Белки F-box
| Домен F-box | |||||||||
 Структура белкового комплекса Skp1-Skp2 (Skp2 содержит F-box)[1]. | |||||||||
| Идентификаторы | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Символ |
F-box domain | ||||||||
| Pfam |
[pfam.xfam.org/family?acc=PF00646 PF00646] | ||||||||
| Pfam clan |
[pfam.xfam.org/clan/CL0271 CL0271] | ||||||||
| InterPro |
[www.ebi.ac.uk/interpro/entry/IPR001810 IPR001810] | ||||||||
| SMART |
[smart.embl-heidelberg.de/smart/do_annotation.pl?DOMAIN=SM00256 SM00256] | ||||||||
| PROSITE |
[www.expasy.org/cgi-bin/prosite-search-ac?PS50181 PS50181] | ||||||||
| SCOP |
[scop.mrc-lmb.cam.ac.uk/scop/search.cgi?tlev=fa;&pdb=1fs2 1fs2] | ||||||||
| SUPERFAMILY |
[supfam.org/SUPERFAMILY/cgi-bin/search.cgi?search_field=1fs2 1fs2] | ||||||||
| |||||||||
Белки F-box — белки, в которых есть хотя бы один домен F-box. Первый обнаруженный F-box-белок был одним из трёх компонентов SCF-комплекса, осуществляющего убиквитинирование белков, которые после этого разрушаются в протеосоме. F-box также участвуют в таких процессах как передача сигнала и регуляция клеточного цикла[2]. У растений многие F-box-белки участвуют в регуляции экспрессии генов и сайленсинге генов путём РНК-интерференции с микроРНК[3]. В клетках человека, в условиях повышенного содержания железа, два атома железа стабилизируют F-Box-белок FBXL5. Образовавшийся комплекс опосредует убиквитинирование белка IRP2, что приводит к снижению уровня железа в клетке.
Домен F-box — структурный мотив приблизительно из 50 аминокислот, который служит для взаимодействия с другими белками. Впервые его обнаружили в циклине F, откуда этот мотив и получил своё название. Мотив F-box непосредственно взаимодействует с белком SCF-комплекса Skp1[4], а F-box-домены обычно располагаются в белках в непосредственной близости от других мотивов для белок-белкового взаимодействия, таких как лейцин-обогащённые повторы и WD-повторы, которые, как полагают, осуществляют связывание белка-мишени, который убиквитинируется SCF-комплексом[5].
Примечания
- ↑ Schulman BA, Carrano AC, Jeffrey PD (November 2000). «Insights into SCF ubiquitin ligases from the structure of the Skp1-Skp2 complex». Nature 408 (6810): 381–6. DOI:10.1038/35042620. PMID 11099048.
- ↑ Craig KL, Tyers M (1999). «The F-box: a new motif for ubiquitin dependent proteolysis in cell cycle regulation and signal transduction». Prog. Biophys. Mol. Biol. 72 (3): 299–328. DOI:10.1016/S0079-6107(99)00010-3. PMID 10581972.
- ↑ Jones-Rhoades MW, Bartel DP, Bartel B (2006). «MicroRNAS and their regulatory roles in plants». Annu Rev Plant Biol 57: 19–53. DOI:10.1146/annurev.arplant.57.032905.105218. PMID 16669754.
- ↑ Bai C, Sen P, Hofmann K, Ma L, Goebl M, Harper JW, Elledge SJ (July 1996). «SKP1 connects cell cycle regulators to the ubiquitin proteolysis machinery through a novel motif, the F-box». Cell 86 (2): 263–74. DOI:10.1016/S0092-8674(00)80098-7. PMID 8706131.
- ↑ Kipreos ET, Pagano M (2000). «The F-box protein family». Genome Biol. 1 (5): REVIEWS3002. DOI:10.1186/gb-2000-1-5-reviews3002. PMID 11178263.
Дальнейшее чтение
- Ho M, Tsai P, Chien C (2006). «F-box proteins: the key to protein degradation.». J Biomed Sci 13 (2): 181–91. DOI:10.1007/s11373-005-9058-2. PMID 16463014.
