E-кадгерин

Поделись знанием:
Перейти к: навигация, поиск
Кадгерин 1, тип 1, E-кадгерин (эпителий)

[www.rcsb.org/pdb/cgi/explore.cgi?pdbId=1i7w 1i7w]
Доступные структуры
PDB Поиск ортологов: [www.ebi.ac.uk/pdbe/searchResults.html?display=both&term=P12830%20or%20A8K1U7%20or%20Q6R8F2%20or%20P09803%20or%20Q9R0T4%20or%20P08641%20or%20Q90Z37 PDBe], [www.rcsb.org/pdb/search/smartSubquery.do?smartSearchSubtype=UpAccessionIdQuery&accessionIdList=P12830,A8K1U7,Q6R8F2,P09803,Q9R0T4,P08641,Q90Z37 RCSB]
Идентификаторы
Символ[www.genenames.org/cgi-bin/gene_symbol_report?hgnc_id=1748 CDH1] ; Arc-1; CD324; CDHE; ECAD; LCAM; UVO
Внешние IDOMIM: [omim.org/entry/192090 192090 ] MGI: [www.informatics.jax.org/searches/accession_report.cgi?id=MGI:88354 88354 ] HomoloGene: [www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?cmd=Retrieve&db=homologene&dopt=HomoloGene&list_uids=20917 20917 ] GeneCards: [www.genecards.org/cgi-bin/carddisp.pl?id_type=entrezgene&id=999 CDH1 Gene]
Профиль экспрессии РНК
[biogps.org/gene/999/ Больше информации]
Ортологи
ВидЧеловекМышь
Entrez[www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=gene&cmd=retrieve&dopt=default&list_uids=999&rn=1 999][www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=gene&cmd=retrieve&dopt=default&list_uids=12550&rn=1 12550]
Ensembl[www.ensembl.org/Homo_sapiens/geneview?gene=ENSG00000039068;db=core ENSG00000039068][www.ensembl.org/Mus_musculus/geneview?gene=ENSMUSG00000000303;db=core ENSMUSG00000000303]
UniProt[www.expasy.org/uniprot/P12830 P12830][www.expasy.org/uniprot/P09803 P09803]
RefSeq (мРНК)[www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/viewer.fcgi?val=NM_004360 NM_004360][www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/viewer.fcgi?val=NM_009864 NM_009864]
RefSeq (белок)[www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/viewer.fcgi?val=NP_004351 NP_004351][www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/viewer.fcgi?val=NP_033994 NP_033994]
Локус (UCSC)[genome.ucsc.edu/cgi-bin/hgTracks?org=Human&db=hg19&position=chr16:68771128-68869451 Chr 16:
68.77 – 68.87 Mb]
[genome.ucsc.edu/cgi-bin/hgTracks?org=Mouse&db=mm10&position=chr8:106603351-106670246 Chr 8:
106.6 – 106.67 Mb]
Поиск в PubMed[www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/entrez?db=gene&cmd=Link&LinkName=gene_pubmed&from_uid=999][www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/entrez?db=gene&cmd=Link&LinkName=gene_pubmed&from_uid=12550]
E-кадгерин (эпителиальный кадгерин; кадгерин-1, 1-го типа; CDH1, CD324) — мембранный белок, гликопротеин из надсемейства кадгеринов, продукт гена CDH1. Ген был впервые клонирован в 1987 году.[1]



Функции

E-кадгерин вместе с N- и P-кадгеринами относится к 1-му типу кадгеринов, кальций-зависимым белкам клеточной адгезии. Они вовлечены в гомофильные взаимодействия, образуя межклеточные контакты.

E-кадгерин вовлечён в механизмы регулировки межклеточной адгезии, клеточной подвижности и пролиферации эпителиальных клеток. Имеет потенциальную супрессорную роль в клеточной инвазивности. Является лигандом для интегринового рецептора альфа-E/бета-7.

Домен E-кадгерина CTF2 стимулируют неамилоидную деградацию предшественника амилоида-бета (APP) и ингибирует образование продуктов C99 и C83.[2]

Структура

E-кадгерин состоит из 728 аминокислот (после созревания), молекулярная масса белковой части — 97,5 кДа. Основной N-концевой участок (555 аминокислот) является внеклеточным, далее расположен единственный трансмембранный фрагмент и внутриклеточный фрагмент (152 аминокислота). Внеклеточный фрагмент включает 5 повторов кадгеринового домена и 4 участка N-гликозилирования. Цитозольный фрагмент содержит 3 участка фосфорилирования (по сериновому остатку).

Белок содержит 3 позиции, которые могут гидролизоваться под действием протеаз и образовывать активные фрагменты. Позиция 700-701 гидролизуется металлопротеазой с образованием фрагмента водного CTF1. Позиция 731-732 расщепляется гамма-секретазой/PS1 с образованием фрагмента CTF2. Связь 750-751 гидролизуется каспазой-3 с образованием CTF3.

Патология

Нарушения гена коррелируют с развитием карцином желудка, молочной железы, толстой кишки, вилочковой железы и яичников.

См.также

Напишите отзыв о статье "E-кадгерин"

Примечания

  1. Mansouri A, Spurr N, Goodfellow PN, Kemler R (June 1988). «Characterization and chromosomal localization of the gene encoding the human cell adhesion molecule uvomorulin». Differentiation 38 (1): 67–71. PMID 3263290.
  2. [www.uniprot.org/uniprot/P12830 Uniprot database entry for CD324 (accession number P12830)]

Библиография

  • Becker SF, Langhe R, Huang C, Wedlich D, Kashef J (March 2012). «Giving the right tug for migration: Cadherins in tissue movements». Arch Biochem Biophys. DOI:10.1016/j.abb.2012.02.013. PMID 22387375.
  • Brigidi GS, Bamji SX (April 2011). «Cadherin-catenin adhesion complexes at the synapse». Curr. Opin. Neurobiol. 21 (2): 208–14. DOI:10.1016/j.conb.2010.12.004. PMID 21255999.
  • Grabowska MM, Day ML (2012). «Soluble E-cadherin: more than a symptom of disease». Front. Biosci. 17: 1948–64. PMID 22201848.
  • Buda A, Pignatelli M (December 2011). «E-cadherin and the cytoskeletal network in colorectal cancer development and metastasis». Cell Commun. Adhes. 18 (6): 133–43. DOI:10.3109/15419061.2011.636465. PMID 22176698.

Отрывок, характеризующий E-кадгерин

«Поступить в военную службу и ехать в армию или дожидаться? – в сотый раз задавал себе Пьер этот вопрос. Он взял колоду карт, лежавших у него на столе, и стал делать пасьянс.
– Ежели выйдет этот пасьянс, – говорил он сам себе, смешав колоду, держа ее в руке и глядя вверх, – ежели выйдет, то значит… что значит?.. – Он не успел решить, что значит, как за дверью кабинета послышался голос старшей княжны, спрашивающей, можно ли войти.
– Тогда будет значить, что я должен ехать в армию, – договорил себе Пьер. – Войдите, войдите, – прибавил он, обращаясь к княжие.
(Одна старшая княжна, с длинной талией и окаменелым лидом, продолжала жить в доме Пьера; две меньшие вышли замуж.)
– Простите, mon cousin, что я пришла к вам, – сказала она укоризненно взволнованным голосом. – Ведь надо наконец на что нибудь решиться! Что ж это будет такое? Все выехали из Москвы, и народ бунтует. Что ж мы остаемся?
– Напротив, все, кажется, благополучно, ma cousine, – сказал Пьер с тою привычкой шутливости, которую Пьер, всегда конфузно переносивший свою роль благодетеля перед княжною, усвоил себе в отношении к ней.
– Да, это благополучно… хорошо благополучие! Мне нынче Варвара Ивановна порассказала, как войска наши отличаются. Уж точно можно чести приписать. Да и народ совсем взбунтовался, слушать перестают; девка моя и та грубить стала. Этак скоро и нас бить станут. По улицам ходить нельзя. А главное, нынче завтра французы будут, что ж нам ждать! Я об одном прошу, mon cousin, – сказала княжна, – прикажите свезти меня в Петербург: какая я ни есть, а я под бонапартовской властью жить не могу.
– Да полноте, ma cousine, откуда вы почерпаете ваши сведения? Напротив…
– Я вашему Наполеону не покорюсь. Другие как хотят… Ежели вы не хотите этого сделать…
– Да я сделаю, я сейчас прикажу.
Княжне, видимо, досадно было, что не на кого было сердиться. Она, что то шепча, присела на стул.
– Но вам это неправильно доносят, – сказал Пьер. – В городе все тихо, и опасности никакой нет. Вот я сейчас читал… – Пьер показал княжне афишки. – Граф пишет, что он жизнью отвечает, что неприятель не будет в Москве.
– Ах, этот ваш граф, – с злобой заговорила княжна, – это лицемер, злодей, который сам настроил народ бунтовать. Разве не он писал в этих дурацких афишах, что какой бы там ни был, тащи его за хохол на съезжую (и как глупо)! Кто возьмет, говорит, тому и честь и слава. Вот и долюбезничался. Варвара Ивановна говорила, что чуть не убил народ ее за то, что она по французски заговорила…
– Да ведь это так… Вы всё к сердцу очень принимаете, – сказал Пьер и стал раскладывать пасьянс.
Несмотря на то, что пасьянс сошелся, Пьер не поехал в армию, а остался в опустевшей Москве, все в той же тревоге, нерешимости, в страхе и вместе в радости ожидая чего то ужасного.
На другой день княжна к вечеру уехала, и к Пьеру приехал его главноуправляющий с известием, что требуемых им денег для обмундирования полка нельзя достать, ежели не продать одно имение. Главноуправляющий вообще представлял Пьеру, что все эти затеи полка должны были разорить его. Пьер с трудом скрывал улыбку, слушая слова управляющего.
– Ну, продайте, – говорил он. – Что ж делать, я не могу отказаться теперь!
Чем хуже было положение всяких дел, и в особенности его дел, тем Пьеру было приятнее, тем очевиднее было, что катастрофа, которой он ждал, приближается. Уже никого почти из знакомых Пьера не было в городе. Жюли уехала, княжна Марья уехала. Из близких знакомых одни Ростовы оставались; но к ним Пьер не ездил.
В этот день Пьер, для того чтобы развлечься, поехал в село Воронцово смотреть большой воздушный шар, который строился Леппихом для погибели врага, и пробный шар, который должен был быть пущен завтра. Шар этот был еще не готов; но, как узнал Пьер, он строился по желанию государя. Государь писал графу Растопчину об этом шаре следующее:
«Aussitot que Leppich sera pret, composez lui un equipage pour sa nacelle d'hommes surs et intelligents et depechez un courrier au general Koutousoff pour l'en prevenir. Je l'ai instruit de la chose.
Recommandez, je vous prie, a Leppich d'etre bien attentif sur l'endroit ou il descendra la premiere fois, pour ne pas se tromper et ne pas tomber dans les mains de l'ennemi. Il est indispensable qu'il combine ses mouvements avec le general en chef».
[Только что Леппих будет готов, составьте экипаж для его лодки из верных и умных людей и пошлите курьера к генералу Кутузову, чтобы предупредить его.
Я сообщил ему об этом. Внушите, пожалуйста, Леппиху, чтобы он обратил хорошенько внимание на то место, где он спустится в первый раз, чтобы не ошибиться и не попасть в руки врага. Необходимо, чтоб он соображал свои движения с движениями главнокомандующего.]
Возвращаясь домой из Воронцова и проезжая по Болотной площади, Пьер увидал толпу у Лобного места, остановился и слез с дрожек. Это была экзекуция французского повара, обвиненного в шпионстве. Экзекуция только что кончилась, и палач отвязывал от кобылы жалостно стонавшего толстого человека с рыжими бакенбардами, в синих чулках и зеленом камзоле. Другой преступник, худенький и бледный, стоял тут же. Оба, судя по лицам, были французы. С испуганно болезненным видом, подобным тому, который имел худой француз, Пьер протолкался сквозь толпу.
– Что это? Кто? За что? – спрашивал он. Но вниманье толпы – чиновников, мещан, купцов, мужиков, женщин в салопах и шубках – так было жадно сосредоточено на то, что происходило на Лобном месте, что никто не отвечал ему. Толстый человек поднялся, нахмурившись, пожал плечами и, очевидно, желая выразить твердость, стал, не глядя вокруг себя, надевать камзол; но вдруг губы его задрожали, и он заплакал, сам сердясь на себя, как плачут взрослые сангвинические люди. Толпа громко заговорила, как показалось Пьеру, – для того, чтобы заглушить в самой себе чувство жалости.