LAMP3

Поделись знанием:
Перейти к: навигация, поиск
LAMP3
Доступные структуры
PDB Поиск ортологов: [www.ebi.ac.uk/pdbe/searchResults.html?display=both&term=Q9UQV4%20or%20A7MBJ8%20or%20Q7TST5%20or%20Q8BZW9%20or%20Q5XI99 PDBe], [www.rcsb.org/pdb/search/smartSubquery.do?smartSearchSubtype=UpAccessionIdQuery&accessionIdList=Q9UQV4,A7MBJ8,Q7TST5,Q8BZW9,Q5XI99 RCSB]
Идентификаторы
Символ[www.genenames.org/cgi-bin/gene_symbol_report?hgnc_id=14582 LAMP3] ; CD208; DC LAMP; DC-LAMP; DCLAMP; LAMP; LAMP-3; TSC403
Внешние IDOMIM: [omim.org/entry/605883 605883 ] MGI: [www.informatics.jax.org/searches/accession_report.cgi?id=MGI:2441659 2441659 ] HomoloGene: [www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?cmd=Retrieve&db=homologene&dopt=HomoloGene&list_uids=8670 8670 ] GeneCards: [www.genecards.org/cgi-bin/carddisp.pl?id_type=entrezgene&id=27074 LAMP3 Gene]
Профиль экспрессии РНК
[biogps.org/gene/27074/ Больше информации]
Ортологи
ВидЧеловекМышь
Entrez[www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=gene&cmd=retrieve&dopt=default&list_uids=27074&rn=1 27074][www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=gene&cmd=retrieve&dopt=default&list_uids=239739&rn=1 239739]
Ensembl[www.ensembl.org/Homo_sapiens/geneview?gene=ENSG00000078081;db=core ENSG00000078081][www.ensembl.org/Mus_musculus/geneview?gene=ENSMUSG00000041247;db=core ENSMUSG00000041247]
UniProt[www.expasy.org/uniprot/Q9UQV4 Q9UQV4][www.expasy.org/uniprot/Q7TST5 Q7TST5]
RefSeq (мРНК)[www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/viewer.fcgi?val=NM_014398 NM_014398][www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/viewer.fcgi?val=NM_177356 NM_177356]
RefSeq (белок)[www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/viewer.fcgi?val=NP_055213 NP_055213][www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/viewer.fcgi?val=NP_796330 NP_796330]
Локус (UCSC)[genome.ucsc.edu/cgi-bin/hgTracks?org=Human&db=hg19&position=chr3:182840001-182881627 Chr 3:
182.84 – 182.88 Mb]
[genome.ucsc.edu/cgi-bin/hgTracks?org=Mouse&db=mm10&position=chr16:19653381-19706365 Chr 16:
19.65 – 19.71 Mb]
Поиск в PubMed[www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/entrez?db=gene&cmd=Link&LinkName=gene_pubmed&from_uid=27074][www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/entrez?db=gene&cmd=Link&LinkName=gene_pubmed&from_uid=239739]
LAMP3 (англ. Lysosomal-associated membrane protein 3) — гликопротеин лизосомальной мембраны из семейства белков LAMP. Представлен в лимфоидных органах и в дендритных клетках.



Структура

Зрелый белок LAMP3 относится к трансмембранным белкам, содержит 389 аминокислот (сигнальный пептид, направляющий вновь синтезированный белок к лизосомам и позже отщепляющийся, содержит 27 аминокислот).

Тканевая специфичность

В отличие от двух основных белков семейства LAMP1 и LAMP2, этот белок в основном экпрессируется в лимфоидных органах и дендритных клетках, а также в лёгких. Повышенная экспрессия LAMP3 наблюдается в клетках карциномы пищевода, толстого кишечника, желудка, груди и др. тканей.[1]

Патология

Нарушение гена LAMP3 связано с риском возникновения болезни Паркинсона.[2]

См. также

Напишите отзыв о статье "LAMP3"

Примечания

  1. [www.uniprot.org/uniprot/Q9UQV4 LAMP3_HUMAN, UniProtKB/Swiss-Prot]
  2. [Zimprich A (August 2011). «Genetics of Parkinson's disease and essential tremor». Curr. Opin. Neurol. 24 (4): 318–23. DOI:10.1097/WCO.0b013e3283484b87. PMID 21734494.]

Библиография

  • de Saint-Vis B, Vincent J, Vandenabeele S, et al. (1998). «A novel lysosome-associated membrane glycoprotein, DC-LAMP, induced upon DC maturation, is transiently expressed in MHC class II compartment.». Immunity 9 (3): 325–36. DOI:10.1016/S1074-7613(00)80615-9. PMID 9768752.
  • Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Generation and initial analysis of more than 15,000 full-length human and mouse cDNA sequences.». Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 99 (26): 16899–903. DOI:10.1073/pnas.242603899. PMID 12477932.
  • Akasaki K, Nakamura N, Tsukui N, et al. (2004). «Human dendritic cell lysosome-associated membrane protein expressed in lung type II pneumocytes.». Arch. Biochem. Biophys. 425 (2): 147–57. DOI:10.1016/j.abb.2004.02.042. PMID 15111122.
  • Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA, et al. (2004). «The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).». Genome Res. 14 (10B): 2121–7. DOI:10.1101/gr.2596504. PMID 15489334.
  • Kanao H, Enomoto T, Kimura T, et al. (2005). «Overexpression of LAMP3/TSC403/DC-LAMP promotes metastasis in uterine cervical cancer.». Cancer Res. 65 (19): 8640–5. DOI:10.1158/0008-5472.CAN-04-4112. PMID 16204031.
  • Kimura K, Wakamatsu A, Suzuki Y, et al. (2006). «Diversification of transcriptional modulation: large-scale identification and characterization of putative alternative promoters of human genes.». Genome Res. 16 (1): 55–65. DOI:10.1101/gr.4039406. PMID 16344560.
  • Arruda LB, Sim D, Chikhlikar PR, et al. (2006). «Dendritic cell-lysosomal-associated membrane protein (LAMP) and LAMP-1-HIV-1 gag chimeras have distinct cellular trafficking pathways and prime T and B cell responses to a diverse repertoire of epitopes.». J. Immunol. 177 (4): 2265–75. PMID 16887987.
  • Zhu LC, Yim J, Chiriboga L, et al. (2007). «DC-LAMP stains pulmonary adenocarcinoma with bronchiolar Clara cell differentiation.». Hum. Pathol. 38 (2): 260–8. DOI:10.1016/j.humpath.2006.07.018. PMID 17056097.
  • Elliott B, Scolyer RA, Suciu S, et al. (2007). «Long-term protective effect of mature DC-LAMP+ dendritic cell accumulation in sentinel lymph nodes containing micrometastatic melanoma.». Clin. Cancer Res. 13 (13): 3825–30. DOI:10.1158/1078-0432.CCR-07-0358. PMID 17606713.

Отрывок, характеризующий LAMP3

– A t on distribue les biscuits et le riz aux regiments de la garde? [Роздали ли сухари и рис гвардейцам?] – строго спросил Наполеон.
– Oui, Sire. [Да, государь.]
– Mais le riz? [Но рис?]
Рапп отвечал, что он передал приказанья государя о рисе, но Наполеон недовольно покачал головой, как будто он не верил, чтобы приказание его было исполнено. Слуга вошел с пуншем. Наполеон велел подать другой стакан Раппу и молча отпивал глотки из своего.
– У меня нет ни вкуса, ни обоняния, – сказал он, принюхиваясь к стакану. – Этот насморк надоел мне. Они толкуют про медицину. Какая медицина, когда они не могут вылечить насморка? Корвизар дал мне эти пастильки, но они ничего не помогают. Что они могут лечить? Лечить нельзя. Notre corps est une machine a vivre. Il est organise pour cela, c'est sa nature; laissez y la vie a son aise, qu'elle s'y defende elle meme: elle fera plus que si vous la paralysiez en l'encombrant de remedes. Notre corps est comme une montre parfaite qui doit aller un certain temps; l'horloger n'a pas la faculte de l'ouvrir, il ne peut la manier qu'a tatons et les yeux bandes. Notre corps est une machine a vivre, voila tout. [Наше тело есть машина для жизни. Оно для этого устроено. Оставьте в нем жизнь в покое, пускай она сама защищается, она больше сделает одна, чем когда вы ей будете мешать лекарствами. Наше тело подобно часам, которые должны идти известное время; часовщик не может открыть их и только ощупью и с завязанными глазами может управлять ими. Наше тело есть машина для жизни. Вот и все.] – И как будто вступив на путь определений, definitions, которые любил Наполеон, он неожиданно сделал новое определение. – Вы знаете ли, Рапп, что такое военное искусство? – спросил он. – Искусство быть сильнее неприятеля в известный момент. Voila tout. [Вот и все.]
Рапп ничего не ответил.
– Demainnous allons avoir affaire a Koutouzoff! [Завтра мы будем иметь дело с Кутузовым!] – сказал Наполеон. – Посмотрим! Помните, в Браунау он командовал армией и ни разу в три недели не сел на лошадь, чтобы осмотреть укрепления. Посмотрим!
Он поглядел на часы. Было еще только четыре часа. Спать не хотелось, пунш был допит, и делать все таки было нечего. Он встал, прошелся взад и вперед, надел теплый сюртук и шляпу и вышел из палатки. Ночь была темная и сырая; чуть слышная сырость падала сверху. Костры не ярко горели вблизи, во французской гвардии, и далеко сквозь дым блестели по русской линии. Везде было тихо, и ясно слышались шорох и топот начавшегося уже движения французских войск для занятия позиции.
Наполеон прошелся перед палаткой, посмотрел на огни, прислушался к топоту и, проходя мимо высокого гвардейца в мохнатой шапке, стоявшего часовым у его палатки и, как черный столб, вытянувшегося при появлении императора, остановился против него.
– С которого года в службе? – спросил он с той привычной аффектацией грубой и ласковой воинственности, с которой он всегда обращался с солдатами. Солдат отвечал ему.
– Ah! un des vieux! [А! из стариков!] Получили рис в полк?
– Получили, ваше величество.
Наполеон кивнул головой и отошел от него.

В половине шестого Наполеон верхом ехал к деревне Шевардину.
Начинало светать, небо расчистило, только одна туча лежала на востоке. Покинутые костры догорали в слабом свете утра.