности, с острым миелоидным лейкозом, а также связан с актиновым цитоскелетом в клетках гладких мышц. миРНК ориентированные на HDAC8 показали противораковые эффекты[6]. Ингибирование индуцированного апоптоза посредством HDAC8 наблюдается при Т-клеточных лимфомах[en][7]. Кроме того фермент HDAC8 участвует в патогенезе нейробластомы[8]. Таким образом, существует интерес к разработке селективных ингибиторов на базе HDAC8[9][10].

Взаимодействия

См также

Напишите отзыв о статье "Гистондеацетилаза 8"

Примечания

  1. McDonell N, Ramser J, Francis F, Vinet MC, Rider S, Sudbrak R, Riesselman L, Yaspo ML, Reinhardt R, Monaco AP, Ross F, Kahn A, Kearney L, Buckle V, Chelly J (May 2000). «Characterization of a highly complex region in Xq13 and mapping of three isodicentric breakpoints associated with preleukemia». Genomics 64 (3): 221–9. DOI:10.1006/geno.2000.6128. PMID 10756090.
  2. Van den Wyngaert I, de Vries W, Kremer A, Neefs J, Verhasselt P, Luyten WH, Kass SU (Aug 2000). «Cloning and characterization of human histone deacetylase 8». FEBS Lett 478 (1-2): 77–83. DOI:10.1016/S0014-5793(00)01813-5. PMID 10922473.
  3. 1 2 [www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/entrez?Db=gene&Cmd=ShowDetailView&TermToSearch=55869 Entrez Gene: HDAC8 histone deacetylase 8].
  4. Haberland M, Mokalled MH, Montgomery RL, Olson EN (July 2009). «Epigenetic control of skull morphogenesis by histone deacetylase 8». Genes Dev. 23 (14): 1625–30. DOI:10.1101/gad.1809209. PMID 19605684.
  5. 1 2 Wilson BJ, Tremblay AM, Deblois G, Sylvain-Drolet G, Giguère V (July 2010). «An acetylation switch modulates the transcriptional activity of estrogen-related receptor alpha». Mol. Endocrinol. 24 (7): 1349–58. DOI:10.1210/me.2009-0441. PMID 20484414.
  6. Gallinari P, Di Marco S, Jones P, Pallaoro M, Steinkühler C (March 2007). «HDACs, histone deacetylation and gene transcription: from molecular biology to cancer therapeutics». Cell Res. 17 (3): 195–211. DOI:10.1038/sj.cr.7310149. PMID 17325692.
  7. Balasubramanian S, Ramos J, Luo W, Sirisawad M, Verner E, Buggy JJ (May 2008). «A novel histone deacetylase 8 (HDAC8)-specific inhibitor PCI-34051 induces apoptosis in T-cell lymphomas». Leukemia 22 (5): 1026–34. DOI:10.1038/leu.2008.9. PMID 18256683.
  8. Oehme I, Deubzer HE, Wegener D, Pickert D, Linke JP, Hero B, Kopp-Schneider A, Westermann F, Ulrich SM, von Deimling A, Fischer M, Witt O (January 2009). «Histone deacetylase 8 in neuroblastoma tumorigenesis». Clin. Cancer Res. 15 (1): 91–9. DOI:10.1158/1078-0432.CCR-08-0684. PMID 19118036.
  9. Patil V, Sodji QH, Kornacki JR, Mrksich M, Oyelere AK (May 2013). «3-Hydroxypyridin-2-thione as novel zinc binding group for selective histone deacetylase inhibition». Journal of Medicinal Chemistry 56 (9): 3492–506. DOI:10.1021/jm301769u. PMID 23547652.
  10. Suzuki T, Ota Y, Ri M, Bando M, Gotoh A, Itoh Y, Tsumoto H, Tatum PR, Mizukami T, Nakagawa H, Iida S, Ueda R, Shirahige K, Miyata N (November 2012). «Rapid discovery of highly potent and selective inhibitors of histone deacetylase 8 using click chemistry to generate candidate libraries». Journal of Medicinal Chemistry 55 (22): 9562–75. DOI:10.1021/jm300837y. PMID 23116147.

Литература

  • Waltregny D, De Leval L, Glénisson W, Ly Tran S, North BJ, Bellahcène A, Weidle U, Verdin E, Castronovo V. (2004). «Expression of histone deacetylase 8, a class I histone deacetylase, is restricted to cells showing smooth muscle differentiation in normal human tissues.». Am J Pathol. 165 (2): 553–64. DOI:10.1016/S0002-9440(10)63320-2. PMID 15277229.
  • Glénisson W, Waltregny D, Tran SL, North BJ, Verdin E, Colige A, Castronovo V. (June 2005). «Histone deacetylase HDAC8 associates with smooth muscle alpha-actin and is essential for smooth muscle cell contractility.». FASEB J. 19 (8): 966–8. DOI:10.1096/fj.04-2303fje. PMID 15772115.
  • Wedel T, Van Eys GJ, Waltregny D, Glénisson W, Castronovo V, Vanderwinden JM. (2006). «Novel smooth muscle markers reveal abnormalities of the intestinal musculature in severe colorectal motility disorders.». Neurogastroenterol Motil. 18 (7): 526–38. DOI:10.1111/j.1365-2982.2006.00781.x. PMID 16771768.
  • Verdin E, Dequiedt F, Kasler HG (2003). «Class II histone deacetylases: versatile regulators.». Trends Genet. 19 (5): 286–93. DOI:10.1016/S0168-9525(03)00073-8. PMID 12711221.
  • Hu E, Chen Z, Fredrickson T, et al. (2000). «Cloning and characterization of a novel human class I histone deacetylase that functions as a transcription repressor.». J. Biol. Chem. 275 (20): 15254–64. DOI:10.1074/jbc.M908988199. PMID 10748112.
  • Buggy JJ, Sideris ML, Mak P, et al. (2001). «Cloning and characterization of a novel human histone deacetylase, HDAC8.». Biochem. J. 350 (1): 199–205. DOI:10.1042/0264-6021:3500199. PMID 10926844.
  • Amann JM, Nip J, Strom DK, et al. (2001). «ETO, a target of t(8;21) in acute leukemia, makes distinct contacts with multiple histone deacetylases and binds mSin3A through its oligomerization domain.». Mol. Cell. Biol. 21 (19): 6470–83. DOI:10.1128/MCB.21.19.6470-6483.2001. PMID 11533236.
  • Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Generation and initial analysis of more than 15,000 full-length human and mouse cDNA sequences.». Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 99 (26): 16899–903. DOI:10.1073/pnas.242603899. PMID 12477932.
  • Durst KL, Lutterbach B, Kummalue T, et al. (2003). «The inv(16) fusion protein associates with corepressors via a smooth muscle myosin heavy-chain domain.». Mol. Cell. Biol. 23 (2): 607–19. DOI:10.1128/MCB.23.2.607-619.2003. PMID 12509458.
  • Rodriguez M, Yu X, Chen J, Songyang Z (2004). «Phosphopeptide binding specificities of BRCA1 COOH-terminal (BRCT) domains.». J. Biol. Chem. 278 (52): 52914–8. DOI:10.1074/jbc.C300407200. PMID 14578343.
  • Johnson JM, Castle J, Garrett-Engele P, et al. (2004). «Genome-wide survey of human alternative pre-mRNA splicing with exon junction microarrays.». Science 302 (5653): 2141–4. DOI:10.1126/science.1090100. PMID 14684825.
  • Lee H, Rezai-Zadeh N, Seto E (2004). «Negative regulation of histone deacetylase 8 activity by cyclic AMP-dependent protein kinase A.». Mol. Cell. Biol. 24 (2): 765–73. DOI:10.1128/MCB.24.2.765-773.2004. PMID 14701748.
  • Vannini A, Volpari C, Filocamo G, et al. (2004). «Crystal structure of a eukaryotic zinc-dependent histone deacetylase, human HDAC8, complexed with a hydroxamic acid inhibitor.». Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 101 (42): 15064–9. DOI:10.1073/pnas.0404603101. PMID 15477595.
  • Waltregny D, North B, Van Mellaert F, et al. (2005). «Screening of histone deacetylases (HDAC) expression in human prostate cancer reveals distinct class I HDAC profiles between epithelial and stromal cells.». European Journal of Histochemistry 48 (3): 273–90. PMID 15590418.
  • Waltregny D, Glénisson W, Tran SL, et al. (2006). «Histone deacetylase HDAC8 associates with smooth muscle alpha-actin and is essential for smooth muscle cell contractility.». FASEB J. 19 (8): 966–8. DOI:10.1096/fj.04-2303fje. PMID 15772115.
  • Gantt SL, Gattis SG, Fierke CA (2006). «Catalytic activity and inhibition of human histone deacetylase 8 is dependent on the identity of the active site metal ion.». Biochemistry 45 (19): 6170–8. DOI:10.1021/bi060212u. PMID 16681389.
  • Lee H, Sengupta N, Villagra A, et al. (2006). «Histone deacetylase 8 safeguards the human ever-shorter telomeres 1B (hEST1B) protein from ubiquitin-mediated degradation.». Mol. Cell. Biol. 26 (14): 5259–69. DOI:10.1128/MCB.01971-05. PMID 16809764.
  • Vannini A, Volpari C, Gallinari P, et al. (2007). «Substrate binding to histone deacetylases as shown by the crystal structure of the HDAC8-substrate complex.». EMBO Reports 8 (9): 879–84. DOI:10.1038/sj.embor.7401047. PMID 17721440.
  • Nakagawa M, Oda Y, Eguchi T, et al. (2007). «Expression profile of class I histone deacetylases in human cancer tissues.». Oncol. Rep. 18 (4): 769–74. DOI:10.3892/or.18.4.769. PMID 17786334.

Ссылки

Отрывок, характеризующий Гистондеацетилаза 8



3 го марта во всех комнатах Английского клуба стоял стон разговаривающих голосов и, как пчелы на весеннем пролете, сновали взад и вперед, сидели, стояли, сходились и расходились, в мундирах, фраках и еще кое кто в пудре и кафтанах, члены и гости клуба. Пудренные, в чулках и башмаках ливрейные лакеи стояли у каждой двери и напряженно старались уловить каждое движение гостей и членов клуба, чтобы предложить свои услуги. Большинство присутствовавших были старые, почтенные люди с широкими, самоуверенными лицами, толстыми пальцами, твердыми движениями и голосами. Этого рода гости и члены сидели по известным, привычным местам и сходились в известных, привычных кружках. Малая часть присутствовавших состояла из случайных гостей – преимущественно молодежи, в числе которой были Денисов, Ростов и Долохов, который был опять семеновским офицером. На лицах молодежи, особенно военной, было выражение того чувства презрительной почтительности к старикам, которое как будто говорит старому поколению: уважать и почитать вас мы готовы, но помните, что всё таки за нами будущность.
Несвицкий был тут же, как старый член клуба. Пьер, по приказанию жены отпустивший волоса, снявший очки и одетый по модному, но с грустным и унылым видом, ходил по залам. Его, как и везде, окружала атмосфера людей, преклонявшихся перед его богатством, и он с привычкой царствования и рассеянной презрительностью обращался с ними.
По годам он бы должен был быть с молодыми, по богатству и связям он был членом кружков старых, почтенных гостей, и потому он переходил от одного кружка к другому.
Старики из самых значительных составляли центр кружков, к которым почтительно приближались даже незнакомые, чтобы послушать известных людей. Большие кружки составлялись около графа Ростопчина, Валуева и Нарышкина. Ростопчин рассказывал про то, как русские были смяты бежавшими австрийцами и должны были штыком прокладывать себе дорогу сквозь беглецов.
Валуев конфиденциально рассказывал, что Уваров был прислан из Петербурга, для того чтобы узнать мнение москвичей об Аустерлице.
В третьем кружке Нарышкин говорил о заседании австрийского военного совета, в котором Суворов закричал петухом в ответ на глупость австрийских генералов. Шиншин, стоявший тут же, хотел пошутить, сказав, что Кутузов, видно, и этому нетрудному искусству – кричать по петушиному – не мог выучиться у Суворова; но старички строго посмотрели на шутника, давая ему тем чувствовать, что здесь и в нынешний день так неприлично было говорить про Кутузова.
Граф Илья Андреич Ростов, озабоченно, торопливо похаживал в своих мягких сапогах из столовой в гостиную, поспешно и совершенно одинаково здороваясь с важными и неважными лицами, которых он всех знал, и изредка отыскивая глазами своего стройного молодца сына, радостно останавливал на нем свой взгляд и подмигивал ему. Молодой Ростов стоял у окна с Долоховым, с которым он недавно познакомился, и знакомством которого он дорожил. Старый граф подошел к ним и пожал руку Долохову.
– Ко мне милости прошу, вот ты с моим молодцом знаком… вместе там, вместе геройствовали… A! Василий Игнатьич… здорово старый, – обратился он к проходившему старичку, но не успел еще договорить приветствия, как всё зашевелилось, и прибежавший лакей, с испуганным лицом, доложил: пожаловали!
Раздались звонки; старшины бросились вперед; разбросанные в разных комнатах гости, как встряхнутая рожь на лопате, столпились в одну кучу и остановились в большой гостиной у дверей залы.
В дверях передней показался Багратион, без шляпы и шпаги, которые он, по клубному обычаю, оставил у швейцара. Он был не в смушковом картузе с нагайкой через плечо, как видел его Ростов в ночь накануне Аустерлицкого сражения, а в новом узком мундире с русскими и иностранными орденами и с георгиевской звездой на левой стороне груди. Он видимо сейчас, перед обедом, подстриг волосы и бакенбарды, что невыгодно изменяло его физиономию. На лице его было что то наивно праздничное, дававшее, в соединении с его твердыми, мужественными чертами, даже несколько комическое выражение его лицу. Беклешов и Федор Петрович Уваров, приехавшие с ним вместе, остановились в дверях, желая, чтобы он, как главный гость, прошел вперед их. Багратион смешался, не желая воспользоваться их учтивостью; произошла остановка в дверях, и наконец Багратион всё таки прошел вперед. Он шел, не зная куда девать руки, застенчиво и неловко, по паркету приемной: ему привычнее и легче было ходить под пулями по вспаханному полю, как он шел перед Курским полком в Шенграбене. Старшины встретили его у первой двери, сказав ему несколько слов о радости видеть столь дорогого гостя, и недождавшись его ответа, как бы завладев им, окружили его и повели в гостиную. В дверях гостиной не было возможности пройти от столпившихся членов и гостей, давивших друг друга и через плечи друг друга старавшихся, как редкого зверя, рассмотреть Багратиона. Граф Илья Андреич, энергичнее всех, смеясь и приговаривая: – пусти, mon cher, пусти, пусти, – протолкал толпу, провел гостей в гостиную и посадил на средний диван. Тузы, почетнейшие члены клуба, обступили вновь прибывших. Граф Илья Андреич, проталкиваясь опять через толпу, вышел из гостиной и с другим старшиной через минуту явился, неся большое серебряное блюдо, которое он поднес князю Багратиону. На блюде лежали сочиненные и напечатанные в честь героя стихи. Багратион, увидав блюдо, испуганно оглянулся, как бы отыскивая помощи. Но во всех глазах было требование того, чтобы он покорился. Чувствуя себя в их власти, Багратион решительно, обеими руками, взял блюдо и сердито, укоризненно посмотрел на графа, подносившего его. Кто то услужливо вынул из рук Багратиона блюдо (а то бы он, казалось, намерен был держать его так до вечера и так итти к столу) и обратил его внимание на стихи. «Ну и прочту», как будто сказал Багратион и устремив усталые глаза на бумагу, стал читать с сосредоточенным и серьезным видом. Сам сочинитель взял стихи и стал читать. Князь Багратион склонил голову и слушал.
«Славь Александра век
И охраняй нам Тита на престоле,
Будь купно страшный вождь и добрый человек,
Рифей в отечестве а Цесарь в бранном поле.
Да счастливый Наполеон,
Познав чрез опыты, каков Багратион,
Не смеет утруждать Алкидов русских боле…»
Но еще он не кончил стихов, как громогласный дворецкий провозгласил: «Кушанье готово!» Дверь отворилась, загремел из столовой польский: «Гром победы раздавайся, веселися храбрый росс», и граф Илья Андреич, сердито посмотрев на автора, продолжавшего читать стихи, раскланялся перед Багратионом. Все встали, чувствуя, что обед был важнее стихов, и опять Багратион впереди всех пошел к столу. На первом месте, между двух Александров – Беклешова и Нарышкина, что тоже имело значение по отношению к имени государя, посадили Багратиона: 300 человек разместились в столовой по чинам и важности, кто поважнее, поближе к чествуемому гостю: так же естественно, как вода разливается туда глубже, где местность ниже.
Перед самым обедом граф Илья Андреич представил князю своего сына. Багратион, узнав его, сказал несколько нескладных, неловких слов, как и все слова, которые он говорил в этот день. Граф Илья Андреич радостно и гордо оглядывал всех в то время, как Багратион говорил с его сыном.
Николай Ростов с Денисовым и новым знакомцем Долоховым сели вместе почти на середине стола. Напротив них сел Пьер рядом с князем Несвицким. Граф Илья Андреич сидел напротив Багратиона с другими старшинами и угащивал князя, олицетворяя в себе московское радушие.
Труды его не пропали даром. Обеды его, постный и скоромный, были великолепны, но совершенно спокоен он всё таки не мог быть до конца обеда. Он подмигивал буфетчику, шопотом приказывал лакеям, и не без волнения ожидал каждого, знакомого ему блюда. Всё было прекрасно. На втором блюде, вместе с исполинской стерлядью (увидав которую, Илья Андреич покраснел от радости и застенчивости), уже лакеи стали хлопать пробками и наливать шампанское. После рыбы, которая произвела некоторое впечатление, граф Илья Андреич переглянулся с другими старшинами. – «Много тостов будет, пора начинать!» – шепнул он и взяв бокал в руки – встал. Все замолкли и ожидали, что он скажет.